ctRNA

ctRNA
ctRNA
	ctRNA_p42dの予測される二次構造と配列の保存性
識別子
シンボル	ctRNA_p42d
Rfam	RF00489
その他のデータ
RNA型	遺伝子;アンチセンス
ドメイン	細菌
それで	SO:0000644
PDB構造	PDBe

RNAファミリー

分子生物学において、ctRNA（counter-transcribed RNA）はプラスミドにコードされた非コードRNAであり、repBのmRNAに結合して翻訳阻害を引き起こす。^[1] ctRNAはプラスミドにコードされ、ローリングサークル複製において低コピー数を維持する機能を持つ。コリネバクテリウム・グルタミカムでは、複製開始タンパク質であるRepBのmRNAとのアンチセンス対合によってこれを実現する。^[1]エンテロコッカス・フェシウム では、プラスミドpJB01にcopA、repB、repCの3つのオープンリーディングフレームが含まれる。pJB01 ctRNAはcopA/repB遺伝子間領域とは反対の鎖にコードされており、repBの非定型リボソーム結合部位と部分的に重複している。^[2]

参照

S要素

参考文献

^ ab Venkova-Canova, T; Patek M; Nesvera J (2003). 「Corynebacterium glutamicum由来プラスミドpGA1におけるrep遺伝子発現の制御」J Bacteriol . 185 (8): 2402– 2409. doi :10.1128/JB.185.8.2402-2409.2003. PMC 152619. PMID 12670963 .
^ Kim SW, Jeong IS, Jeong EJ, et al. (2008年7月). 「プラスミドpJB01のctRNAの末端および内部ヘアピンループはコピー数制御において重要な役割を果たす」. Mol. Cells . 26 (1): 26– 33. PMID 18511887.

外部リンク

RfamのctRNA_pGA1のページ
RfamのctRNA_p42dのページ
RfamのctRNA_pND324のページ
RfamのctRNA_pT181のページ

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[Ven03-1] Venkova-Canova, T; Patek M; Nesvera J (2003). 「Corynebacterium glutamicum由来プラスミドpGA1におけるrep遺伝子発現の制御」J Bacteriol . 185 (8): 2402– 2409. doi :10.1128/JB.185.8.2402-2409.2003. PMC 152619. PMID 12670963 .

[pmid18511887-2] Kim SW, Jeong IS, Jeong EJ, et al. (2008年7月). 「プラスミドpJB01のctRNAの末端および内部ヘアピンループはコピー数制御において重要な役割を果たす」. Mol. Cells . 26 (1): 26– 33. PMID 18511887.