ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
| DNM1 |
|---|
 |
| 利用可能な構造 |
|---|
| PDB | オーソログ検索: PDBe RCSB |
|---|
| PDB IDコードのリスト |
|---|
1DYN、2DYN、2X2E、2X2F、3SNH、3ZYC、3ZYS、4UUD、4UUK、5D3Q |
|
|
| 識別子 |
|---|
| エイリアス | DNM1、ダイナミン-1、DNM、EIEE31、ダイナミン1、DEE31 |
|---|
| 外部ID | オミム: 602377; MGI : 107384;ホモロジーン: 123905;ジーンカード:DNM1; OMA :DNM1 - オルソログ |
|---|
|
| 遺伝子の位置(マウス) |
|---|
 | | キリスト | 染色体2(マウス)[2] |
|---|
| | バンド | 2 B|2 22.09 cM | 始める | 32,198,483 bp [2] |
|---|
| 終わり | 32,243,350 bp [2] |
|---|
|
| RNA発現パターン |
|---|
| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
|---|
| 上位の表現 | - 小脳の右半球
- ブロードマン領域10
- 中側頭回
- 上前頭回
- 右前頭葉
- 前頭極
- 小脳の傍小葉
- 頭頂葉
- ブロードマン領域46
- 中心後回
|
| | 上位の表現 | - CA3領域
- 嗅内皮質
- 嗅周皮質
- 海馬歯状回顆粒細胞
- 上前頭回
- 帯状回
- 小脳皮質
- 中脳の中心灰白質
- 橋核
- 前頭前皮質
|
| | より多くの参照表現データ |
|
|---|
| バイオGPS |  | | より多くの参照表現データ |
|
|---|
|
| 遺伝子オントロジー |
|---|
| 分子機能 |
- ヌクレオチド結合
- タンパク質二量体化活性
- GTP結合
- タンパク質結合
- 加水分解酵素活性
- タンパク質キナーゼ結合
- 微小管結合
- RNA結合
- GTPase活性
- タンパク質C末端結合
- D2ドーパミン受容体結合
- タンパク質含有複合体結合
- 一酸化窒素合成酵素結合
- 同一のタンパク質結合
- SH3ドメイン結合
| | 細胞成分 |
- 細胞質
- 光受容体内節
- ミエリン鞘
- シナプス
- 膜コート
- 微小管
- 細胞骨格
- 細胞外エクソソーム
- ミトコンドリア膜
- ゴルジ体
- 細胞膜
- シナプス小胞
- 静脈瘤
- 核
- 核質
- シナプス後密度
- 膜
- 軸索
- 細胞質小胞
- タンパク質含有複合体
- 樹状突起棘
- 樹状突起棘頭
- シナプス後膜
- 光受容体リボンシナプス
- シナプス前エンドサイトーシス領域膜
- シナプス後エンドサイトーシス層膜
- グルタミン酸作動性シナプス
| | 生物学的プロセス |
- エンドサイトーシス
- エフリン受容体シグナル伝達経路
- 成体の運動行動
- シナプス伝達、GABA作動性
- 毒素輸送
- 聴覚
- タンパク質四量体化
- エンドソーム組織
- クラスリン依存性エンドサイトーシス
- ミトコンドリア分裂
- ミトコンドリア分裂に関与するダイナミンファミリータンパク質の重合
- 膜融合
- シナプス前エンドサイトーシス領域膜からのシナプス小胞の出芽
- Gタンパク質共役受容体の内在化
- 受容体介在性エンドサイトーシス
- 受容体の内在化
- シナプス小胞リサイクルの正の調節
- シナプス小胞エンドサイトーシス
- シナプスの構造または活動の調節
- 化学シナプス伝達の調節
- シナプス後神経伝達物質受容体の内在化
- シナプス小胞エンドサイトーシスの調節
- シナプス小胞エンドサイトーシスの正の調節
- アミロイドβへの反応
| | 出典:Amigo / QuickGO |
|
| オーソログ |
|---|
| 種 | 人間 | ねずみ |
|---|
| エントレズ | | |
|---|
| アンサンブル | | |
|---|
| ユニプロット | | |
|---|
| RefSeq (mRNA) | NM_001005336 NM_001288737 NM_001288738 NM_001288739 NM_004408
|
|---|
NM_001374269 |
| |
|---|
NM_001301737 NM_010065 NM_001368679 |
|
|---|
| RefSeq(タンパク質) | NP_001005336 NP_001275666 NP_001275667 NP_001275668 NP_004399
|
|---|
NP_001361198 |
| |
|---|
NP_001288666 NP_034195 NP_001355608 |
