クリセオバクテリウム

クリセオバクテリウム
固体LB培地で増殖した Chryseobacterium oleae DSM25575細菌
科学的分類
ドメイン：	細菌
王国：	シュードモナダティ
門:	バクテロイデス類
クラス：	フラボバクテリア
注文：	フラボバクテリア目
家族：	ウィークセラ科
属:	クリセオバクテリ ウム・ヴァンダム他1994
種
本文参照
同義語[1]
ハルペルニア・ ニコルソン他2020 エピリトニモナス ・オサリバン他2006 プラノバクテリ ウム・ペンら2009 スンウーア・ ジョン他2010 カイステラ・ キム他2004 セジョンギア ・イ他2005

クリセオバクテリウム（Chryseobacterium）はグラム陰性 細菌の属です。クリセオバクテリウム属は、化学有機栄養性の桿菌で、グラム陰性です。クリセオバクテリウムは、フレキシルビン型色素によって、典型的な黄橙色のコロニーを形成します。この属には、淡水源、土壌、海水魚、ヒト宿主など、多様な生息地から100種以上が記載されています。 ^[2]

歴史

Chryseobacterium属は、1994年に Vandamme ら[ ^3]により、当時Flavobacterium属に分類されていた 6 つの細菌分類群（F. balustinum、F. indologenes、F. gleum、F. meningosepticum、F. indoltheticum、F. scophthalmum）に対して創設されました。2005年には、 Chryseobacterium属の 2 種（C. meningosepticumとC. miricola）に対してElizabethkingia属が追加されました^{[4] 。2002年には、} Flavobacteriaceae科の新分類群の記述に関する基準とガイドラインが Bernardetらによって出版されました。^{[5] 2006年までに}クリセオバクテリウム属は10種にまで拡大し、2014年までに60種を超え^[6]、現在では100種を超えています。

生態学

クリセオバクテリウム属細菌は、土壌、植物の根、花、腐敗した植物性物質、カエデの樹液から回収された。植物に生息するクリセオバクテリウム株の中には、植物病原菌を抑制することができるものがある。また、淡水の小川、湖、その堆積物、水冷却システム、飲料水、乳酸飲料、ビール瓶詰め工場、バイオリアクターのスラッジ、汚染土壌、海洋堆積物、永久凍土からもクリセオバクテリウム属細菌は回収された。^[6]クリセオバクテリウム属細菌は多くの動物に生息しており、蚊の中腸、ゴキブリの腸、ヤスデの糞、ペンギンのグアノ、淡水カイアシ類の腸ホモゲネート、鳥の羽、牛乳、生の肉、鶏肉などから検出されている。一見健康な魚の粘液から検出されたが、腐敗菌とみなされることもある。^{[6]イスラエルの生乳から}、耐寒性を持つクリセオバクテリウムの新しい3種、C. oranimense 、 C. haifense、C. bovisが検出されている。^[7]

病因

最も病原性の強い Flavobacterium 属のChryseobacterium meningosepticumは、数多くの感染症を引き起こしましたが、 Elizabethkingia属に再分類されました。^[4] Chryseobacterium indologenes は自然界に広く存在し、主に土壌や水中に見られますが、ヒトへの病原体としてはまれです。しかし、まれに、特に免疫不全患者に重篤な感染症を引き起こすことがあります。^[8]感染症のほとんどは院内感染で、免疫抑制剤や留置カテーテルに関連していることが多いです。菌血症、腹膜炎、肺炎、膿胸、腎盂腎炎、膀胱炎、髄膜炎、中心静脈カテーテル関連感染症の原因菌として報告されています。C . indologenes感染症の報告数は増加しています。報告されている感染症の大部分は台湾で発生しており、アジア以外で発生したのはわずか 10% 程度です。オーストラリア、インド、ヨーロッパ、アメリカ合衆国からいくつかの報告がある。^[8] C. indologenesも軟ダニの病原性があるが、他のクリセオバクテリウム属菌は病気のカメ、カエル、魚から検出されており、特にC. scophthalmum、C. joostei、C. piscicola、C. chaponense、C. viscerum、C. oncorhynchi、C. aahli、C. hominis、C. shigense、そしてヒトの疾患に関連するC. indologenesが検出された。^[6]

特定のクリセオバクテリウム種は、羽毛や外骨格など、最も分解困難なコラーゲン性マトリックスを分解できるという、珍しいマトリックス分解特性を持つことが報告されている。これらの特性は、特定のキチナーゼやコラーゲナーゼ様メタロプロテアーゼの作用を介していると考えられる。クリセオバクテリウム・ネマトファガムなど、一部の種は、通常は非常に不溶性のクチクラ外骨格を含むすべての線虫組織に感染し、殺し、最終的には消費できることが示された。^{[9]キチナーゼ、ゼラチナーゼ、コラーゲナーゼメタロプロテアーゼの活性は、タイプIX分泌システムを介して発揮される}クリセオバクテリウムの滑走運動に関連している。実際、これらの酵素のいくつかはC末端にタイプIX分泌シグナルを持っている。^[10] クリセオバクテリウム自体は、コラーゲンもキチンタンパク質や構造も持っていない。クリセオバクテリウム属はバクテロイデス門に属し、そのメンバーは異常に関連のある運動性と分泌システムを持つとますます説明されている。^{[9] [10]}

