CDK5RAP2

CDK5RAP2
識別子
別名CDK5RAP2、C48、Cep215、MCPH3、CDK5調節サブユニット関連タンパク質2
外部IDOMIM : 608201 ; MGI : 2384875 ; HomoloGene : 49533 ; GeneCards : CDK5RAP2 ; OMA : CDK5RAP2 - オーソログ
相同遺伝子
種ヒトマウス
Entrez

55755

214444

アンサンブル

ENSG00000136861

ENSMUSG00000039298

ユニプロット

Q96SN8

P68254 Q8K389

RefSeq (mRNA)

NM_001011649 NM_001272039 NM_018249

NM_145990 NM_001313762

RefSeq（タンパク質）

NP_001011649 NP_001258968 NP_060719

NP_035869 NP_001300691 NP_666102

場所（UCSC）9番地：120.39～120.58 Mb4番地：70.14～70.33 Mb
PubMed検索[ 3 ][ 4 ]
ウィキデータ
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CDK5調節サブユニット関連タンパク質2は、ヒトではCDK5RAP2遺伝子によってコードされるタンパク質です。中心体からの微小管の形成と安定性に重要な役割を担っており[ 5 ]、ヒトの男性の脳の大きさの変動と関連していることが判明しています[ 6 ] 。この遺伝子には複数の転写バリアントが存在しますが、全長が決定されているのは2つだけです[ 7 ] [ 8 ]

CDK5RAP2はショウジョウバエのタンパク質セントロソミン（CNN）[ 9 ]と相同性があり、哺乳類ではミオメガリンと相同性があり、ミオメガリンはオルドヴァイドメインを含み、このドメインはヒトの脳の大きさの進化に関与している。[ 10 ] [ 11 ]

機能

CDK5RAP2は、中心体からの微小管の適切な形成、固定、および配向に必要です。γ-チューブリンリング複合体（γTuRC）と結合し、γTuRCが中心体に付着するために必要です。[ 5 ] CDK5RAP2はまた、 CDK5の活性化サブユニットとして機能するCDK5R1の一種であるp25にも結合し、神経分化の調節に関与しています。したがって、CDK5RAP2は神経分化において役割を果たしています。[ 8 ] CDK5RAP2は、細胞性粘菌（Dictyostelium）の中心体コロナにおける足場タンパク質としても必要です。[ 12 ]

臨床的意義

ヒトの脳の大きさの変動

MRI研究により、CDK5RAP2遺伝子のヒト共通変異と脳構造との関連が実証された。より具体的には、いくつかの一塩基多型（SNP）と脳皮質表面積および脳総容積との関連が見出された。これらの関連は男性被験者にのみ見られ、すべてのSNPは遺伝子の最後の7つのイントロンまたは下流に位置していた。これらの遺伝子座の機能的意義はまだ分かっていない。しかし、調節要素に近い位置にあることを考えると、遺伝子調節に関与している可能性があり、これは脳構造の共通変異がタンパク質構造ではなく遺伝子調節の違いと関連している可能性を示唆しており、他の複雑なヒト形質における知見と一致している。[ 6 ] CDK5RAP2はミオメガリンの相同遺伝子であり、哺乳類ではオルドヴァイドメインを含む。オルドヴァイドメインはヒト特異的な重複を持つドメインであり、ヒトの脳サイズの進化に関与していると考えられている。[ 10 ] [ 11 ]

常染色体劣性原発性小頭症

CDK5RAP2の変異は常染色体劣性原発性小頭症3型を引き起こす。 [ 13 ] [ 5 ]

相互作用

CDK5RAP2はCDK5R1 [ 14 ]およびペリセントリン（PCTN）[ 8 ]と相互作用することが示されています

歴史

この遺伝子は2000年に発見され[ 15 ]、2007年に初めて特徴づけられました[ 5 ]

参考文献

  1. ^ a b c GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000136861 – Ensembl、2017年5月
  2. ^ a b c GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000039298 – Ensembl、2017年5月
  3. ^ 「ヒトPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
  4. ^ 「マウスPubMedリファレンス：」米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
  5. ^ a b c d Fong KW, Choi YK, Rattner JB, Qi RZ (2008年1月). 「CDK5RAP2はγ-チューブリンリング複合体の中心体への付着において機能するperi-centriolarタンパク質である」 . Molecular Biology of the Cell . 19 (1): 115– 25. doi : 10.1091/mbc.E07-04-0371 . PMC 2174194. PMID 17959831 .  
  6. ^ a b Rimol LM, Agartz I, Djurovic S, Brown AA, Roddey JC, Kähler AK, 他 (2010年1月). 「小頭症遺伝子の共通変異と脳構造の性別依存的関連性」 .米国科学アカデミー紀要. 107 (1 ) : 384–8 . Bibcode : 2010PNAS..107..384R . doi : 10.1073/pnas.0908454107 . PMC 2806758. PMID 20080800 .  
  7. ^ Ching YP, Qi Z, Wang JH (2000年1月). 「3つの新規神経細胞Cdk5活性化因子結合タンパク質のクローニング」. Gene . 242 ( 1– 2): 285– 94. doi : 10.1016/S0378-1119(99)00499-0 . PMID 10721722 . 
  8. ^ a b c「Entrez Gene: CDK5RAP2 CDK5調節サブユニット関連タンパク質2」。
  9. ^ Barr AR, Kilmartin JV, Gergely F (2010年4月). 「CDK5RAP2は中心体から紡錘体極への接着とDNA損傷応答において機能する」 . The Journal of Cell Biology . 189 (1): 23– 39. doi : 10.1083/jcb.200912163 . PMC 2854379. PMID 20368616 .  
  10. ^ a b Dumas L, Kim YH, Karimpour-Fard A, Cox M, Hopkins J, Pollack JR, Sikela JM (2007年9月). 「ヒトと霊長類の進化における6000万年にわたる遺伝子コピー数変異」 . Genome Research . 17 (9): 1266–77 . doi : 10.1101/gr.6557307 . PMC 1950895. PMID 17666543 .  
  11. ^ a b O'Bleness MS, Dickens CM, Dumas LJ, Kehrer-Sawatzki H, Wyckoff GJ, Sikela JM (2012年9月). 「DUF1220タンパク質ドメインの進化史とゲノム構成」 . G3 . 2 (9): 977–86 . doi : 10.1534 / g3.112.003061 . PMC 3429928. PMID 22973535 .  
  12. ^ Pitzen V, Askarzada S, Gräf R, Meyer I (2018年4月). 「CDK5RAP2は細胞性粘菌の中心体コロナの必須の足場タンパク質である」 . Cells . 7 ( 4): 32. doi : 10.3390/cells7040032 . PMC 5946109. PMID 29690637 .  
  13. ^ 「OMIMエントリ - # 604804 - 小頭症3、原発性、常染色体劣性；MCPH3」 www.omim.org . 2020年1月6日閲覧。
  14. ^ Wang X, Ching YP, Lam WH, Qi Z, Zhang M, Wang JH (2000年10月). 「神経細胞Cdk5活性化因子における共通タンパク質会合領域の同定」 . The Journal of Biological Chemistry . 275 (41): 31763–9 . doi : 10.1074/jbc.M004358200 . PMID 10915792 . 
  15. ^ Ching YP, Qi Z, Wang JH (2000年1月). 「3つの新規神経細胞Cdk5活性化因子結合タンパク質のクローニング」. Gene . 242 ( 1– 2): 285– 94. doi : 10.1016/S0378-1119(99)00499-0 . PMID 10721722 . 

さらに詳しい情報

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