ヒトのタンパク質コード遺伝子
CACNA1F 識別子 別名 CACNA1F 、AIED、COD3、COD4、CORDX、CORDX3、CSNB2、CSNB2A、CSNBX2、Cav1.4、Cav1.4alpha1、JM8、JMC8、OA2、カルシウム電位依存性チャネルサブユニットalpha1 F 外部ID OMIM : 300110; MGI : 1859639; HomoloGene : 74542; GeneCards : CACNA1F; OMA :CACNA1F - オーソログ 遺伝子位置( マウス ) 染色体 X染色体(マウス) [2] バンド X A1.1|X 3.42 cM 開始 7,473,322 bp [2] 終点 7,501,435 bp [2]
RNA発現 パターン Bgee ヒト マウス (相同遺伝子) 発現部位 顆粒球 小脳右半球 右卵管 右肺 前頭前皮質 横行結腸粘膜 ブロードマン9野 右前頭葉 リンパ節 鼻粘膜嗅球
発現部位 網膜神経層 胚 水晶体上皮 網膜色素上皮 腹部の皮膚 一次視覚野 松果体 接合子 嗅球 気管
その他の参照発現データ
BioGPS その他の参照発現データ
遺伝子オントロジー 分子機能
カルシウムチャネル活性
金属イオン結合
電位依存性イオンチャネル活性
イオンチャネル活性
電位依存性カルシウムチャネル活性
タンパク質結合
高電位依存性カルシウムチャネル活性
細胞成分
膜
細胞膜
細胞体
膜の構成要素
核周膜
光受容体外節
電位依存性カルシウムチャネル複合体
生物学的プロセス
活動電位中の膜脱分極
刺激への反応
T細胞受容体シグナル伝達経路の調節
イオン膜輸送の調節
イオン輸送
視覚知覚に関与する光刺激の検出
T細胞の恒常性
カルシウムイオン膜輸送
膜輸送
カルシウムイオン輸送
視覚知覚
電位依存性カルシウムチャネル活性の負の調節
カルシウムイオン輸入
心臓伝導
出典:Amigo / QuickGO
オーソログ 種 ヒト マウス Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) NM_001256789 NM_001256790 NM_005183
RefSeq (タンパク質) NP_001243718 NP_001243719 NP_005174
場所 (UCSC) Chr X: 49.21 – 49.23 Mb Chr X: 7.47 – 7.5 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
Ca v 1.4は 、カルシウムチャネル、電位依存性、L型、α1Fサブユニット ( CACNA1F )としても知られ 、ヒト 遺伝子 です。 [5]
この遺伝子は、電位依存性カルシウムチャネル複合体を構成する タンパク質 である α1サブユニットファミリーのメンバーをコードしています 。カルシウムチャネルは、膜分極に伴うカルシウムイオンの細胞内への流入を媒介し、α1、α2/δ、β、γサブユニットの1:1:1:1の比率の複合体で構成されています。α1サブユニットは24の膜貫通セグメントを持ち、イオンが細胞内に侵入する孔を形成します。複合体内の各タンパク質には複数の アイソフォーム が存在し、異なる遺伝子によってコードされているか、 転写産物の選択的スプライシングの結果として生じています。ここで説明する遺伝子の選択的転写スプライスバリアントは観察されていますが、完全には特徴付けられていません。この遺伝子の変異は、不完全 X連鎖性先天性夜盲症 2型(CSNB2) を引き起こすことが示されています。 [5]
参照
参考文献
^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000102001 – Ensembl 、2017年5月
^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000031142 – Ensembl 、2017年5月
^ 「ヒトPubMedリファレンス」、 米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター
^ 「マウスPubMedリファレンス」、米国国立医学図書館 、 国立生物工学情報センター
^ ab 「Entrez遺伝子:CACNA1Fカルシウムチャネル、電圧依存性、L型、α1Fサブユニット」
さらに詳しく
Catterall WA、Perez-Reyes E、Snutch TP、Striessnig J (2006).「国際薬理学連合. XLVIII. 電圧依存性カルシウムチャネルの命名法と構造機能関係」. Pharmacol. Rev. 57 ( 4): 411–25 . doi :10.1124/pr.57.4.5. PMID 16382099. S2CID 10386627
Koenekoop RK, Lopez I, den Hollander AI, et al. (2007). 「網膜ジストロフィーおよび機能不全に対する遺伝子検査:利点、ジレンマ、そして解決策」. Clin. Experiment. Ophthalmol . 35 (5): 473–85 . doi :10.1111/j.1442-9071.2007.01534.x. PMID 17651254. S2CID 37487873
Tremblay F, Laroche RG, De Becker I (1995). 「不完全型先天性夜盲症の網膜電図診断」 Vision Res . 35 (16): 2383–93 . doi : 10.1016/0042-6989(95)00006-L . PMID 7571473.
Bergen AA, ten Brink JB, Riemslag F, et al. (1995). 「新規X連鎖先天性夜盲症遺伝子座の局在:RP3型網膜色素変性症遺伝子領域との密接な連鎖」 Hum. Mol. Genet . 4 (5): 931–5 . doi : 10.1093/hmg/4.5.931. PMID 7633454
Hillier LD, Lennon G, Becker M, et al. (1997). 「280,000個のヒト発現配列タグの生成と解析」. Genome Res . 6 (9): 807–28 . doi : 10.1101/gr.6.9.807 . PMID 8889549.