ボツリヌス神経毒素様（BoNT様）毒素がクリセオバクテリウム・ピペリ株CTMのゲノム中に検出され、非常に多様なBoNT様毒素群を形成している。クリセオバクテリウム・ピペリ由来のBoNT様毒素の一つはヒト腎細胞において壊死性細胞死を誘導したが、BoNTに共通するSNARE基質を切断することは確認されなかった。^[11]

抗生物質耐性

クリセオバクテリウム属菌は、テトラサイクリン、エリスロマイシン、リネゾリド、ポリミキシン、アミノグリコシド、クロラムフェニコール、多くのベータラクタムなど、広範囲の抗生物質に対して本質的に耐性を示す一方、バンコマイシンとクリンダマイシンに対しては中程度の感受性を示し、トリメトプリム-スルファメトキサゾールに対しては感受性が変動する。^[6]

種

種には以下が含まれる: ^[1]

• クリセオバクテリウム・アーリ・ ロッホ・アンド・ファイサル 2014
• クリセオバクテリウム・アングスタティ カークら2013
• Chryseobacterium antarcticum (Yi et al . 2005) Kämpfer et al . 2005 2009年
• Chryseobacterium anthropi Kämpfer et al . 2009年
• 「Chryseobacterium antibioticum」Dahal et al . 2021年
• クリセオバクテリウム・ アクアティカムキムら2008
• クリセオバクテリウム・アクイフリギデン セ パーク他2008
• クリセオバクテリウム・アラキディラディシス ケンファーら2015
• クリセオバクテリウム・アラキディス ケンファーら2014
• クリセオバクテリウム・アルスロスファエラエ ケンファーら2010
• Chryseobacterium artocarpi Venil et al . 2014年
• Chryseobacterium aurantiacum Luo et al . 2018年
• クリセオバクテリウム・アウレウム Lee et al . 2019年
• クリセオバクテリウム・バルスティナム （ハリソン 1929）ヴァンダムら1994
• クリセオバクテリウム・ベルナルデティ ・ホームズら2013
• クリセオバクテリウム・ビンゾウエンセ Meng et al . 2020
• Chryseobacterium bovis Hantsis-Zacharov et al . 2008年
• Chryseobacterium buanense (Joung et al . 2010) García-López et al . 2010 2020年
• クリセオバクテリウム・カエニ Quan et al . 2007
• クリセオバクテリウム・ カメリアエクックら2014
• Chryseobacterium candidae Indu et al . 2020年
• Chryseobacterium carnipullorum Charimba et al . 2013年
• クリセオバクテリウム・カーニス ・ホームズら。 2013年
• クリセオバクテリウム・シャポネンセ ・ケンプファーら。 2011年
• 「クリセオバクテリウム・チェンドゥエンシス」ウェンら2016
• 「クリセオバクテリウム・チョンジエンセ」チャウダリーら2021
• 「クリセオバクテリウム・チュンガンゲンシス」Huq 2018
• クリセオバクテリウム・コンタミナンス Kämpfer et al . 2014
• Chryseobacterium cucumeris Jeong et al . 2017年
• Chryseobacterium culicis Kämpferら。 2010年
• クリセオバクテリウム・ダエチョンセキムら2005
• Chryseobacterium daeguense Yoon et al . 2007年
• クリセオバクテリウム・デフルビイ ケンファーら2003
• クリセオバクテリウム・エキノイデオラムリンら2015
• クリセオバクテリウム・エリミ Cho et al . 2011
• Chryseobacterium endophyticum Lin et al . 2017年
• Chryseobacterium flavum Zhou et al . 2007年
• クリセオバクテリウム・フォルモセンス Young et al . 2005
• 「クリセオバクテリウム・フォルモス」Akter et al . 2015年
• Chryseobacterium frigidisoli Bajerski et al . 2013年
• クリセオバクテリウム・フリジダム ・キムら。 2016年
• Chryseobacterium gallinarum Kämpfer et al . 2014年
• クリセオバクテリウム・ガンブリニ Herzog et al . 2008
• クリセオバクテリウム・ジオカルポスファエラ エケンファーら2014
• Chryseobacterium ginsengisoli Nguyen et al . 2013年
• 「クリセオバクテリウム・ジンセンギテラエ」Noh et al . 2017
• クリセオバクテリウム・ジンセンギテラエ Hahnke et al . 2017
• クリセオバクテリウム・ジンセノシディミュータンス Im et al . 2011
• クリセオバクテリウム・グラシエイ ・パルら。 2018年
• Chryseobacterium gleum (Holmes et al . 1984) Vandamme et al . 1984 1994年
• クリセオバクテリウム・グレガリウム ・ベーレンドら2008
• クリセオバクテリウム・グワンジュエンセ・ パーク他2013
• クリセオバクテリウム・ハガメンセ Cho et al . 2011
• クリセオバクテリウム・ハイフェンセ ハンシス・ザチャロフとハルパーン 2007
• クリセオバクテリウム・ ハルペルニアエハーンケら2017
• クリセオバクテリウム・ヒスパレンセ モンテロ・カラサンツ他2013
• Chryseobacterium hispanicum Gallego et al . 2006年
• Chryseobacterium hominis Vaneechoutte et al . 2007年
• クリセオバクテリウム・ フミ・ピレスら。 2010年
• Chryseobacterium hungaricum Szoboszlay et al . 2008年
• クリセオバクテリウム・インドロゲネス （Yabuuchi et al . 1983）Vandamme et al . 1994
• クリセオバクテリウム・インドルテティカム （キャンベルとウィリアムズ 1951）ヴァンダムら1994
• クリセオバクテリウム・ジェジュ エンス・ウェンら2008
• Chryseobacterium jeonii (Yi et al . 2005) Kämpfer et al . 2005 2009年
• クリセオバクテリウム・ ヨーステイ・ヒューゴら。 2003年
