クロノバクター・サカザキイ
Species of bacterium

クロノバクター・サカザキイ
ペトリ皿で増殖するクロノバクター・サカザキ
トリプチケース大豆ブロス寒天培地 上のコロニー
科学的分類 この分類を編集する
ドメイン： 細菌
王国： シュードモナダティ
門: シュードモナドタ
クラス： ガンマプロテオバクテリア
注文： 腸内細菌科
家族： 腸内細菌科
属: クロノバクター
種：
C.サカザキ
二名法名
クロノバクター・サカザキイ
（ファーマーら1980）[1]

クロノバクター・サカザキ（2007年以前はエンテロバクター・サカザキと命名されていた） [2] [3]は、グラム陰性で桿菌状の病原菌であり、非常に乾燥した場所でも生息することができ、この現象は乾燥耐性（キセロトレランス）として知られている。クロノバクター・サカザキは乾燥に耐えるために多くの遺伝子を利用しており[4]、この乾燥耐性は菌株特異的である可能性がある。 [5]クロノバクター・サカザキによる感染症のほとんどは成人であるが、低出生体重の早産児や月齢の高い乳児が最もリスクが高い。この病原体は乳児における侵襲性感染症のまれな原因であり、歴史的に見て致死率は40～80%と高い。 [6] [7] [8] [9]

乳児では、菌血症、髄膜炎、壊死性腸炎を引き起こす可能性があります。新生児におけるC. sakazakii感染症のほとんどは、粉ミルクの使用に関連しており[7] [9]、一部の菌株は乾燥状態で2年以上生存することができます[10] 。しかし、すべての症例が汚染された粉ミルクに関連しているわけではありません。2011年11月には、Kotex タンポンの複数の出荷がCronobacter（E. sakazakii ）汚染により回収されました。ある研究では、畑で栽培された野菜の12%と水耕栽培された野菜の13%からこの病原体が検出されました[11] [12] 。

クロノバクター属細菌（ C. condimentiを除く）はすべて、成人および乳児の感染症の臨床例と遡及的に関連づけられている。しかしながら、多座位配列型解析[13]では、過去30年間に6カ国で発生した新生児髄膜炎症例のほとんどが、クロノバクター・サカザキイ属細菌の「配列タイプ4」または「ST4」と呼ばれる遺伝子系統にのみ関連していることが示されており[14] 、このクローンが乳児感染症において最も懸念されると考えられる。

この細菌は広く存在し、様々な環境や食品から分離されています。クロノバクター感染症の症例の大部分は成人に発生します。しかしながら、主な注目を集めているのは、内因的または外因的に汚染された粉ミルクとの関連性です。多座配列解析（MLSA）によると、この属は約4000万年前に起源を持ち、臨床的に最も重要な種であるC. sakazakiiは約1500万年から2300万年前に識別可能でした。[15]

分類学

E. sakazakii は、1980年にJJ Farmer IIIらによって種として定義されました。[1] DNA-DNAハイブリダイゼーションの結果、E. sakazakii は、 Enterobacter属とCitrobacter属という2つの異なる属の種と53～54%の近縁性を示しました。しかし、E. sakazakii内には多様なバイオグループが存在することが報告されており、Farmerらはこれらが異なる種である可能性を示唆しており、その解明には更なる研究が必要です。[1]

E. sakazakii株間の分類学的関係は、全長16S rRNA遺伝子配列解析、DNA-DNAハイブリダイゼーション、 多座配列タイピング（MLST）、f- AFLP、自動リボタイピングを用いて研究されてきた。その結果、 E. sakazakiiは腸内細菌科（Enterobacteriaceae）内の新属Cronobacterとして分類され、2007年には当初4種が命名されていた。分類は2008年に5種に拡大され、さらに最近では（2011年）、7種にまで拡大された。[2] [3] [16]

