カルパイン-9

CAPN9
利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 1ZIV、2P0R
識別子
エイリアス	CAPN9、GC36、nCL-4、カルパイン9
外部ID	オミム: 606401 ; MGI : 1920897 ;ホモロジーン: 38208 ;ジーンカード: CAPN9 ; OMA : CAPN9 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 染色体1（ヒト）[ 1 ] バンド 1q42.2 始める 230,747,384 bp [ 1 ] 終わり 230,802,003 bp [ 1 ]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 8番染色体（マウス）[ 2 ] バンド 8|8 E2 始める 1億2530万2850bp [ 2 ] 終わり 1億2534万5470bp [ 2 ]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 C1セグメント 直腸 横行結腸粘膜 胃の体 胃粘膜 回腸粘膜 鼻粘膜の嗅覚領域 気管支上皮細胞 膵管細胞 右肺 上位の表現 幽門洞 胃上皮 胃の粘液細胞 腰椎神経節 胚 十二指腸 左結腸 空腸 腸絨毛 桑実胚 より多くの参照表現データ バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 カルシウムイオン結合 ペプチダーゼ活性 システイン型ペプチダーゼ活性 加水分解酵素活性 金属イオン結合 カルシウム依存性システイン型エンドペプチダーゼ活性 細胞成分 細胞内解剖学的構造 細胞質 細胞成分 生物学的プロセス 消化 タンパク質分解 サルコメア組織 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 10753 73647 アンサンブル ENSG00000135773 ENSMUSG00000031981 ユニプロット O14815 Q9D805 RefSeq (mRNA) NM_006615 NM_016452 NM_001319676 NM_023709 RefSeq（タンパク質） NP_001306605 NP_006606 NP_057536 NP_076198 場所（UCSC） 1 章: 230.75 – 230.8 Mb 8番染色体: 125.3 – 125.35 Mb PubMed検索 [ 3 ] [ 4 ]
ウィキデータ
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カルパイン9は、ヒトではCAPN9遺伝子によってコードされるタンパク質である。^{[ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]}

カルパインは、カルシウム依存性システインプロテアーゼの普遍的でよく保存されたファミリーです。カルパインタンパク質は、不変の小サブユニットと可変の大サブユニットからなるヘテロ二量体です。大サブユニットはシステインプロテアーゼドメインを有し、両方のサブユニットはカルシウム結合ドメインを有しています。カルパインは、カルシウム流入と酸化ストレスによって活性化されることから、神経変性プロセスへの関与が示唆されています。この遺伝子によってコードされるタンパク質は、主に胃と小腸で発現しており、消化管において特殊な機能を有する可能性があります。この遺伝子は胃癌と関連していると考えられています。この遺伝子には、異なるアイソフォームをコードする複数の選択的スプライシング転写バリアントが見つかっています。^{[ 7 ]}

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000135773 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000031981 – Ensembl、2017年5月
3. 「ヒトPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. 「マウスPubMedリファレンス：」米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. Lee HJ, Sorimachi H, Jeong SY, Ishiura S, Suzuki K (1998年5月). 「消化管で優位に発現する新規組織特異的カルパインの分子クローニングと特性解析」. Biol Chem . 379 (2): 175– 184. doi : 10.1515 / bchm.1998.379.2.175 . PMID 9524069. S2CID 37483841 .  
6. 吉川雄三、向井秀夫、日野史人、浅田健、加藤郁夫 (2000年7月). 「胃癌で発現低下を示す2つの新規遺伝子の単離」. Jpn J Cancer Res . 91 (5): 459–63 . doi : 10.1111/j.1349-7006.2000.tb00967.x . PMC 5926377. PMID 10835488 .  
7. 「Entrez Gene: CAPN9 カルパイン9」。

さらに読む

• Huang Y, Wang KK (2001). 「カルパインファミリーとヒト疾患」. Trends in Molecular Medicine . 7 (8): 355– 362. doi : 10.1016/S1471-4914(01)02049-4 . PMID  11516996 .
• 鈴木 健、反町 秀、吉澤 剛、他 (1996). 「カルパイン：新規ファミリーメンバー、活性化、そして生理機能」Biol. Chem. Hoppe-Seyler . 376 (9): 523–9 . doi : 10.1515/bchm3.1995.376.9.523 . PMID  8561910 .
• Davis TL, Walker JR, Finerty PJ, et al. (2007). 「ヒトカルパイン1および9の結晶構造は、多様な作用機序と自己阻害を示唆している」J. Mol. Biol . 366 (1): 216– 229. doi : 10.1016/j.jmb.2006.11.037 . PMID  17157313 .
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」 . Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 16903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241. PMID  12477932 .
• Lee HJ, Tomioka S, Kinbara K, et al. (1999). 「バキュロウイルス系で発現したヒト消化管特異的カルパインnCL-4の特性解析」Arch. Biochem. Biophys . 362 (1): 22– 31. doi : 10.1006/abbi.1998.1021 . PMID  9917325 .

外部リンク

• UCSC ゲノム ブラウザのヒトCAPN9ゲノムの位置とCAPN9遺伝子の詳細ページ。
• ペプチダーゼとその阻害剤に関するMEROPSオンラインデータベース：C02.006
• PDBe-KBのUniProt : O14815 (ヒトカルパイン-9 (CAPN9))のPDBで利用可能なすべての構造情報の概要。