|
|---|
| 場所(UCSC) | 9章: 128.19 – 128.26 MB | 2章: 32.2 – 32.24 Mb |
|---|
| PubMed検索 | [3] | [4] |
|---|
|
| ウィキデータ |
|
ダイナミン-1は、ヒトではDNM1遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
関数
ダイナミンは、管状化や膜の切断に用いられる独自の機械化学的特性を有し、クラスリンを介したエンドサイトーシスやその他の小胞輸送プロセスに関与しています。アクチンやその他の細胞骨格タンパク質はダイナミンの結合パートナーとして機能し、ダイナミンは自己集合してGTPase活性を刺激します。この遺伝子の3'領域は、ゲノム上の他の場所、特にY染色体と15染色体に60以上の高度に保存されたコピーが存在します。異なるアイソフォームをコードする選択的スプライシング転写バリアントが報告されています。[7]
病気における役割
DNM1遺伝子のde novo変異は、発達性てんかん性脳症と呼ばれる重篤な小児てんかんと関連しています。病原性変異の多くはミスセンス変異であり、シナプス小胞 エンドサイトーシスを優性負性に阻害することが示されている。[8]
相互作用
DNM1 は以下と相互作用することが示されています。
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000106976 – Ensembl、2017年5月
- ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000026825 – Ensembl、2017年5月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ Obar RA, Collins CA, Hammarback JA, Shpetner HS, Vallee RB (1990年10月). 「微小管関連メカノケミカル酵素ダイナミンの分子クローニングにより、新たなGTP結合タンパク質ファミリーとの相同性が明らかになった」. Nature . 347 (6290): 256–61 . Bibcode :1990Natur.347..256O. doi :10.1038/347256a0. PMID 2144893. S2CID 4264539.
- ^ Newman-Smith ED, Shurland DL, van der Bliek AM (1997年7月). 「蛍光in situハイブリダイゼーションおよび体細胞ハイブリッド解析によるダイナミン1遺伝子(DNM1)のヒト染色体9q34への割り当て」. Genomics . 41 (2): 286–9 . doi :10.1006/geno.1996.4596. PMID 9143509.
- ^ 「Entrez Gene: DNM1 ダイナミン 1」。
- ^ Dhindsa RS, Bradrick SS, Yao X, Heinzen EL, Petrovski S, Krueger BJ, et al. (2015年6月). 「てんかん性脳症を引き起こすDNM1遺伝子変異はシナプス小胞エンドサイトーシスを阻害する」. Neurology. Genetics . 1 (1): e4. doi :10.1212/01.NXG.0000464295.65736.da. PMC 4821085. PMID 27066543 .
- ^ ab Micheva KD, Kay BK, McPherson PS (1997年10月). 「シナプトジャニンは神経終末において2つの別々の複合体を形成する。エンドフィリンおよびアンフィフィシンとの相互作用」J. Biol. Chem . 272 (43): 27239–45 . doi : 10.1074/jbc.272.43.27239 . PMID 9341169.
- ^ Wigge P, Köhler K, Vallis Y, Doyle CA, Owen D, Hunt SP, McMahon HT (1997年10月). 「アンフィフィシンヘテロダイマー:クラスリン介在エンドサイトーシスにおける潜在的役割」Mol. Biol. Cell . 8 (10): 2003–15 . doi :10.1091/mbc.8.10.2003. PMC 25662. PMID 9348539 .
- ^ McMahon HT, Wigge P, Smith C (1997年8月). 「クラスリンはアンフィフィシンと特異的に相互作用し、ダイナミンによって置換される」. FEBS Lett . 413 (2): 319–22 . doi :10.1016/s0014-5793(97)00928-9. PMID 9280305. S2CID 42520828.
