CNOT6

CNOT6
識別子
エイリアス	CNOT6、CCR4、Ccr4a、CCR4-NOT転写複合体サブユニット6
外部ID	オミム：608951; MGI : 2144529;ホモロジーン: 69187;ジーンカード：CNOT6; OMA :CNOT6 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 5番染色体（ヒト）[1] バンド 5q35.3 始める 1億8049万4379bp [1] 終わり 1億8057万8358塩基対[1]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 11番染色体（マウス）[2] バンド 11|11 B1.2 始める 49,562,330 bp [2] 終わり 49,603,550 bp [2]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 二次卵母細胞 口腔粘膜細胞 小脳虫部 神経節隆起 心室帯 網膜色素上皮 鼻咽頭上皮 海綿骨 羊水 気管支上皮細胞 上位の表現 網膜色素上皮 球形嚢 耳小胞 毛様体 尿管 内側神経節隆起 積雲細胞 上頸部神経節 三叉神経節 耳板 より多くの参照表現データ バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 ポリ(A)特異的リボヌクレアーゼ活性 エキソリボヌクレアーゼ活性 金属イオン結合 タンパク質結合 RNA結合 ヌクレアーゼ活性 エキソヌクレアーゼ活性 加水分解酵素活性 3'-5'-エキソリボヌクレアーゼ活性 細胞成分 細胞質 細胞質 膜 CCR4-NOT複合体 核 生物学的プロセス 転写の制御、DNAテンプレート 核酸ホスホジエステル結合の加水分解 転写、DNAテンプレート 細胞質mRNA処理体の正の調節 miRNAによる遺伝子サイレンシング 細胞集団増殖の正の調節 脱アデニル化mRNAのエキソヌクレアーゼ分解 遺伝子サイレンシング 核転写されたmRNAの分解過程、no-go崩壊 翻訳の規制 DNA損傷応答、p53クラスメディエーターによるシグナル伝達により細胞周期停止に至る RNAホスホジエステル結合加水分解、エキソヌクレアーゼ 核転写されたmRNAポリ(A)テールの短縮 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 57472 104625 アンサンブル ENSG00000113300 ENSMUSG00000020362 ユニプロット Q9ULM6 Q8K3P5 RefSeq (mRNA) NM_001303241 NM_015455 NM_001370472 NM_001370473 NM_001370474 NM_001290741 NM_212484 NM_001363356 NM_001363357 RefSeq（タンパク質） NP_001290170 NP_001357401 NP_001357402 NP_001357403 NP_001277670 NP_997649 NP_001350285 NP_001350286 場所（UCSC） 5 章: 180.49 – 180.58 Mb 11章: 49.56 – 49.6 Mb PubMed検索 [3] [4]
ウィキデータ
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CCR4-NOT転写複合体サブユニット6は、ヒトではCNOT6遺伝子によってコードされるタンパク質である。^{[5] [6]}

この遺伝子によってコードされるタンパク質は、CCR4-Not転写調節およびデアデニラーゼ複合体のサブユニットである。このタンパク質は3'-5'エキソヌクレアーゼ活性を有し、ポリアデニル化された基質を好む。^[6]

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000113300 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000020362 – Ensembl、2017年5月
3. 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. Chen J, Chiang YC, Denis CL (2002年3月). 「3'-5'ポリ(A)RNAおよびssDNAエキソヌクレアーゼであるCCR4は、細胞質デアデニラーゼの触媒成分である」. EMBO J. 21 ( 6): 1414–26 . doi :10.1093/emboj/21.6.1414. PMC 125924. PMID  11889047 . 
6. 「Entrez Gene: CNOT6 CCR4-NOT転写複合体、サブユニット6」。

外部リンク

• UCSC ゲノム ブラウザのヒト CCR4 ゲノムの位置と CCR4 遺伝子の詳細ページ。
• UCSC ゲノム ブラウザのヒト CNOT6 ゲノムの位置と CNOT6 遺伝子の詳細ページ。

さらに読む

• 大久保 健、伊藤 健、福島 明、他 (1996). 「発現プロファイルによる細胞生理のモニタリングと、コンパイルされた発現プロファイルによる細胞タイプ特異的遺伝子の発見」.ゲノミクス. 30 (2): 178–86 . doi :10.1006/geno.1995.9887. PMID  8586417.
• 永瀬 剛志、石川 功、菊野 亮、他 (2000). 「未同定ヒト遺伝子のコード配列の予測 XV. in vitroで巨大タンパク質をコードする脳由来の新規cDNAクローン100個の完全配列」DNA Res . 6 (5): 337–45 . doi : 10.1093/dnares/6.5.337 . PMID  10574462.
• Albert TK, Lemaire M, van Berkum NL, et al. (2000). 「酵母CCR4-NOT複合体サブユニットのヒト相同遺伝子の単離と特性解析」Nucleic Acids Res . 28 (3): 809–17 . doi :10.1093/nar/28.3.809. PMC 102560.  PMID 10637334  .
• Dupressoir A, Morel AP, Barbot W, et al. (2003). 「高等真核生物におけるyCCR4およびMg2+依存性エンドヌクレアーゼ関連タンパク質の4ファミリーの同定、およびhCAF1/hPOP2結合に必須な保存されたロイシンリッチリピート配列を持つyCCR4相同遺伝子の特性解析」BMC Genomics . 2 : 9. doi : 10.1186/1471-2164-2-9 . PMC  61044 . PMID  11747467.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241. PMID  12477932 .
• 太田 剛志、鈴木 雄志、西川 剛志、他 (2004). 「21,243個の完全長ヒトcDNAの完全配列決定と特性解析」Nat. Genet . 36 (1): 40–5 . doi : 10.1038/ng1285 . PMID  14702039.
• Chang TC, Yamashita A, Chen CY, et al. (2004). 「ポリ(A)結合タンパク質の新たなパートナーであるUNRは、c-fos主要コード領域決定因子を介した翻訳共役mRNAターンオーバーにおいて重要な役割を果たす」Genes Dev . 18 (16): 2010–23 . doi :10.1101/gad.1219104. PMC 514181.  PMID 15314026  .
• Oh JH, Yang JO, Hahn Y, et al. (2006). 「ヒト胃癌のトランスクリプトーム解析」. Mamm. Genome . 16 (12): 942–54 . doi :10.1007/s00335-005-0075-2. PMID  16341674. S2CID  69278.