2007年に最初に命名された4種は、Cronobacter sakazakii（2亜種を含む）、C. turicensis、C. muytjensii、C. dublinensis （3亜種を含む）と、 Cronobacter genomospecies Iと呼ばれる無名の種であった。[16] 分類は2008年に改訂され、5番目の命名種であるC. malonaticusが含まれるようになった。これは2007年にはC. sakazakiiの亜種とされていた。[2] 2012年に、Cronobacter genomospecies Iは正式にCronobacter universalisと改名され、7番目の種はCronobacter condimentiと呼ばれるものが記載された。[3]

語源

後にクロノバクター・サカザキとして知られるようになる菌株が初めて分離されたのは1950年で、粉ミルクの缶から分離されました。しかし、この菌株はおそらく数百万年も前から存在していたと考えられます。1980年、ジョン・J・ファーマー3世は、日本の細菌学者坂崎利一に敬意を表し、それまで「黄色色素を持つE. cloacae」として知られていた菌株にエンテロバクター・サカザキという命名を提案しました。その後数十年にわたり、E. sakazakiiは乳児の髄膜炎や敗血症の症例に多数関与していることが示され、その多くは粉ミルクとの関連でした。2007年、E. sakazakiiのバイオグループを包含するためにクロノバクター属が創設され、C. sakazakiiが基準種となりました。この属は、生まれたばかりの子供たちを食い尽くしたギリシャ神話の巨人、クロノスにちなんで命名されました。 [17]