- ^ Chen-Hwang MC, Chen HR, Elzinga M, Hwang YW (2002年5月). 「ダイナミンはミニブレインキナーゼであり、Yak1関連キナーゼ1Aの二重特異性基質である」. J. Biol. Chem . 277 (20): 17597–604 . doi : 10.1074/jbc.M111101200 . PMID 11877424.
- ^ Grabs D, Slepnev VI, Songyang Z, David C, Lynch M, Cantley LC, De Camilli P (1997年5月). 「アンフィフィシンのSH3ドメインは、ダイナミンのプロリンリッチドメインに単一の部位で結合し、新たなSH3結合コンセンサス配列を定義する」. J. Biol. Chem . 272 (20): 13419–25 . doi : 10.1074/jbc.272.20.13419 . PMID 9148966.
- ^ ab 神岡雄三、福原聡、澤 浩、長島 健、増田 正之、松田 正治、望月 暢(2004年9月). 「新規ダイナミン会合分子、フォルミン結合タンパク質17は管状膜陥入を誘導し、エンドサイトーシスに関与する」. J. Biol. Chem . 279 (38): 40091–9 . doi : 10.1074/jbc.M404899200 . PMID 15252009.
- ^ Miki H, Miura K, Matuoka K, Nakata T, Hirokawa N, Orita S, Kaibuchi K, Takai Y, Takenawa T (1994年2月). "Srcホモロジー3ドメインを介したAsh/Grb-2とダイナミンの会合". J. Biol. Chem . 269 (8): 5489–92 . doi : 10.1016/S0021-9258(17)37484-7 . PMID 8119878.
- ^ Sastry L, Cao T, King CR (1997年1月). 「ヒト癌細胞における多重Grb2タンパク質複合体」. Int. J. Cancer . 70 (2): 208–13 . doi : 10.1002/(sici)1097-0215(19970117)70:2<208::aid-ijc12>3.0.co;2-e . PMID 9009162. S2CID 10317185.
- ^ Wunderlich L, Faragó A, Buday L (1999年1月). 「NckとSosおよびダイナミンとの相互作用の特性評価」. Cell. Signal . 11 (1): 25–9 . doi :10.1016/s0898-6568(98)00027-8. PMID 10206341.
- ^ Modregger J, Ritter B, Witter B, Paulsson M, Plomann M (2000年12月). 「3つのPACSINアイソフォームはすべてエンドサイトーシスタンパク質に結合し、エンドサイトーシスを阻害する」. J. Cell Sci . 113 (24): 4511–21 . doi :10.1242/jcs.113.24.4511. PMID 11082044.
- ^ Modregger J, Schmidt AA, Ritter B, Huttner WB, Plomann M (2003年2月). 「エンドフィリンB1bの特性解析:エンドフィリンA1とは異なる特性を持つ脳特異的膜結合型リゾホスファチジン酸アシルトランスフェラーゼ」J. Biol. Chem . 278 (6): 4160–7 . doi : 10.1074/jbc.M208568200 . PMID 12456676.
さらに読む
- Sever S (2003). 「ダイナミンとエンドサイトーシス」. Curr. Opin. Cell Biol . 14 (4): 463–7 . doi :10.1016/S0955-0674(02)00347-2. PMID 12383797.
- Wiejak J, Wyroba E (2003). 「ダイナミン:特性、作用機序および機能」. Cell. Mol. Biol. Lett . 7 (4): 1073–80 . PMID 12511974.
- Orth JD, McNiven MA (2003). 「アクチン-膜界面におけるダイナミン」. Curr. Opin. Cell Biol . 15 (1): 31–9 . doi :10.1016/S0955-0674(02)00010-8. PMID 12517701.
- Timm D, Salim K, Gout I, et al. (1995). 「ダイナミン由来のプレクストリン相同ドメインの結晶構造」Nat. Struct. Biol . 1 (11): 782–8 . doi :10.1038/nsb1194-782. PMID 7634088. S2CID 1454909.
- Downing AK, Driscoll PC, Gout I, et al. (1995). 「ダイナミン由来プレクストリン相同ドメインの3次元溶液構造」. Curr. Biol . 4 (10): 884–91 . doi :10.1016/S0960-9822(00)00197-4. PMID 7850421. S2CID 37072095.
