| コンテンツ | |
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| 説明 | β-ラクタマーゼの特性に基づいて注釈を付けたβ-ラクタマーゼデータベース |
キャプチャされたデータの種類 | β-ラクタマーゼ |
| 微生物 | 細菌 |
| 接触 | |
| 主な引用 | PMID 25475113 |
| アクセス | |
| ウェブサイト | 14.139.227.92/mkumar/lactamasedb |
| その他 | |
| ブックマーク可能な エンティティ | はい |
CBMAR (包括的β-ラクタマーゼ分子アノテーションリソース) は、細菌の新規ベータラクタマーゼ遺伝子およびタンパク質のアノテーションと発見に焦点を当てたデータベースです。[1]ベータラクタマーゼは、アンブラー分類システムを使用して CBMAR で特徴付けられます。[2] CBMAR は、ベータラクタマーゼをクラス A、B、C、および D に整理します。これらはさらに、(i) 配列変異性、(ii) 抗生物質耐性プロファイル、(iii) 阻害剤感受性、(iv) 活性部位、(v) ファミリーフィンガープリント、(vi) 変異プロファイル、(vii) バリアント、(viii) 遺伝子の位置、(ix) 系統樹などにより分類されます。CBMAR データベースの主なソースは、GenBank と Uniprot です。[3] CBMAR は、 MySQL Ver 14.14を搭載したApache HTTP Server 2.2.17上に構築され、 Ubuntu 11.04 Linuxプラットフォームでホストされています。
参照
参考文献
- ^ Srivastava, Abhishikha; Singhal, Neelja; Goel, Manisha; Virdi, Jugsharan Singh; Kumar, Manish (2014-01-01). 「CBMAR：包括的なβ-ラクタマーゼ分子アノテーションリソース」.データベース. 2014 bau111. doi :10.1093/database/bau111. ISSN 1758-0463 . PMC 4255060. PMID 25475113
- ^ Ambler, RP (1980-05-16). 「<latex>$\beta$</latex>-ラクタマーゼの構造」. Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences . 289 (1036): 321– 331. doi :10.1098/rstb.1980.0049. ISSN 0962-8436. PMID 6109327.
- ^ UniProtコンソーシアム (2011年11月18日). 「Universal Protein Resource (UniProt)におけるタンパク質空間の再編成」. Nucleic Acids Research . 40 (D1): D71 – D75 . doi :10.1093/nar/gkr981. ISSN 0305-1048. PMC 3245120. PMID 22102590 .
