セルSR3

セルSR3
識別子
エイリアス	CELSR3、CDHF11、EGFL1、FMI1、HFMI1、MEGF2、RESDA1、ADGRC3、カドヘリンEGF LAG 7回通過G型受容体3
外部ID	オミム：604264; MGI : 1858236;ホモロジーン: 1077;ジーンカード：CELSR3; OMA :CELSR3 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 染色体3（ヒト）[1] バンド 3p21.31 始める 48,636,463 bp [1] 終わり 48,662,886 bp [1]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 9番染色体（マウス）[2] バンド 9|9 F2 始める 108,703,519 bp [2] 終わり 108,730,168 bp [2]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 小脳の右半球 神経節隆起 下垂体 小脳の傍小葉 ブロードマン領域10 小脳虫部 下垂体前葉 右前頭葉 中心後回 海馬固有部I領域 上位の表現 小脳皮質 視床下部 嗅球 神経節隆起 一次視覚野 上前頭回 神経軸の線条体 顆粒球 網膜の層 網膜の神経層 より多くの参照表現データ バイオGPS 該当なし
遺伝子オントロジー 分子機能 カルシウムイオン結合 Gタンパク質共役受容体の活性 信号伝達活性 タンパク質結合 膜貫通シグナル伝達受容体の活性 細胞成分 膜の不可欠な構成要素 膜 細胞膜 生物学的プロセス タンパク質リン酸化の調節 ドーパミンニューロンの軸索誘導 Gタンパク質共役受容体シグナル伝達経路 セロトニンニューロンの軸索誘導 ニューロンの移動 タンパク質の局在の制御 多細胞生物の発達 Wntシグナル伝達経路、平面細胞極性経路 細胞表面受容体シグナル伝達経路 細胞接着 軸索線維束収縮 シグナル伝達 細胞膜接着分子を介した同種親和性細胞接着 軸索誘導に関与する平面細胞極性経路 繊毛アセンブリ 細胞間接着 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 1951 107934 アンサンブル ENSG00000008300 ENSMUSG00000023473 ユニプロット Q9NYQ7 Q91ZI0 RefSeq (mRNA) NM_001407 NM_080437 NM_001359572 NM_001359573 RefSeq（タンパク質） NP_001398 NP_536685 NP_001346501 NP_001346502 場所（UCSC） 3章: 48.64 – 48.66 Mb 9章: 108.7 – 108.73 Mb PubMed検索 [3] [4]
ウィキデータ
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カドヘリンEGF LAG 7回通過G型受容体3は、ヒトではCELSR3遺伝子によってコードされるタンパク質である。^{[5] [6]}

この遺伝子によってコードされるタンパク質は、カドヘリンスーパーファミリーに属するフラミンゴサブファミリーのメンバーです。フラミンゴサブファミリーは、カテニンと相互作用しない非古典型カドヘリンで構成されています。フラミンゴカドヘリンは細胞膜に局在し、細胞外ドメインに9つのカドヘリンドメイン、7つの上皮成長因子様リピート、および2つのラミニンA G型リピートを有しています。また、このサブファミリー特有の特徴として、7つの膜貫通ドメインも有しています。これらのタンパク質は接触を介したコミュニケーションに関与する受容体であると仮定されており、カドヘリンドメインはホモフィリック結合領域として機能し、EGF様ドメインは細胞接着および受容体-リガンド相互作用に関与しています。この特定のメンバーの具体的な機能は未解明です。^[6]

参照

• フラミンゴ（タンパク質）

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000008300 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000023473 – Ensembl、2017年5月
3. 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. 中山 正之、中島 大輔、永瀬 剛、野村 暢、関 直、小原 修 (1998年9月). 「モチーフトラップスクリーニングによる複数のEGF様モチーフを有する高分子タンパク質の同定」.ゲノミクス. 51 (1): 27– 34. doi :10.1006/geno.1998.5341. PMID  9693030.
6. "Entrez Gene: CELSR3 カドヘリン、EGF LAG 7 パス G 型受容体 3 (フラミンゴホモログ、ショウジョウバエ)".

さらに読む

• Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). 「正規化と減算：遺伝子発見を促進する2つのアプローチ」Genome Res . 6 (9): 791– 806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID  8889548.
• Wu Q, Maniatis T (1999). 「ヒト神経カドヘリン様細胞接着遺伝子の大ファミリーの驚くべき構成」. Cell . 97 (6): 779–90 . doi : 10.1016/S0092-8674(00)80789-8 . PMID  10380929. S2CID  6014717.
• Wu Q, Maniatis T (2000). 「複数のエクトドメインをコードする大きなエクソンは、プロトカドヘリン遺伝子の特徴である」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 97 (7): 3124–9 . doi : 10.1073/pnas.060027397 . PMC  16203 . PMID  10716726.
• Formstone CJ, Barclay J, Rees M, Little PF (2000). 「マウスにおけるCelsr2およびCelsr3の染色体局在；Celsr3は9番染色体上のtippy（先端）致死変異体の候補である」Mamm. Genome . 11 (5): 392–4 . doi :10.1007/s003350010073. PMID  10790539. S2CID  21333332.
• 中山 正之、菊野 亮、小原 修 (2003). 「巨大タンパク質間のタンパク質間相互作用：長鎖cDNAからなる機能分類ライブラリーを用いた2ハイブリッドスクリーニング」Genome Res . 12 (11): 1773–84 . doi :10.1101/gr.406902. PMC 187542.  PMID 12421765  .
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241. PMID  12477932 .
• Bjarnadóttir TK, Fredriksson R, Höglund PJ, et al. (2005). 「ヒトおよびマウスにおけるGタンパク質共役受容体の接着ファミリーのレパートリー」. Genomics . 84 (1): 23– 33. doi :10.1016/j.ygeno.2003.12.004. PMID  15203201.

外部リンク

• UCSC ゲノム ブラウザのヒト CELSR3 ゲノムの位置と CELSR3 遺伝子の詳細ページ。

この記事には、パブリック ドメインである米国国立医学図書館のテキストが組み込まれています。