CUGBP2

CELF2
利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 2MY7、2MY8、4LJM、4LMZ、4TLQ
識別子
エイリアス	CELF2、BRUNOL3、CUGBP2、ETR-3、ETR3、NAPOR、CELF-2、CUG-BP2、CUGBP、Elav様ファミリーメンバー2、CUGBP Elav様ファミリーメンバー2、DEE97
外部ID	オミム：602538; MGI : 1338822;ホモロジーン: 4783;ジーンカード：CELF2; OMA :CELF2 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 10番染色体（ヒト）[1] バンド 10p14 始める 10,798,397 bp [1] 終わり 11,336,675 bp [1]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 染色体2（マウス）[2] バンド 2|2 A1 始める 6,539,694 bp [2] 終わり 7,509,563 bp [2]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 海馬固有部I領域 眼窩前頭皮質 嗅内皮質 海綿骨 中側頭回 中心後回 ブロードマン領域46 視床の外側核群 ブロードマン野23 胚上皮 上位の表現 吻側回遊流 外側中隔核 嗅結節 側坐核 前扁桃体領域 鉤状部 バレル皮質 神経節隆起 嗅球 内側背側核 より多くの参照表現データ バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 核酸結合 RNA結合 プレmRNA結合 mRNA結合 細胞成分 細胞質 核 リボ核タンパク質複合体 生物学的プロセス mRNA処理 RNA処理 心臓収縮の調節 mRNAスプライス部位の選択 スプライソソームを介した選択的mRNAスプライシングの制御 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 10659 14007 アンサンブル ENSG00000048740 ENSMUSG00000002107 ユニプロット O95319 Q9Z0H4 RefSeq (mRNA) NM_001025076 NM_001025077 NM_001083591 NM_006561 NM_001326317 NM_001326318 NM_001326319 NM_001326320 NM_001326321 NM_001326323 NM_001326324 NM_001326325 NM_001326326 NM_001326327 NM_001326328 NM_001326329 NM_001326330 NM_001326331 NM_001326332 NM_001326333 NM_001326334 NM_001326335 NM_001326336 NM_001326337 NM_001326338 NM_001326339 NM_001326340 NM_001326341 NM_001326342 NM_001326343 NM_001326344 NM_001326345 NM_001326346 NM_001326347 NM_001326348 NM_001326349 NM_001394502 NM_001394513 NM_001394517 NM_001394518 NM_001394519 NM_001110228 NM_001110229 NM_001110230 NM_001110231 NM_001110232 NM_001160292 NM_001160293 NM_010160 NM_183219 NM_001310447 NM_001347094 RefSeq（タンパク質） NP_001020247 NP_001020248 NP_001077060 NP_001313246 NP_001313247 NP_001313248 NP_001313249 NP_001313250 NP_001313252 NP_001313253 NP_001313254 NP_001313255 NP_001313256 NP_001313257 NP_001313258 NP_001313259 NP_001313260 NP_001313261 NP_001313262 NP_001313263 NP_001313264 NP_001313265 NP_001313266 NP_001313267 NP_001313268 NP_001313269 NP_001313270 NP_001313271 NP_001313272 NP_001313273 NP_001313274 NP_001313275 NP_001313276 NP_001313277 NP_001313278 NP_006552 NP_001103698 NP_001103699 NP_001103700 NP_001103701 NP_001103702 NP_001153764 NP_001153765 NP_001297376 NP_001334023 NP_034290 NP_001393762 NP_001393763 NP_001393764 NP_001393770 NP_001393771 NP_001393772 NP_001393773 NP_001393774 NP_001393775 NP_001393776 NP_001393777 NP_001393778 NP_001393779 NP_001393780 NP_001393781 NP_001393783 NP_001393784 NP_001393787 NP_001393846 NP_001393847 NP_001393848 NP_001393849 NP_001393850 NP_001393851 NP_001393852 NP_001393853 NP_001393854 NP_001393855 NP_001393856 NP_001393857 NP_001393858 NP_001393859 NP_001393860 NP_001393861 NP_001393862 NP_001393863 NP_001393871 NP_001393872 NP_001393873 NP_001393874 NP_001393875 NP_001393876 NP_001393877 NP_001393878 NP_001393879 NP_001393880 NP_001393881 NP_001393882 NP_001393883 NP_001393884 NP_001393885 NP_001393886 NP_001393887 NP_001393888 NP_001393889 NP_001393890 NP_001393891 NP_001393892 NP_001393893 NP_001393894 NP_001393895 NP_001393896 NP_001393897 NP_001393898 NP_001393899 NP_001393900 NP_001393901 NP_001393902 NP_001393903 NP_001393904 NP_001393905 NP_001393906 NP_001393907 NP_001393908 NP_001393909 NP_001393910 NP_001393911 場所（UCSC） 10章: 10.8 – 11.34 Mb 2章: 6.54 – 7.51 Mb PubMed検索 [3] [4]
ウィキデータ
人間の表示/編集 マウスの表示/編集

