ヒトのタンパク質コード遺伝子
| COPS4 |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オーソログ検索: PDBe RCSB |
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| PDB IDコードのリスト |
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4D0P、4D10、4D18、4WSN |
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| 識別子 |
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| エイリアス | COPS4、CSN4、COP9シグナロソームサブユニット4、SGN4 |
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| 外部ID | オミム:616008; MGI : 1349414;ホモロジーン: 8067;ジーンカード:COPS4; OMA :COPS4 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | キリスト | 5番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 5 E4|5 48.49 cM | 始める | 100,666,175 bp [2] |
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| 終わり | 100,695,669 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| 上位の表現 | - 上腕二頭筋
- 外側広筋
- 三角筋
- 上腕二頭筋の骨格筋組織
- 臀筋
- 胸郭横隔膜
- 腹直筋の骨格筋組織
- 前脛骨筋
- 右心室
- 二次卵母細胞
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| | 上位の表現 | - 精子細胞
- 精母細胞
- 上顎突出
- 下顎突出
- 胚の尾
- 耳小胞
- 精細管
- 性器結節
- 耳板
- 視索上核
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| | より多くの参照表現データ |
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| バイオGPS |  | | より多くの参照表現データ |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 | | | 細胞成分 |
- 細胞質
- COP9シグナロソーム
- 細胞接合
- シナプス
- 細胞外エクソソーム
- 細胞質小胞
- シナプス小胞
- 核
- 核質
- 細胞質
- 核の粒子
| | 生物学的プロセス |
- 転写連動ヌクレオチド除去修復
- ヌクレオチド除去修復、DNA損傷認識
- タンパク質の脱エジニル化
- 翻訳後タンパク質修飾
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オーソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_001258006 NM_016129 NM_001330727 |
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NM_012001 NM_001359203 NM_001359204 |
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| RefSeq(タンパク質) | |
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NP_001244935 NP_001317656 NP_057213 |
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NP_036131 NP_001346132 NP_001346133 |
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| 場所(UCSC) | 4章: 83.03 – 83.08 Mb | 5番目の文字: 100.67 – 100.7 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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COP9シグナロソーム複合体サブユニット4は、ヒトではCOPS4遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
この遺伝子は、 COP9シグナロソームを構成する8つのサブユニットのうちの1つをコードしています。COP9シグナロソームは高度に保存されたタンパク質複合体であり、複数のシグナル伝達経路において重要な調節因子として機能します。COP9シグナロソームの構造と機能は、26Sプロテアソームの19S調節粒子と類似しています。COP9シグナロソームは、SCF型E3ユビキチンリガーゼと相互作用し、E3ユビキチンリガーゼの正の調節因子として機能することが示されている。[6]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000138663 – Ensembl、2017年5月
- ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000035297 – Ensembl、2017年5月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ Wei N, Tsuge T, Serino G, Dohmae N, Takio K, Matsui M, et al. (1998年10月). 「COP9複合体は植物と哺乳類の間で保存されており、26Sプロテアソーム調節複合体と関連している」. Curr Biol . 8 (16): 919– 924. Bibcode :1998CBio....8..919W. doi : 10.1016/S0960-9822(07)00372-7 . PMID 9707402. S2CID 13873982.
- ^ ab "Entrez Gene: COPS4 COP9 構成的光形態形成ホモログサブユニット 4 (Arabidopsis)".
外部リンク
さらに読む
- Schwechheimer C, Deng XW (2001). 「COP9シグナロソームの再考:タンパク質分解の新規メディエーター」Trends Cell Biol . 11 (10): 420– 426. doi :10.1016/S0962-8924(01)02091-8. PMID 11567875.
- Wolf DA, Zhou C, Wee S (2004). 「COP9シグナロソーム:Cullinユビキチンリガーゼの組み立てと維持のためのプラットフォーム?」Nat. Cell Biol . 5 (12): 1029– 1033. doi :10.1038/ncb1203-1029. PMID 14647295. S2CID 37458780.
- 丸山 憲治, 菅野 誠 (1994). 「オリゴキャッピング:真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置換する簡便法」.遺伝子. 138 ( 1–2 ): 171–174 . doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- 鈴木雄三、中川吉智、丸山健、須山明生、菅野誠一 (1997). 「全長エンリッチドcDNAライブラリーおよび5'末端エンリッチドcDNAライブラリーの構築と特性解析」. Gene . 200 ( 1–2 ): 149–156 . doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
- Seeger M, Kraft R, Ferrell K, Bech-Otschir D, Dumdey R, Schade R, et al. (1998). 「26Sプロテアソームサブユニットとの類似性を有するシグナル伝達に関与する新規タンパク質複合体」FASEB J. 12 ( 6): 469–78 . doi : 10.1096/fasebj.12.6.469 . PMID 9535219. S2CID 25424324.