• クリセオバクテリウム・コレエンセ (Kim et al . 2004) Kämpfer et al . 2009
• Chryseobacterium kwangjuense Sangら。 2013年
• クリセオバクテリウム・ラクティス Holmes et al . 2013
• Chryseobacterium lacus Zhang et al . 2020年
• クリセオバクテリウム・ラシリ Cho et al . 2011
• Chryseobacterium limigenitum Kämpfer et al . 2015年
• クリセオバクテリウム・リネアレ Zhao et al . 2017
• クリセオバクテリウム・ルテウム ・ベーレンドら2007
• 「クリセオバクテリウム・マノスクエンセ」ボックスバーガーら2020
• Chryseobacterium marinum (Lee et al . 2007) Kämpfer et al . 2007 2009年
• 「カンジダトゥス・クリセオバクテリウム・マッシリエンス」コリッグ。グルーブら。 2004年
• クリセオバクテリウム・モール Herzog et al . 2008
• Chryseobacterium montanum Guo et al . 2016年
• 「クリセオバクテリウム・ムコビスシドーシス」テッツとテッツ 2018
• Chryseobacterium mulctrae Yoon et al . 2019年
• クリセオバクテリウム・ナカガワイ Holmes et al . 2013
• 「クリセオバクテリウム・ネマトファガム」Page et al . 2019
• クリセオバクテリウム・ネパレンセ チャウダリーとキム 2017
• Chryseobacterium oleae Montero-Calasanz et al . 2014年
• クリセオバクテリウム・オンコルリンチ ・ザモラら。 2012年
• Chryseobacterium oranimense Hantsis-Zacharov et al . 2008年
• クリセオバクテリウム・パリダム Herzog et al . 2008
• クリセオバクテリウム・パルストレ ピレスら2010
• 「クリセオバクテリウム・パナシス」Singh et al . 2016年
• クリセオバクテリウム・ペニプルロラム・ オーストハイゼンら。 2019年
• 「クリセオバクテリウム・フォカエンセ」Abou Abdallah et al . 2019年
• クリセオバクテリウム・ホスファティリティ カム ジョンら2019
• クリセオバクテリウム・ピペリ Strahan et al . 2011
• Chryseobacterium piscicola Ilardi et al . 2009年
• クリセオバクテリウム・ピシウム ・デ・ビールら。 2006年
• クリセオバクテリウム・ポリトリカストリ チェンら2015
• クリセオバクテリウム・ポピュリ Bortniak et al . 2019
• Chryseobacterium profundimaris Xuら。 2015年
• 「クリセオバクテリウム・プロテオリチカム」山口・横江 2000
• クリセオバクテリウム・サイクロトレランス （Ge et al . 2015）Hahnke et al . 2017
• クリセオバクテリウム・レティキュリターミティス Zhao et al . 2017
• クリセオバクテリウム・リゾプラナエ ケンファーら2015
• クリセオバクテリウム・リゾスファエラエ Cho et al . 2011
• クリセオバクテリウム・リギイ パーク他2013
• Chryseobacterium salipaludis Divyasree et al . 2018年
• クリセオバクテリウム・サリビクター キムとユ 2020
• クリセオバクテリウム・スコフタルムム （Mudarris et al . 1994）Vandamme et al . 1994
• Chryseobacterium sediminis Kämpfer et al . 2015年
• 「クリセオバクテリウム・セネガレンセ」Lo et al . 2016
• Chryseobacterium shandongense Yang et al . 2015年
• クリセオバクテリウム・シゲンセ 下村ら2005
• 「クリセオバクテリウム・シルリ」オーら。 2020年
• Chryseobacterium solani Du et al . 2015年
• クリセオバクテリウム・ソルダネリコラ パーク他2006
• クリセオバクテリウム・ ソリ・ウェオンら2008
• クリセオバクテリウム・ソリンコラ ベンマレクら2010
• クリセオバクテリウム・タアエンセ パーク他2006
• クリセオバクテリウム・タイチュンゲンセ Shen et al . 2005
• クリセオバクテリウム・タイフエンセ Wu et al . 2013
• クリセオバクテリウム・タイワネンセ Tai et al . 2006
• クリセオバクテリウム・タカキアエ Zhao et al . 2015
• Chryseobacterium taklimakanense (Peng et al . 2009) Holmes et al . 2009 2013年
• クリセオバクテリウム・テナックス (O'Sullivan et al . 2006) Hahnke et al . 2006 2017年
• 「カンジダトゥス・クリセオバクテリウム・ティモネンセ」コリッグ。ドランクールら。 2004年
• 「クリセオバクテリウム・ティモニアヌム」アブ・アブダラ他2017
• Chryseobacterium treverense Yassin et al . 2010年
• Chryseobacterium tructae Zamora et al . 2013年
• クリセオバクテリウム・ウレイリチカム ヘルツォグら2008
• Chryseobacterium v​​accae Lee et al . 2020年
• クリセオバクテリウム・ベトナムメン セ リーとチュー 2012
• Chryseobacterium v​​iscerum Zamora et al . 2012年
• Chryseobacterium v​​rystaatense de Beerら。 2005年
• クリセオバクテリウム・ワンジュエンス ・ウェンら2006
• クリセオバクテリウム・シンジアンセンス Zhao et al . 2011
• Chryseobacterium xixisoli (Feng et al . 2014) Hahnke et al . 2014 2017年
• 「クリセオバクテリウム・ヨンチョネンセ」ホアンら2013
• クリセオバクテリウム・ヨンギネンセ ジョウンとジョ 2011
• Chryseobacterium zeae Kämpfer et al . 2014年
• 「クリセオバクテリウム・ジェンゾウエンセ」王ら2016