参考文献

  1. ^ abc Farmer JJ III, Asbury MA, Hickman FW, Brenner DJ (1980). 「Enterobacter sakazakii：臨床検体から分離された「腸内細菌科」の新種」. Int J Syst Bacteriol . 30 (3). Enterobacteriaceae Study Group (USA): 569–84 . doi : 10.1099/00207713-30-3-569 .
  2. ^ abc アイヴァーセン C、マレイン N、マッカーデル B、トール BD、レーナー A、ファニング S、ステファン R、ヨーステン H (2008)。 「Enterobacter sakazakiiのバイオグループを包含する新属Cronobacter gen. nov.、およびCronobacter sakazakii gen. nov. comb. nov.、C. malonaticus sp. nov.、C. turicensis sp. nov.、C. muytjensii sp. nov.、C. dublinensis sp. nov.、Cronobacter genomospecies 1、および3亜種C. dublinensis sp. nov. subsp. dublinensis subsp. nov.、C. dublinensis sp. nov. subsp. lausannensis subsp. nov.、およびC. dublinensis sp. nov. subsp. lactaridi subsp. nov.の提案」。International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology。58 (6): 1442– 7.土井: 10.1099/ijs.0.65577-0。PMID  18523192。S2CID 6609941  。
  3. ^ abc Joseph S, Cetinkaya E, Drahovska H, Levican A, Figueras MJ, Forsythe SJ (2012). 「スパイスで味付けされた肉から分離された新種Cronobacter condimenti sp. nov.、および脚の感染症、水、および食品成分から回収されたCronobacter sp. genomospecies 1の新種Cronobacter universalis sp. nov.」Int J Syst Evol Microbiol . 62 (Pt 6): 1277– 1283. doi : 10.1099/ijs.0.032292-0 . PMID  22661070.
  4. ^ Srikumar S, Cao Y, Yan Q, Van Hoorde K, Nguyen S, Cooney S, Gopinath GR, Tall BD, Sivasankaran SK, Lehner A, Stephan R, Fanning S (2019年1月). 「RNAシーケンシングに基づくCronobacter sakazakii SP291の乾燥耐性に関する転写概要」.応用環境微生物学. 85 (3). Bibcode :2019ApEnM..85E1993S. doi :10.1128/AEM.01993-18. PMC 6344630. PMID 30446557  . 
  5. ^ Cao Y, Dever K, Van Hoorde K, Sivasankaran SK, Nguyen SV, Macori G, Naithani A, Gopinath GR, Tall B, Lehner A, Stephan R, Srikumar S, Fanning S (2021年11月). 「転写ランドスケープの変化が臨床クロノバクター・サカザキイにおける異なる乾燥耐性を可能にする」.応用環境微生物学. 87 (24): e0083021. Bibcode :2021ApEnM..87E.830C. doi :10.1128/AEM.00830-21. PMC 8612285. PMID 34644165  . 
  6. ^ Hunter, Catherine J.; Petrosyan, Mikael; Ford, Henri R.; Prasadarao, Nemani V. (2017-04-28). 「エンテロバクター・サカザキ：乳児および新生児における新たな病原体」.外科感染症. 9 (5): 533– 539. doi :10.1089/sur.2008.006. ISSN  1096-2964. PMC 2579942. PMID 18687047  . 
  7. ^ ab 米国疾病予防管理センター（CDC）（2002年4月）「粉ミルクの使用に関連するエンテロバクター・サカザキ感染症 ― テネシー州、2001年」MMWR. 疾病・死亡率週報. 51 (14): 297–300 . PMID  12002167.全文無料
  8. ^ Lai KK (2001年3月). 「新生児、乳児、小児、成人におけるエンテロバクター・サカザキ感染症。症例報告と文献レビュー」. Medicine . 80 (2): 113–22 . doi : 10.1097/00005792-200103000-00004 . PMID  11307587. S2CID  7515008.
  9. ^ Bowen AB, Braden CR (2006年8月). 「乳児における侵襲性エンテロバクター・サカザキイ感染症」. Emerging Infectious Diseases . 12 (8): 1185–9 . doi :10.3201/eid1208.051509. PMC 3291213. PMID 16965695  . 
  10. ^ Caubilla-Barron J, Forsythe S (2007). 「乾燥乳児用調製粉乳における乾燥ストレスとEnterobacter sakazakiiおよびその他の腸内細菌科細菌の生存時間」『食品保護ジャーナル』13 : 467–472 .
  11. ^ 上田 茂子 (2017-01-01). 「乾燥食品、生鮮野菜、土壌におけるクロノバクター属細菌の発生」.生物防除科学. 22 (1): 55– 59. doi : 10.4265/bio.22.55 . ISSN  1884-0205. PMID  28367871.
  12. ^ 「FDAによるKotexタンポンのリコール」Seeger Weiss LLP. 2011年11月16日. 2014年9月5日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2012年2月29日閲覧。
  13. ^ Baldwin A, Loughlin M, Caubilla-Baron J, Kucerova E, Manning G, Dowson C, Forsythe S (2009). 「Cronobacter sakazakiiおよびCronobacter malonaticusの多座配列タイピングにより、バイオタイプとは相関しない臨床的意義を持つ安定したクローン構造が明らかになった」BMC Microbiology . 9 : 223. doi : 10.1186/1471-2180-9-223 . PMC 2770063. PMID  19852808 . 
  14. ^ Joseph S, Forsythe SJ (2011). 「クロノバクター・サカザキST4と新生児感染症の関連性」. Emerging Infectious Diseases . 17 (9): 1713–5 . doi :10.3201/eid1709.110260. PMC 3322087. PMID  21888801 . 
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  16. ^ ab Iversen C、Lehner A、Mullane N、Bidlas E、Cleenwerck I、Marugg J、Fanning S、Stephan R、Joosten H (2007)。 「エンテロバクター・サカザキの分類学：クロノバクター・サカザキ新属の提案（11月）とクロノバクター・サカザキ・コム（11月）の説明。クロノバクター・サカザキ亜種サカザキ（11月）、クロノバクター・サカザキ亜種（マロナティカス）11月、クロノバクター・ツリセンシス・エスピー（11月）、クロノバクター」 muytjensii sp. nov.、Cronobacter dublinensis sp. 11. BMC進化生物学。7 (1): 64. Bibcode :2007BMCEE...7...64I. doi : 10.1186/1471-2148-7-64 . PMC 1868726 . PMID  17439656. 
  17. ^ Henry, Ronnie (2018年11月). 「Cronobacter sakazakiiの語源」. Emerg Infect Dis . 24 (11): 2124. doi : 10.3201/eid2411.et2411 . PMC 6199989 . 
  • クロノバクターに関する国際会議
  • BacDive（細菌多様性メタデータデータベース）におけるCronobacter sakazakiiの標準株
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