CNOT4

CNOT4
利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 1E4U、1UR6
識別子
エイリアス	CNOT4、CLONE243、NOT4、NOT4H、CCR4-NOT転写複合体サブユニット4
外部ID	オミム: 604911 ; MGI : 1859026 ;ホモロジーン: 40870 ;ジーンカード: CNOT4 ; OMA : CNOT4 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 7番染色体（ヒト）[ 1 ] バンド 7q33 始める 1億3536万1795bp [ 1 ] 終わり 135,510,127 bp [ 1 ]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 6番染色体（マウス）[ 2 ] バンド 6|6 B1 始める 34,999,000 bp [ 2 ] 終わり 35,110,659 bp [ 2 ]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 口腔粘膜細胞 アキレス腱 睾丸 腓腹筋 壁側胸膜 脳梁 内淡蒼球 腓骨神経 内皮細胞 太ももの筋肉 上位の表現 性器結節 吻側回遊流 胚の尾 接合子 球形嚢 一次卵母細胞 二次卵母細胞 耳板 窩 耳小胞 より多くの参照表現データ バイオGPS 該当なし
遺伝子オントロジー 分子機能 ユビキチンタンパク質転移酵素活性 タンパク質結合 核酸結合 金属イオン結合 トランスフェラーゼ活性 RNA結合 細胞成分 細胞質 細胞質 CCR4-NOT複合体 核 生物学的プロセス タンパク質のユビキチン化 核転写されたmRNAポリ(A)テールの短縮 タンパク質の自己ユビキチン化 DNA損傷応答、p53クラスメディエーターによるシグナル伝達により細胞周期停止に至る 核転写されたmRNAの分解過程、脱アデニル化依存性の分解 ユビキチン依存性タンパク質分解プロセス 巨核球分化の制御 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 4850 53621 アンサンブル ENSG00000080802 ENSMUSG00000038784 ユニプロット O95628 Q8BT14 RefSeq (mRNA) NM_001008225 NM_001190847 NM_001190848 NM_001190849 NM_001190850 NM_013316 NM_001393370 NM_001393371 NM_001393372 NM_001393373 NM_001393374 NM_001393375 NM_001164411 NM_001164412 NM_001164413 NM_001164414 NM_016877 RefSeq（タンパク質） NP_001008226 NP_001177776 NP_001177777 NP_001177778 NP_001177779 NP_037448 NP_001157883 NP_001157884 NP_001157885 NP_001157886 NP_058573 場所（UCSC） 7章: 135.36 – 135.51 Mb 6章35～35.11MB PubMed検索 [ 3 ] [ 4 ]
ウィキデータ
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CCR4-NOT転写複合体サブユニット4は、ヒトではCNOT4遺伝子によってコードされるタンパク質である。^{[ 5 ]}

関数

この遺伝子によってコードされるタンパク質は、CCR4-Not複合体のサブユニットであり、包括的な転写調節因子であり、脱アデニラーゼである。コードされるタンパク質はCNOT1と相互作用し、ユビキチンリガーゼ活性を有する。この遺伝子には、異なるアイソフォームをコードする複数の転写バリアントが見つかっている。[RefSeq提供、2010年7月]。CNOT4に関連する疾患には、アデノイド炎などがある。^{[ 6 ]}

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000080802 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000038784 – Ensembl、2017年5月
3. 「ヒトPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. 「マウスPubMedリファレンス：」米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. 「Entrez Gene：CCR4-NOT転写複合体、サブユニット4」。
6. 「CNOT4遺伝子 - GeneCards | CNOT4タンパク質 | CNOT4抗体」 www.genecards.org . 2019年6月21日閲覧。

さらに読む

• グロンホルム J、カウスティオ M、ミリマキ H、カリオ J、サーリケット J、クロンハム J、ヴァランヌ S、シルヴェンノイネン O、ラメット M (2012 年 3 月)。「Not4 は、ショウジョウバエおよびヒト細胞における JAK/STAT 経路依存性の遺伝子発現を増強します。 」 FASEBジャーナル。26 (3): 1239–50 .土井: 10.1096/fj.11-195875。PMID  22159038。S2CID  25618632。
• Winkler GS, Albert TK, Dominguez C, Legtenberg YI, Boelens R, Timmers HT (2004年3月). 「特異性を変化させたユビキチン結合酵素/ユビキチンタンパク質リガーゼペア」. Journal of Molecular Biology . 337 (1): 157– 65. doi : 10.1016/j.jmb.2004.01.031 . PMID  15001359 .
• ラウ NC、コルクマン A、ファン シェイク FM、モルダー KW、パイナッペル WW、ヘック AJ、ティマーズ HT (2009 年 9 月)。「ヒト Ccr4-Not 複合体には可変デアデニラーゼ サブユニットが含まれています」(PDF)。生化学ジャーナル。422 (3): 443–53 .土井: 10.1042/BJ20090500。PMID  19558367。
• アルバート TK、ハンザワ H、レグテンベルグ YI、デ ルーウェ MJ、ファン デン フーベル FA、コラート MA、ボーレンス R、ティマーズ HT (2002 年 2 月)。「CCR4-NOT転写抑制因子複合体内のユビキチン-タンパク質リガーゼサブユニットの同定」。EMBO ジャーナル。21 (3): 355–64 .土井: 10.1093/emboj/21.3.355。PMC  125831。PMID  11823428。
• Dominguez C, Bonvin AM, Winkler GS, van Schaik FM, Timmers HT, Boelens R (2004年4月). 「NMR、変異誘発、ドッキング法の組み合わせにより明らかになったUbcH5B/CNOT4複合体の構造モデル」 . Structure . 12 (4): 633–44 . doi : 10.1016/j.str.2004.03.004 . PMID  15062086 .
• Wistow G, Bernstein SL, Wyatt MK, Fariss RN, Behal A, Touchman JW, Bouffard G, Smith D, Peterson K (2002年6月). 「NEIBankプロジェクトのためのヒトRPE/脈絡膜の発現配列タグ解析：6000以上の非冗長転写産物、新規遺伝子、スプライスバリアント」. Molecular Vision . 8 : 205–20 . PMID  12107410 .
• Mersman DP, Du HN, Fingerman IM, South PF, Briggs SD (2009年4月). 「脱メチル化酵素Jhd2のポリユビキチン化はヒストンのメチル化と遺伝子発現を制御する」 . Genes & Development . 23 (8): 951–62 . doi : 10.1101/gad.1769209 . PMC  2675863. PMID  19346402 .
• Hanzawa H, de Ruwe MJ, Albert TK, van Der Vliet PC, Timmers HT, Boelens R (2001年3月). 「ヒトNOT4のC4C4リングフィンガーの構造は、C3HC4リングフィンガーとは異なる特徴を示す」 . The Journal of Biological Chemistry . 276 (13): 10185–90 . doi : 10.1074/jbc.M009298200 . PMID  11087754 .
• Albert TK, Lemaire M, van Berkum NL, Gentz R, Collart MA, Timmers HT (2000年2月). 「酵母CCR4-NOT複合体サブユニットのヒト相同遺伝子の単離と特性解析」 . Nucleic Acids Research . 28 (3): 809–17 . doi : 10.1093/nar/28.3.809 . PMC  102560. PMID 10637334  .

この記事には、パブリック ドメインである米国国立医学図書館のテキストが組み込まれています。