参考文献

1. Euzéby JP, Parte AC. 「クリセオバクテリウム」.原核生物名一覧（LPSN） . 2021年6月29日閲覧。
2. Matu A、Lum Nde A、Oosthuizen L、Hitzeroth A、Badenhorst M、Duba L、Gidaga M、Klinck J、Kriek IM、Lekoma PJ、Nel L、Dos Ramos SM、Rossouw J、Salomane N、Segone N、Serobe S、Tiyani T、Hugo CJ、Newman JD (2019 年 1 月)。 「クリセオバクテリウム型株」。微生物学リソースのお知らせ。8 (1): e01518–18。土井：10.1128/MRA.01518-18。PMC 6318376。PMID  30637405。 
3. Vandamme P, Bernardet JF, Segers P, Kersters K, Holmes B (1994-10-01). 「NOTES: フラボバクテリアの分類における新たな視点：新種クリセオバクテリウム、新種ベルゲイエラ、新種エンペドバクターの記載」International Journal of Systematic Bacteriology . 44 (4): 827– 831. doi : 10.1099/00207713-44-4-827 . ISSN  0020-7713.
4. Kim KK, Kim MK, Lim JH, Park HY, Lee ST (2005年5月). 「Chryseobacterium meningosepticumおよびChryseobacterium miricolaのElizabethkingia gen. nov.へのElizabethkingia meningoseptica comb. nov.およびElizabethkingia miricola comb. nov.への移行」. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 55 (Pt 3): 1287–93 . doi : 10.1099/ijs.0.63541-0 . PMID  15879269.
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6. Loch TP, Faisal M (2015年5月). 「魚類における新たなフラボバクテリア感染症：レビュー」. Journal of Advanced Research . 6 (3): 283– 300. doi :10.1016/j.jare.2014.10.009. PMC 4522593. PMID 26257926  . 
7. Hantsis-Zacharov E, Shakéd T, Senderovich Y, Halpern M (2008年11月). 「生乳から単離された耐冷性、タンパク質分解性、脂肪分解性細菌、Chryseobacterium oranimense sp. nov.」International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 58 (Pt 11): 2635–9 . doi : 10.1099/ijs.0.65819-0 . PMID  18984706.
   • 「生乳に新たな細菌を発見」EurekAlert!（プレスリリース）2008年11月16日
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