デプシペプチド
ペプチドの種類

デプシペプチドは、 1つ以上のアミド基（-C(O)NHR-）が対応するエステル基（-C(O)OR-）に置き換えられたペプチドである。 [1]多くのデプシペプチドは、ペプチド結合とエステル結合の両方を有する。[2]ペプチド構造中のN–H基の除去は、ペプチドの二次構造と折り畳みパターンに関与する水素結合能力の低下をもたらし、その結果、ヘリックスとβシート構造の構造変形を誘発する。[2] [3]アミドに比べてエステルの共鳴非局在化が低下するため、デプシペプチドはシス-トランス異性化の回転障壁が低くなり、そのため天然類似体よりも柔軟な構造を有する。[2] [3]これらは主に海洋および微生物の天然物に見られる。[4]

3つのアミド基（青色で強調表示）と1つのエステル基（緑色で強調表示）を持つデプシペプチドの例。R 1および R 3は、α-ヒドロキシカルボン酸に見られる有機基（例：メチル基）または水素原子です。R 2、R 4、および R 5は、一般的なアミノ酸に見られる有機基または水素原子です。

デプシペプチド天然物

エンテロケリンは鉄輸送体であるデプシペプチドである。[5]

いくつかのデプシペプチドは抗癌作用を示すことが分かっている。[6]

デプシペプチド酵素阻害剤には、二環式ペプチドクラスに属するロミデプシンが含まれます。ロミデプシンは、ヒストン脱アセチル化酵素阻害剤（HDACi）として知られています。ロミデプシンは、藤沢薬品工業株式会社によってクロモバクテリウム・ビオラセウム（Chromobacterium v​​iolaceum）の発酵産物として初めて単離されました。 [7]

ストレプトグラミン、特にストレプトグラミンB抗生物質は、細菌リボソームの50Sサブユニットに結合するデプシペプチドである。 [8] エタマイシンは、2010年の予備データで、マウスモデルにおいてMRSAに対する強力な活性を示した。 [9]

ストレプトマイセス由来のいくつかのデプシペプチドは抗菌活性を示す。[10] [11]これらは、アシルデプシペプチド（ ADEP ）として知られる、新たな抗生物質の潜在的クラスを形成する。ADEPはカゼイン溶解性プロテアーゼ（ ClpP ）を標的として活性化し、制御不能なペプチドおよび未折り畳みタンパク質の分解を開始し、多くのグラム陽性細菌を死滅させる。[12] [13] [14]

デプシペプチドはパッセリーニ反応によって形成される。[15]

参考文献

  1. ^ IUPAC ,化学用語集第5版（ゴールドブック）（2025年）。オンライン版：（2006年以降）「デプシペプチド」。doi : 10.1351/goldbook.D01604
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  8. ^ Aronson, JK編 (2016). 「ストレプトグラミン」. Meyler著『薬物の副作用』p. 499. doi :10.1016/B978-0-444-53717-1.01472-4. ISBN 978-0-444-53716-4ストレプトグラミン[1]は、ストレプトグラミンAとストレプトグラミンBの2種類の抗生物質からなるクラスです。A群およびB群のストレプトグラミンは、それぞれ細菌の70Sリボソームの50Sサブユニットに可逆的に結合することで、それぞれ単独では殺菌作用を示します。しかし、各グループのストレプトグラミンを併用すると、相乗効果と殺菌作用を示します。
  9. ^ 急げ、ニーナ・M;ペレラ、ヴァラヘナゲ R;マロニー、キャサリンN;トラン、ダン・N;ジェンセン、ポール。フェニカル、ウィリアム。ニゼット、ヴィクトル。メアリー E ヘンスラー (2010)。 「メチシリン耐性黄色ブドウ球菌に対するストレプトグラミン系抗生物質エタマイシンの活性」。抗生物質ジャーナル。63 (5): 219–24 .土井:10.1038/ja.2010.22。PMC 2889693。PMID  20339399。 
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さらに読む

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