CUGBP（Elav様ファミリーメンバー2）、別名Etr-3は、ヒトではCELF2遺伝子によってコードされるタンパク質である。^{[5] [6] [7]}

CELF/BRUNOLタンパク質ファミリーのメンバーはRNA結合タンパク質であり、2つのN末端RNA認識モチーフ（RRM）ドメイン、1つのC末端RRMドメイン、そして第2および第3のRRMドメイン間の160～230アミノ酸の分岐領域を含む。このタンパク質ファミリーのメンバーは、pre-mRNAの選択的スプライシングを制御し、mRNA編集や翻訳にも関与している可能性がある。選択的スプライシングの結果、異なるアイソフォームをコードする複数の転写産物バリアントが生じる。^[7]

相互作用

CUGBP2はA1CFと相互作用することが示されている。^[8]

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000048740 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000002107 – Ensembl、2017年5月
3. 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. Hwang DM, Hwang WS, Liew CC (1995年3月). 「心血管系の新規遺伝子を発見するための単方向ヒト胎児心臓cDNAライブラリーのシングルパスシーケンシング」J Mol Cell Cardiol . 26 (10): 1329–33 . doi :10.1006/jmcc.1994.1151. PMID  7869393.
6. Lu X, Timchenko NA, Timchenko LT (1999年3月). 「心筋梗塞型RNA結合タンパク質（ETR-3）はミオトニックジストロフィーにおいて拡大したRNA CUGリピートに結合する」Hum Mol Genet . 8 (1): 53– 60. doi :10.1093/hmg/8.1.53. PMID  9887331.
7. "Entrez 遺伝子: CELF2 CUGBP、Elav 様ファミリー メンバー 2".
8. Anant, S; Henderson JO; Mukhopadhyay D; Navaratnam N; Kennedy S; Min J; Davidson NO (2001年12月). 「哺乳類のRNA編集におけるRNA結合タンパク質CUGBP2の新たな役割。CUGBP2はアポベック1およびアポベック1相補因子ACFと相互作用することで、アポリポタンパク質B mRNAのCからUへの編集を制御する」J. Biol. Chem . 276 (50). 米国: 47338–51 . doi : 10.1074/jbc.M104911200 . ISSN  0021-9258. PMID  11577082.