- サンガーセンターT、ワシントン大学ゲノムシーケンシングセンターT (1999). 「完全なヒトゲノム配列の解明に向けて」Genome Res . 8 (11): 1097–108 . doi : 10.1101/gr.8.11.1097 . PMID 9847074.
- Naumann M, Bech-Otschir D, Huang X, Ferrell K, Dubiel W (2000). 「COP9シグナロソーム誘導性c-Jun活性化/安定化はJNKに依存しない」(PDF) . J. Biol. Chem . 274 (50): 35297– 35300. doi : 10.1074/jbc.274.50.35297 . PMID 10585392. S2CID 27417298.
- Cohen H, Azriel A, Cohen T, Meraro D, Hashmueli S, Bech-Otschir D, et al. (2001). 「インターフェロンコンセンサス配列結合タンパク質とCOP9/シグナロソームサブユニットCSN2(Trip15)との相互作用。インターフェロン調節因子シグナル伝達とCOP9/シグナロソームとの関連性の可能性」J. Biol. Chem . 275 (50): 39081– 39089. doi : 10.1074/jbc.M004900200 . PMID 10991940.
- Tsuge T, Matsui M, Wei N (2001). 「COP9シグナロソームのサブユニット1は、N末端ドメインを介して遺伝子発現を抑制し、PCIドメインを介して複合体に組み込む」J. Mol. Biol . 305 (1): 1– 9. doi :10.1006/jmbi.2000.4288. PMID 11114242.
- Bech-Otschir D, Kraft R, Huang X, Henklein P, Kapelari B, Pollmann C, et al. (2001). 「COP9シグナロソーム特異的リン酸化はp53をユビキチンシステムによる分解へと誘導する」EMBO J. 20 ( 7): 1630– 1639. doi :10.1093/emboj/20.7.1630. PMC 145508. PMID 11285227 .
- Lyapina S, Cope G, Shevchenko A, Serino G, Tsuge T, Zhou C, et al. (2001). 「COP9シグナロソームによるNEDD-CUL1結合体切断の促進」. Science . 292 (5520): 1382– 1385. Bibcode :2001Sci...292.1382L. doi :10.1126/science.1059780. PMID: 11337588 . S2CID :14224920.
- Peyrl A, Weitzdoerfer R, Gulesserian T, Fountoulakis M, Lubec G (2003). 「ダウン症候群胎児脳(トリソミー21)におけるシグナル伝達関連タンパク質14-3-3 gammaおよびRACK1の異常発現」. Electrophoresis . 23 (1): 152–7 . doi :10.1002/1522-2683(200201)23:1<152::AID-ELPS152>3.0.CO;2-T. PMID 11824616. S2CID 12931652.
- Hoareau Alves K, Bochard V, Réty S, Jalinot P (2002). 「哺乳類プロトオンコプロテインInt-6と3つのタンパク質複合体eIF3、COP9シグナロソーム、26Sプロテアソームとの関連」FEBS Lett . 527 ( 1–3 ): 15–21 . doi : 10.1016/S0014-5793(02)03147-2 . PMID 12220626. S2CID 39308598.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, Derge JG, Klausner RD, Collins FS, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 16903. Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
- Serino G, Su H, Peng Z, Tsuge T, Wei N, Gu H, et al. (2003). 「シロイヌナズナCOP9シグナロソームの最終サブユニットの特性解析:複合体の全体構造と起源への示唆」. Plant Cell . 15 (3): 719– 731. doi :10.1105/tpc.009092. PMC 150025. PMID 12615944 .
- Uhle S, Medalia O, Waldron R, Dumdey R, Henklein P, Bech-Otschir D, et al. (2003). 「プロテインキナーゼCK2とプロテインキナーゼDはCOP9シグナロソームと関連する」. EMBO J. 22 ( 6): 1302– 1312. doi :10.1093/emboj/cdg127. PMC 151059. PMID 12628923 .
- Groisman R, Polanowska J, Kuraoka I, Sawada JI, Saijo M, Drapkin R, et al. (2003). 「DDB2およびCSA複合体におけるユビキチンリガーゼ活性は、DNA損傷に対するCOP9シグナロソームによって異なる制御を受ける」. Cell . 113 (3): 357– 367. doi : 10.1016/S0092-8674(03)00316-7 . PMID 12732143. S2CID 11639677.