CHD7

CHD7
利用可能な構造
PDBオーソログ検索: PDBe RCSB
識別子
エイリアスCHD7、CRG、HH5、IS3、KAL5、クロモドメインヘリカーゼDNA結合タンパク質7
外部IDオミム: 608892 ; MGI : 2444748 ;ホモロジーン: 19067 ;ジーンカード: CHD7 ; OMA : CHD7 - オルソログ
オーソログ
人間ねずみ
エントレズ
アンサンブル
ユニプロット
RefSeq (mRNA)

NM_017780 NM_001316690 NM_017783

NM_001033395 NM_001081417 NM_001277149 NM_00135538​​2

RefSeq(タンパク質)

NP_001303619 NP_060250

NP_001264078 NP_001342311

場所(UCSC)8章: 60.68 – 60.87 Mb4章: 8.69 – 8.87 Mb
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ウィキデータ
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クロモドメインヘリカーゼDNA結合タンパク質7は、ATP依存性の「クロマチン」または「ヌクレオソーム」リモデリング因子であり[ 5 ]、ヒトではCHD7遺伝子によってコードされています。[ 6 ] [ 7 ]

CHD7は、ショウジョウバエのトリソラックスグループタンパク質Kismetと相同性のあるATP依存性クロマチンリモデリング因子です。[ 8 ] CHD7の変異はCHARGE症候群と関連しています。[ 9 ]このタンパク質は、ATP依存性クロマチンリモデリング複合体のより大きなグループであるCHDサブファミリーに属しています。

臨床

この遺伝子の変異はCHARGE症候群と関連している。[ 9 ] [ 10 ] [ 11 ]

参考文献

  1. ^ a b c GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000171316Ensembl、2017年5月
  2. ^ a b c GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000041235Ensembl、2017年5月
  3. ^ 「ヒトPubMedリファレンス:」米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター
  4. ^ 「マウスPubMedリファレンス:」米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター
  5. ^ Bouazoune, K; Kingston, RE (2012年11月20日). 「CHD7タンパク質によるクロマチンリモデリングは、ヒト発達障害を引き起こす変異によって阻害される」 . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 109 (47): 19238–43 . Bibcode : 2012PNAS..10919238B . doi : 10.1073/pnas.1213825109 . PMC 3511097. PMID 23134727 .  
  6. ^永瀬 剛志、菊野 亮、石川 紀雄、広澤 正之、小原 修 (2000年2月). 「未同定ヒト遺伝子のコード配列の予測. XVI. 脳由来の新規cDNAクローン150個(in vitroで巨大タンパク質をコードする)の完全配列」 . DNA Research . 7 (1): 65– 73. doi : 10.1093 / dnares/7.1.65 . PMID 10718198. S2CID 22402957 .  
  7. ^ 「Entrez Gene:クロモドメインヘリカーゼDNA結合タンパク質7」
  8. ^ Bajpai R, Chen DA, Rada-Iglesias A, Zhang J, Xiong Y, Helms J, Chang CP, Zhao Y, Swigut T, Wysocka J (2010年2月). 「CHD7はPBAFと連携して多能性神経堤形成を制御する」 . Nature . 463 (7283): 958–62 . Bibcode : 2010Natur.463..958B . doi : 10.1038/ nature08733 . PMC 2890258. PMID 20130577 .  
  9. ^ a b Vissers LE、van Ravenswaaij CM、Admiraal R、Hurst JA、de Vries BB、Janssen IM、van der Vliet WA、Huis EH、de Jong PJ、ハメル BC、Schoenmakers EF、Brunner HG、Veltman JA、van Kessel AG (2004 年 9 月)。「クロモドメイン遺伝子ファミリーの新しいメンバーにおける変異は、CHARGE 症候群を引き起こす」自然遺伝学36 (9): 955– 7.土井: 10.1038/ng1407PMID 15300250 
  10. ^ララニ、シーマ R;サフィウラ、アルサラン M;ファーンバック、スーザン D;ハルティアンユン、カリン G;他。 (2006 年 2 月)。「CHARGE症候群を有する110人のCHD7変異のスペクトルと遺伝子型と表現型の相関」アメリカ人類遺伝学ジャーナル78 (2): 303–14 .土井: 10.1086/500273PMC 1380237PMID 16400610  
  11. ^ Zentner, Gabriel E; Layman, Wanda S; Martin, Donna M; Scacheri, Peter C (2010年3月). 「CHARGE症候群におけるCHD7変異の分子的および表現型的側面」. American Journal of Medical Genetics Part A. 152A ( 3): 674–86 . doi : 10.1002/ajmg.a.33323 . PMC 2918278. PMID 20186815 .  

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