Bergen AA, ten Brink JB, Riemslag F, et al. (1997). 「Xp21.1における明確な先天性定常夜盲症遺伝子座の決定的証拠」. J. Med. Genet . 33 (10): 869–72 . doi : 10.1136/jmg.33.10.869. PMC 1050769. PMID 8933343
Fisher SE, Ciccodicola A, Tanaka K, et al. (1998). 「シナプトフィジン遺伝子座周辺の配列ベースエクソン予測により、ヒト近位Xpにおける新規遺伝子を含む遺伝子豊富な領域が明らかになった」. Genomics . 45 (2): 340–7 . doi :10.1006/geno.1997.4941. hdl : 11858/00-001M-0000-0012-CBE6-7 . PMID 9344658.
Strom TM, Nyakatura G, Apfelstedt-Sylla E, et al. (1998). 「不完全X連鎖性先天性夜盲症におけるL型カルシウムチャネル遺伝子の変異」 Nat. Genet . 19 (3): 260–3 . doi :10.1038/940. PMID 9662399. S2CID 34467174.
Bech-Hansen NT、Naylor MJ、Maybaum TA、他 (1998)。「Xp11.23のカルシウムチャネルα1サブユニット遺伝子の機能喪失変異は、不完全X連鎖性先天性静止夜盲症を引き起こす」 Nat. Genet . 19 (3): 264–7 . doi :10.1038/947. PMID 9662400. S2CID 42480901
Naylor MJ、Rancourt DE、Bech-Hansen NT (2000). 「不完全X連鎖性先天性夜盲症遺伝子のマウス相同遺伝子であるカルシウムチャネル遺伝子Cacna1fの単離と特性解析」 Genomics . 66 (3): 324–7 . doi :10.1006/geno.2000.6204. PMID 10873387
Boycott KM, Pearce WG, Bech-Hansen NT (2000). 「不完全X連鎖性先天性夜盲症およびCACNA1Fの創始者変異を有する患者における臨床的変動」 Can. J. Ophthalmol . 35 (4): 204–13 . doi :10.1016/s0008-4182(00)80031-9. PMID 10900517
Boycott KM、Maybaum TA、Naylor MJ、他 (2001)。「不完全X連鎖性先天性夜盲症36家系で同定された20のCACNA1F変異の概要とスプライスバリアントの特徴」 Hum. Genet . 108 (2): 91–7 . doi :10.1007/s004390100461. PMID 11281458. S2CID 2844173
Wutz K, Sauer C, Zrenner E, et al. (2003). 「不完全型XLCSNBを有する33家系における30の異なるCACNA1F変異とマウス網膜におけるCacna1f発現プロファイリング」. Eur. J. Hum. Genet . 10 (8): 449–56 . doi : 10.1038/sj.ejhg.5200828 . PMID 12111638
Weleber RG (2002). 「乳児および小児期の網膜失明:分子論的視点(フランチェスコエッティ講演)」. Ophthalmic Genet . 23 (2): 71–97 . doi :10.1076/opge.23.2.71.2214. PMID 12187427. S2CID 30741530
Zito I, Allen LE, Patel RJ, et al. (2003). 「英国CSNBX家系におけるCACNA1FおよびNYX遺伝子の変異」 Hum. Mutat . 21 (2): 169. doi :10.1002/humu.9106. PMID 12552565. S2CID 13143864.
Jacobi FK, Hamel CP, Arnaud B, et al. (2003). 「X連鎖性先天性夜盲症の不完全型を有するフランス人家系における新規CACNA1F変異」 Am. J. Ophthalmol . 135 (5): 733–6 . doi :10.1016/S0002-9394(02)02109-8. PMID 12719097
Jalkanen R, Demirci FY, Tyynismaa H, et al. (2003). 「X連鎖進行性錐体桿体ジストロフィーの新たな遺伝子座」. J. Med. Genet . 40 (6): 418–23 . doi :10.1136/jmg.40.6.418 . PMC 1735490. PMID 12807962
Koschak A, Reimer D, Walter D, et al. (2003). 「CaV1.4α1サブユニットは、Ca2+依存性不活性化を欠き、ジヒドロピリジン感受性L型Ca2+チャネルを緩徐に不活性化する」 J. Neurosci . 23 (14): 6041–9 . doi : 10.1523/JNEUROSCI.23-14-06041.2003 . PMC 6740341. PMID 12853422
中村正之、伊藤誠、Piao CH、他 (2003). 「日本人家系におけるCACNA1F変異に関連する網膜および視神経乳頭萎縮」 Arch. Ophthalmol . 121 (7): 1028–33 . doi :10.1001/archopht.121.7.1028. PMID 12860808.
Kotturi MF、Carlow DA、Lee JC、他 (2004). 「Tリンパ球における電位依存性カルシウムチャネルの同定と機能的特徴づけ」 J. Biol. Chem . 278 (47): 46949–60 . doi : 10.1074/jbc.M309268200 . PMID 12954628.
外部リンク
X連鎖先天性夜盲症に関するGeneReviews/NCBI/NIH/UWエントリ
米国国立医学図書館 医学件名標目 (MeSH)におけるCACNA1F+タンパク質、+ヒト
この記事には、パブリックドメイン である 米国国立医学図書館 のテキストが組み込まれています 。