CXXC1

CXXC1
利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 3QMB、3QMC、3QMD、3QMG、3Q​​MH、3QMI
識別子
エイリアス	CXXC1、2410002I16Rik、5830420C16Rik、CFP1、CGBP、HsT2645、PCCX1、PHF18、SPP1、ZCGPC1、hCGBP、CXXCフィンガータンパク質1
外部ID	オミム：609150; MGI : 1921572;ホモロジーン: 32221;ジーンカード：CXXC1; OMA :CXXC1 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 18番染色体（ヒト）[1] バンド 18q21.1 始める 50,282,343 bp [1] 終わり 50,287,839 bp [1]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 18番染色体（マウス）[2] バンド 18|18 E2 始める 74,349,195 bp [2] 終わり 74,354,567 bp [2]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 小脳の右半球 膵臓の体 右卵管 膵管細胞 顆粒球 甲状腺の右葉 脚の皮膚 腓骨神経 腹部の皮膚 甲状腺の左葉 上位の表現 回腸上皮 胚の尾 性器結節 網膜の神経層 第四脳室脈絡叢 乳腺 嗅内皮質 嗅周皮質 二次卵母細胞 耳小胞 より多くの参照表現データ バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 DNA結合 亜鉛イオン結合 タンパク質結合 シス調節領域配列特異的DNA結合 ヒストンメチルトランスフェラーゼ活性（H3-K4特異的） 金属イオン結合 非メチル化CpG結合 DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的 細胞成分 核マトリックス 核の粒子 核 核質 ヒストンメチルトランスフェラーゼ複合体 細胞質 Set1C/COMPASS複合体 生物学的プロセス 転写の正の制御、DNAテンプレート IRE1を介した未折り畳みタンパク質応答 ヒストンH3-K4のメチル化 転写の制御、DNAテンプレート 転写、DNAテンプレート RNAポリメラーゼIIによる転写の調節 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 30827 74322 アンサンブル ENSG00000154832 ENSMUSG00000024560 ユニプロット Q9P0U4 Q9CWW7 RefSeq (mRNA) NM_001101654 NM_014593 NM_028868 NM_001378844 RefSeq（タンパク質） NP_001095124 NP_055408 NP_083144 NP_001365773 場所（UCSC） 18章: 50.28 – 50.29 Mb 18章: 74.35 – 74.35 Mb PubMed検索 [3] [4]
ウィキデータ
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CpG結合タンパク質（CGBP）は、CXXC型ジンクフィンガータンパク質1（CXXC1）またはPHDフィンガーおよびCXXCドメイン含有タンパク質1（PCCX1）としても知られ、ヒトではCXXC1遺伝子によってコードされるタンパク質です。^{[5] [6] [7]}

CXXC1などのDNA結合ドメイン内にCXXCモチーフを含むタンパク質はCpG配列を認識し、遺伝子発現を制御する。^[6]

参照

• PHD指
• CXXC5

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000154832 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000024560 – Ensembl、2017年5月
3. 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. 藤野 剛志、長谷川 正治、柴田 聡、岸本 毅、今井 誠、高野 剛志 (2000年6月). 「PHDフィンガーとCXXCドメインを有する新規DNA結合タンパク質PCCX1は、タンパク質分解によって制御される」Biochem Biophys Res Commun . 271 (2): 305– 310. doi :10.1006/bbrc.2000.2614. PMID  10799292.
6. Voo KS, Carlone DL, Jacobsen BM, Flodin A, Skalnik DG (2000年3月). 「メチル化されていないCpGモチーフに結合し、DNAメチルトランスフェラーゼ、ヒトトリソラックス、およびメチルCpG結合ドメインタンパク質1とCXXCドメインを共有する哺乳類転写活性化因子のクローニング」Mol Cell Biol . 20 (6): 2108– 2121. doi :10.1128/MCB.20.6.2108-2121.2000. PMC 110827. PMID  10688657 . 
7. 「Entrez Gene: CXXC1 CXXC フィンガー 1 (PHD ドメイン)」。

外部リンク

• UCSC ゲノム ブラウザのヒト CXXC1 ゲノムの位置と CXXC1 遺伝子の詳細ページ。
• UCSC ゲノム ブラウザのヒト SPP1 ゲノムの位置と SPP1 遺伝子の詳細ページ。
• PDBe-KBのUniProt : Q9P0U4 (CXXC 型ジンクフィンガータンパク質 1)のPDBで利用可能なすべての構造情報の概要。

さらに読む

• Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, et al. (2001). 「ヒト遺伝子およびタンパク質のカタログ作成に向けて：新規完全タンパク質コードヒトcDNA500個の配列決定と解析」Genome Res . 11 (3): 422– 435. doi :10.1101/gr.GR1547R. PMC 311072.  PMID 11230166  .
• Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, et al. (2001). 「大規模cDNAシークエンシングによって同定された新規タンパク質の系統的細胞内局在」. EMBO Rep . 1 (3): 287– 292. doi :10.1093/embo-reports/kvd058. PMC  1083732. PMID  11256614 .
• Lee JH, Voo KS, Skalnik DG (2002). 「CpG結合タンパク質のDNA結合ドメインの同定と特性解析」. J. Biol. Chem . 276 (48): 44669– 44676. doi : 10.1074/jbc.M107179200 . PMID  11572867.
• Carlone DL, Skalnik DG (2001). 「CpG結合タンパク質は初期胚発生に重要である」. Mol. Cell. Biol . 21 (22): 7601– 7606. doi :10.1128/MCB.21.22.7601-7606.2001. PMC 99931.  PMID 11604496  .
• Lee JH, Skalnik DG (2003). 「CpG結合タンパク質は、ヒト三胸部を含む核スペックルに局在する核マトリックスおよびユークロマチン関連タンパク質である。核マトリックス標的シグナルの同定」J. Biol. Chem . 277 (44): 42259– 42267. doi : 10.1074/jbc.M205054200 . PMID  12200428.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 16903. Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241. PMID  12477932 .
• Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). 「NIH完全長cDNAプロジェクトの現状、品質、そして拡大：哺乳類遺伝子コレクション（MGC）」. Genome Res . 14 (10B): 2121– 2127. doi :10.1101/gr.2596504. PMC  528928. PMID 15489334  .
• Barrios-Rodiles M, Brown KR, Ozdamar B, et al. (2005). 「哺乳類細胞における動的シグナル伝達ネットワークのハイスループットマッピング」. Science . 307 (5715): 1621– 1625. Bibcode :2005Sci...307.1621B. doi :10.1126/science.11​​05776. PMID :  15761153. S2CID  : 39457788.
• Lee JH, Skalnik DG (2006). 「CpG結合タンパク質（CXXCフィンガータンパク質1）は、酵母Set1/COMPASS複合体の類似体である哺乳類Set1ヒストンH3-Lys4メチルトランスフェラーゼ複合体の構成要素である」. J. Biol. Chem . 280 (50): 41725– 41731. doi : 10.1074/jbc.M508312200 . PMID  16253997.
• Lim J, Hao T, Shaw C, et al. (2006). 「ヒト遺伝性運動失調症およびプルキンエ細胞変性疾患におけるタンパク質間相互作用ネットワーク」. Cell . 125 (4): 801– 814. doi : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . PMID  16713569. S2CID  13709685.
• Young SR, Skalnik DG (2007). 「CXXCフィンガータンパク質1はPLB-985骨髄細胞株の正常な増殖と分化に必須である」DNA Cell Biol . 26 (2): 80– 90. doi :10.1089/dna.2006.0535. PMID  17328666.