ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
| CTR9 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | CTR9、SH2BP1、TSBP、p150、p150TSP、CTR9ホモログ、Paf1/RNAポリメラーゼII複合体構成要素 |
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| 外部ID | オミム:609366; MGI : 109345;ホモロジーン: 40668;ジーンカード:CTR9; OMA :CTR9 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | キリスト | 7番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 7 E3|7 57.98 cM | 始める | 110,628,158 bp [2] |
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| 終わり | 110,655,584 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| 上位の表現 | - 精巣上体
- 鼻咽頭上皮
- 眼瞼結膜
- 気管支上皮細胞
- 胚上皮
- 網膜色素上皮
- 精巣上体頭
- 口腔
- 小腸粘膜
- 精巣上体尾部
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| | 上位の表現 | - 吻側回遊流
- 網膜の神経層
- 精母細胞
- 膀胱の移行上皮
- 胚の尾
- 原腸胚
- 子宮
- 精子細胞
- 性器結節
- 胚葉上層
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| | より多くの参照表現データ |
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| バイオGPS |  | | より多くの参照表現データ |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- RNAポリメラーゼII複合体結合
- SH2ドメイン結合
- タンパク質結合
| | 細胞成分 | | | 生物学的プロセス |
- ヒストンのモノユビキチン化
- JAK-STATを介した受容体シグナル伝達経路
- mRNAポリアデニル化の負の制御
- 転写の制御、DNAテンプレート
- ヒストンH3-K4トリメチル化
- RNAポリメラーゼIIによる転写の負の制御
- Wntシグナル伝達経路
- 転写、DNAテンプレート
- 幹細胞集団の維持
- インターロイキン-6を介したシグナル伝達経路
- 内胚葉細胞の運命決定
- ヒストンH3-K4メチル化の正の制御
- 内部細胞塊の細胞分化
- 栄養外胚葉細胞の分化
- ヒストンH3-K79メチル化の正の制御
- 胚盤胞の成長
- ヒストンH2Bのユビキチン化
- ヒストンH2Bユビキチン化の正の制御
- リポ多糖に対する細胞反応
- 骨髄細胞分化の負の調節
- 遺伝子刷り込みの調節
- RNAポリメラーゼIIプロモーターからの転写伸長の正の制御
- RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御
- RNAポリメラーゼIIによる転写
- RNAポリメラーゼIIプロモーターからの転写伸長
- タンパク質のユビキチン化
- ヒストン修飾
- ヒストンH3-K4メチル化の制御
- 胚盤胞の孵化
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| ウィキデータ |
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RNAポリメラーゼ関連タンパク質CTR9ホモログは、ヒトではCTR9遺伝子によってコードされる酵素である。[5] [6] [7]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000198730 – Ensembl、2017年5月
- ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000005609 – Ensembl、2017年5月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 永瀬 剛志、関 暢、田中 明、石川 健、野村 暢志 (1996年3月). 「未同定ヒト遺伝子のコード配列の予測 IV. ヒト細胞株KG-1由来のcDNAクローン解析により推定された40個の新規遺伝子(KIAA0121-KIAA0160)のコード配列」. DNA Res . 2 (4): 167–74 , 199–210 . CiteSeerX 10.1.1.333.6945 . doi : 10.1093/dnares/2.4.167 . PMID 8590280.
- ^ Malek SN, Yang CH, Earnshaw WC, Kozak CA, Desiderio S (1996年7月). 「p150TSPは、複数のテトラトリコペプチド反復配列を含み、SH2ドメインに特異的に結合する保存された核リン酸化タンパク質である」. J Biol Chem . 271 (12): 6952–62 . doi : 10.1074/jbc.271.12.6952 . PMID 8636124.
- ^ 「Entrez Gene: CTR9 Ctr9、Paf1/RNAポリメラーゼII複合体構成要素、ホモログ(S. cerevisiae)」。
外部リンク
さらに読む
- 中山 正之、菊野 亮、小原 修 (2003). 「巨大タンパク質間のタンパク質間相互作用:長鎖cDNAからなる機能分類ライブラリーを用いた2ハイブリッドスクリーニング」Genome Res . 12 (11): 1773–84 . doi :10.1101/gr.406902. PMC 187542. PMID 12421765 .
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
- Colland F, Jacq X, Trouplin V, et al. (2004). 「ヒトシグナル伝達経路の機能的プロテオミクスマッピング」Genome Res . 14 (7): 1324–32 . doi :10.1101/gr.2334104. PMC 442148. PMID 15231748 .
- Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, et al. (2004). 「HeLa細胞核リン酸化タンパク質の大規模解析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 101 (33): 12130–5 . Bibcode :2004PNAS..10112130B. doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC 514446. PMID 15302935 .
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). 「NIH完全長cDNAプロジェクトの現状、品質、そして拡大:哺乳類遺伝子コレクション(MGC)」. Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 .
- Beausoleil SA, Villén J, Gerber SA, et al. (2006). 「確率に基づくアプローチによるハイスループットタンパク質リン酸化解析と部位局在化」Nat. Biotechnol . 24 (10): 1285–92 . doi :10.1038/nbt1240. PMID 16964243. S2CID 14294292.
- Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, et al. (2006). 「シグナル伝達ネットワークにおける全体的、in vivo、および部位特異的なリン酸化ダイナミクス」. Cell . 127 (3): 635–48 . doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983. S2CID 7827573.