CCNDBP1

CCNDBP1
利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 3AY5
識別子
エイリアス	CCNDBP1、DIP1、GCIP、HHM、サイクリンD1結合タンパク質1
外部ID	オミム：607089; MGI : 109595;ホモロジーン: 7826;ジーンカード：CCNDBP1; OMA :CCNDBP1 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 15番染色体（ヒト）[1] バンド 15q15.2 始める 43,185,118 bp [1] 終わり 43,197,177 bp [1]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 染色体2（マウス）[2] バンド 2 E5|2 60.37 cM 始める 120,838,884 bp [2] 終わり 120,847,385 bp [2]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 海綿骨 回腸粘膜 右心房の心筋組織 アキレス腱 骨髄 右卵管 血 左心室の心筋 胎盤 腕の皮膚 上位の表現 血 接合子 二次卵母細胞 一次卵母細胞 網膜の神経層 顆粒球 胎児肝造血前駆細胞 小脳皮質 小脳虫部 小脳葉 より多くの参照表現データ バイオGPS 該当なし
遺伝子オントロジー 分子機能 タンパク質結合 細胞成分 核 細胞質 核質 生物学的プロセス 細胞周期の調節 細胞周期 出典：Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 23582 17151 アンサンブル ENSG00000166946 ENSMUSG00000023572 ユニプロット O95273 Q3TVC7 RefSeq (mRNA) NM_012142 NM_037370 NM_010761 NM_001355127 RefSeq（タンパク質） NP_036274 NP_034891 NP_001342056 場所（UCSC） 15章: 43.19 – 43.2 Mb 2番目の文字: 120.84 – 120.85 Mb PubMed検索 [3] [4]
ウィキデータ
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サイクリンD1結合タンパク質1は、ヒトではCCNDBP1遺伝子によってコードされるタンパク質である。^{[5] [6]}

この遺伝子は、その遺伝子産物が、免疫細胞シグナル伝達に重要な白血球特異的アダプタータンパク質であるGrap2と相互作用することで同定されました。この遺伝子によってコードされるタンパク質は、サイクリンDと相互作用することが示されました。この遺伝子を細胞に導入すると、サイクリンD依存性タンパク質キナーゼによるRb遺伝子産物のリン酸化が減少し、E2F1を介した転写活性が阻害されることが報告されています。このタンパク質は、ヘリックス・ループ・ヘリックスタンパク質E12とも相互作用することが確認されており、肝臓特異的遺伝子発現の負の調節因子であると考えられています。異なるアイソフォームをコードする2つの選択的スプライシングバリアントが報告されています。^[6]

相互作用

CCNDBP1はGRAP2 ^[7]およびサイクリンD1 ^[5]と相互作用することが示されている。

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000166946 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000023572 – Ensembl、2017年5月
3. 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. Xia C, Bao Z, Tabassam F, Ma W, Qiu M, Hua S, Liu M (2000年8月). 「新規ヒトgrap2およびサイクリンD相互作用タンパク質GCIPは、E2Fを介した転写活性を制御する」J Biol Chem . 275 (27): 20942–8 . doi : 10.1074/jbc.M002598200 . PMID  10801854.
6. "Entrez Gene: CCNDBP1 サイクリン D 型結合タンパク質 1".
7. Xia C, Bao Z, Tabassam F, Ma W, Qiu M, Hua S, Liu M (2000年7月). 「新規ヒトgrap2およびサイクリンD相互作用タンパク質GCIPはE2Fを介した転写活性を制御する」J. Biol. Chem . 275 (27). 米国: 20942–8 . doi : 10.1074/jbc.M002598200 . ISSN  0021-9258. PMID  10801854.

さらに読む

• Ma W, Xia X, Stafford LJ, et al. (2006). 「トランスジェニックマウスにおけるGCIPの発現は化学的肝発癌感受性を低下させる」Oncogene . 25 (30): 4207–16 . doi :10.1038/sj.onc.1209450. PMID  16501603. S2CID  7442061.
• 大月 剛志、太田 剛志、西川 剛志、他 (2007). 「シグナル配列とキーワードトラップを用いたin silicoによる、オリゴキャップcDNAライブラリーからの分泌タンパク質または膜タンパク質をコードする全長ヒトcDNAの選択」DNA Res . 12 (2): 117–26 . doi : 10.1093/dnares/12.2.117 . PMID  16303743.
• Rual JF, Venkatesan K, Hao T, et al. (2005). 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップの構築に向けて」Nature . 437 (7062): 1173–8 . Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241. PMID  12477932 .
• Chang MS, Chen CY, Yeh HI, et al. (2003). 「マウスmp29遺伝子のクローニング、発現、およびゲノム構成」. Biochem. Biophys. Res. Commun . 299 (2): 241–6 . doi :10.1016/S0006-291X(02)02605-0. PMID  12437976.
• Dgany O, Avidan N, Delaunay J, et al. (2003). 「先天性赤血球異形成貧血I型はコダニン-1の変異によって引き起こされる」Am. J. Hum. Genet . 71 (6): 1467–74 . doi :10.1086/344781. PMC 378595.  PMID 12434312  .
• 寺井 聡、青木 浩、芦田 健、Thorgeirsson SS (2000). 「maidのヒトホモログ：肝臓特異的遺伝子発現に関連する優性阻害性ヘリックス-ループ-ヘリックスタンパク質」.肝臓学. 32 (2): 357–66 . doi :10.1053/jhep.2000.9092. PMID  10915743. S2CID  33459194.
• 山田 誠、飯田 剛、田端 剛、他 (2000). 「ラットにおけるアルコール性脂肪肝は虚血再灌流後の好中球ケモカイン産生と肝壊死を特異的に誘導する」.肝臓学. 32 (2): 278–88 . doi : 10.1053/jhep.2000.9604 . PMID  10915734.
• Yao Y, Doki Y, Jiang W, et al. (2000). 「Idファミリータンパク質に関連する新規タンパク質DIP1のクローニングと特性解析」Exp. Cell Res . 257 (1): 22– 32. doi : 10.1006/excr.2000.4884 . PMID  10854051.
• 鈴木雄三、中川吉智、丸山健、他 (1997). 「全長エンリッチドcDNAライブラリーおよび5'末端エンリッチドcDNAライブラリーの構築と特性解析」. Gene . 200 ( 1–2 ): 149–56 . doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID  9373149.
• 丸山 憲治, 菅野 誠 (1994). 「オリゴキャッピング：真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置換する簡便法」.遺伝子. 138 ( 1–2 ): 171–4 . doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.

外部リンク

• UCSC ゲノム ブラウザのヒト CCNDBP1 ゲノムの位置と CCNDBP1 遺伝子の詳細ページ。