外部リンク

• UCSC ゲノム ブラウザのヒト CELF2 ゲノムの位置と CELF2 遺伝子の詳細ページ。

さらに読む

• Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). 「正規化と減算：遺伝子発見を促進する2つのアプローチ」Genome Res . 6 (9): 791– 806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID  8889548.
• Choi DK, Ito T, Tsukahara F, et al. (1999). 「アポトーシス誘導性ELAV型RNA結合タンパク質をコードするmNaporの発達制御発現」. Gene . 237 (1): 135–42 . doi :10.1016/S0378-1119(99)00312-1. PMID  10524244.
• Good PJ, Chen Q, Warner SJ, Herring DC (2000). 「ショウジョウバエのBruno翻訳制御因子に関連するヒトRNA結合タンパク質ファミリー」. J. Biol. Chem . 275 (37): 28583–92 . doi : 10.1074/jbc.M003083200 . PMID  10893231.
• Ladd AN, Charlet N, Cooper TA (2001). 「CELFファミリーのRNA結合タンパク質は細胞特異的かつ発生的に制御された選択的スプライシングに関与している」. Mol. Cell. Biol . 21 (4): 1285–96 . doi :10.1128/MCB.21.4.1285-1296.2001. PMC  99581. PMID 11158314  .
• Li D, Bachinski LL, Roberts R (2001). 「家族性不整脈原性右室異形成症の候補遺伝子としてのヒトNAPOR（CUGBP2）のゲノム構成とアイソフォーム特異的組織発現」Genomics . 74 (3): 396– 401. doi :10.1006/geno.2001.6558. PMID  11414768.
• Anant S, Henderson JO, Mukhopadhyay D, et al. (2002). 「哺乳類RNA編集におけるRNA結合タンパク質CUGBP2の新たな役割。CUGBP2はアポベック1およびアポベック1相補因子ACFと相互作用することにより、アポリポタンパク質B mRNAのC->U編集を制御する」J. Biol. Chem . 276 (50): 47338–51 . doi : 10.1074/jbc.M104911200 . PMID  11577082.
• Lichtner P, Attié-Bitach T, Schuffenhauer S, et al. (2003). 「部分的モノソミー10pに関連する心臓および胸腺の発達異常の候補遺伝子BRUNOL3の発現および変異解析」J. Mol. Med . 80 (7): 431–42 . doi :10.1007/s00109-002-0331-9. PMID  12110949. S2CID  24098272.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241. PMID  12477932 .
• Mukhopadhyay D, Houchen CW, Kennedy S, et al. (2003). 「新規RNA結合タンパク質CUGBP2によるシクロオキシゲナーゼ-2のmRNA安定化と翻訳サイレンシングの共役」Mol. Cell . 11 (1): 113–26 . doi : 10.1016/S1097-2765(03)00012-1 . PMID  12535526.
• Singh G, Charlet-B N, Han J, Cooper TA (2004). 「ETR-3およびCELF4タンパク質ドメインはin vivoでのRNA結合およびスプライシング活性に必須である」. Nucleic Acids Res . 32 (3): 1232–41 . doi :10.1093/nar/gkh275. PMC 373409.  PMID 14973222  .
• Mukhopadhyay D, Jung J, Murmu N, et al. (2004). 「CUGBP2は遺伝毒性傷害に対する乳がん細胞のアポトーシスにおいて重要な役割を果たす」Ann. NY Acad. Sci . 1010 (1): 504–9 . Bibcode :2003NYASA1010..504M. doi :10.1196/annals.1299.093. PMID:  15033780. S2CID  : 38581539.
• Brandenberger R, Wei H, Zhang S, et al. (2005). 「トランスクリプトーム解析によりヒトES細胞の増殖と分化を制御するシグナル伝達ネットワークが解明される」Nat. Biotechnol . 22 (6): 707–16 . doi :10.1038/nbt971. PMID  15146197. S2CID  27764390.
• 鈴木雄三、山下亮、城田正之、他 (2004). 「ヒトとマウスの遺伝子の配列比較により、プロモーター領域に相同ブロック構造が明らかになった」. Genome Res . 14 (9): 1711–8 . doi :10.1101/gr.2435604. PMC 515316.  PMID 15342556  .
• Murmu N, Jung J, Mukhopadhyay D, et al. (2004). 「放射線障害におけるRNA結合タンパク質CUGBP2とシクロオキシゲナーゼ-2を介したプロスタグランジンE2の動的拮抗作用」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 101 (38): 13873–8 . Bibcode :2004PNAS..10113873M. doi : 10.1073/pnas.0406066101 . PMC  518846. PMID 15358864  .
• Han J, Cooper TA (2005). 「生体内におけるCELFスプライシング活性化および抑制ドメインの同定」Nucleic Acids Res . 33 (9): 2769–80 . doi :10.1093/nar/gki561. PMC 1126903.  PMID 15894795  .
• 木村 功、若松 明、鈴木 雄一、他 (2006). 「転写調節の多様化：ヒト遺伝子の推定代替プロモーターの大規模同定と特性解析」Genome Res . 16 (1): 55– 65. doi :10.1101/gr.4039406. PMC 1356129.  PMID 16344560  .
• Lim J, Hao T, Shaw C, et al. (2006). 「ヒト遺伝性運動失調症およびプルキンエ細胞変性疾患におけるタンパク質間相互作用ネットワーク」. Cell . 125 (4): 801–14 . doi : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . PMID  16713569. S2CID  13709685.
• Chen Z, Eggerman TL, Patterson AP (2007). 「ApoB mRNA編集は、複数のApoB mRNA編集酵素成分の協調的な調節によって媒介される」Am. J. Physiol. Gastrointest. Liver Physiol . 292 (1): G53–65. doi :10.1152/ajpgi.00118.2006. PMID  16920700.