- Ferguson KM, Lemmon MA, Schlessinger J, Sigler PB (1994). 「ヒトダイナミン由来プレクストリン相同ドメインの2.2Å分解能における結晶構造」. Cell . 79 (2): 199– 209. doi :10.1016/0092-8674(94)90190-2. PMID 7954789. S2CID 33767806.
- van der Bliek AM, Redelmeier TE, Damke H, et al. (1993). 「ヒトダイナミンの変異は被覆小胞形成の中間段階を阻害する」J. Cell Biol . 122 (3): 553– 63. doi :10.1083/jcb.122.3.553. PMC 2119674. PMID 8101525 .
- 三木 浩、三浦 健、松岡 健、他 (1994). 「Srcホモロジー3ドメインを介したAsh/Grb-2とダイナミンの会合」J. Biol. Chem . 269 (8): 5489–92 . doi : 10.1016/S0021-9258(17)37484-7 . PMID 8119878.
- 丸山 憲治, 菅野 誠 (1994). 「オリゴキャッピング:真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置換する簡便法」.遺伝子. 138 ( 1–2 ): 171–4 . doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Sontag JM, Fykse EM, Ushkaryov Y, et al. (1994). 「複数のダイナミンの差次的発現と制御」J. Biol. Chem . 269 (6): 4547–54 . doi : 10.1016/S0021-9258(17)41812-6 . PMID 8308025.
- Grabs D, Slepnev VI, Songyang Z, et al. (1997). 「アンフィフィシンのSH3ドメインはダイナミンのプロリンリッチドメインに単一の部位で結合し、新たなSH3結合コンセンサス配列を定義する」J. Biol. Chem . 272 (20): 13419–25 . doi : 10.1074/jbc.272.20.13419 . PMID 9148966.
- Ramjaun AR, Micheva KD, Bouchelet I, McPherson PS (1997). 「神経終末に富むアンフィフィシンアイソフォームの同定と特性解析」J. Biol. Chem . 272 (26): 16700–6 . doi : 10.1074/jbc.272.26.16700 . PMID 9195986.
- Ringstad N, Nemoto Y, De Camilli P (1997). 「SH3p4/Sh3p8/SH3p13タンパク質ファミリー:Grb2様Srcホモロジー3ドメインを介したシナプトジャニンおよびダイナミンの結合パートナー」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 94 (16): 8569–74 . Bibcode :1997PNAS...94.8569R. doi : 10.1073/pnas.94.16.8569 . PMC 23017. PMID 9238017 .
- McMahon HT, Wigge P, Smith C (1997). 「クラスリンはアンフィフィシンと特異的に相互作用し、ダイナミンによって置換される」. FEBS Lett . 413 (2): 319–22 . doi :10.1016/S0014-5793(97)00928-9. PMID 9280305. S2CID 42520828.
- Wigge P, Köhler K, Vallis Y, et al. (1997). 「アンフィフィシンヘテロダイマー:クラスリン介在エンドサイトーシスにおける潜在的役割」Mol. Biol. Cell . 8 (10): 2003–15 . doi :10.1091/mbc.8.10.2003. PMC 25662. PMID 9348539 .
- 鈴木雄三、中川吉智、丸山健、他 (1997). 「全長エンリッチドcDNAライブラリーおよび5'末端エンリッチドcDNAライブラリーの構築と特性解析」. Gene . 200 ( 1–2 ): 149–56 . doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
- Witke W, Podtelejnikov AV, Di Nardo A, et al. (1998). 「マウス脳において、プロフィリンIおよびプロフィリンIIはエンドサイトーシス経路およびアクチンアセンブリーの制御因子と関連する」EMBO J. 17 ( 4): 967–76 . doi :10.1093/emboj/17.4.967. PMC 1170446. PMID 9463375 .
- Slepnev VI, Ochoa GC, Butler MH, et al. (1998). 「エンドサイトーシスコート複合体の集合制御におけるリン酸化の役割」. Science . 281 (5378): 821–4 . Bibcode :1998Sci...281..821S. doi :10.1126/science.281.5378.821. PMID : 9694653.