デハロココイディア

デハロココイディア
科学的分類
ドメイン：	細菌
王国：	バチラッティ
門:	クロロフレクソタ
クラス：	デハロココイディア; ・レフラーら 2013
注文：	デハロコッコイダルス; Löffler et al. 2013
家族：	Dehalococcoidaceae ; Löffler et al. 2013年
属
	デハロコッコイデス・レフラー他 2013; デハロゲニモナス Moe et al. 2009;
同義語
	「デハロコッコイデス」ヒューゲンホルツとスタッケブラント 2004 ;

細菌の種類

デハロコッコイディアは、細菌門の一つであるクロロフレクソタ門に属する。DHC群としても知られる。^[3]

Dehalococcoidetesという名称は、 1997年に部分的に記載された種であるDehalococcoides ethenogenesにちなんで、HugenholtzとStackebrandt（2004）によって付けられた仮名である。^[4]一方、この綱に属する最初の種は、Moeら（2009）によって完全に記載されたDehalogenimonas lykanthroporepellensであったが、名称の修正は行われなかった。^[5]^[6]^[7]

特徴

デハロコッコイデス・エテノゲネスとデハロゲニモナス・リカントロポレペレンスの両種は、テトラクロロエテン、トリクロロプロパン、トリクロロエタン、ジクロロプロパン、ジクロロエタンなどのポリ塩化脂肪族アルカンおよびアルケンを脱ハロゲン化できる不規則球状細菌である。^[8]

クロロフレクソタ門に属する菌の特徴の一つに、珍しい細胞壁構造がある。単皮細胞ではあるものの、ペプチドグリカンの存在や構造に大きなばらつきがあり、その結果、多くの菌がグラム陰性菌とグラム陽性菌に染まる。^[9] デハロコッコイデス属の両種はグラム陰性菌に染まるが、ペプチドグリカンを欠き、代わりに擬似ペプチドグリカン^{[疑わしい-議論] (S層) を有している（ペプチドグリカンを攻撃する抗生物質}アンピシリンとバンコマイシンに耐性。小麦胚芽凝集素は結合せず、リゾチームも作用しない）。^{[検証失敗]}^[4]^[5]^[10]

参照

参考文献

^ abc ロフラー FE、ヤン J、リタラハティ KM、エイドリアン L、エドワーズ EA、コンスタンティニディス KT、ミュラー JA、フラートン H、ジンダー SH、スポルマン AM (2013)。「Dehalococcoides mccartyi gen. nov., sp. nov.、ハロゲンサイクリングとバイオレメディエーションに関連する偏性有機ハロゲン化物呼吸嫌気性細菌は、Chloroflexi門内の新規細菌綱、 Dehalococcoidia classis nov.、Dehalococcoidales ord. nov. およびDehalococcoidaceae fam. nov. に属します。」。Int J Syst Evol 微生物。63 (Pt 2): 625–635。土井:10.1099/ijs.0.034926-0。PMID 22544797。
^ Hugenholtz, P.; Stackebrandt, E. (2004). 「Sphaerobacter thermophilus の Actinobacteria 門 Sphaerobacteridae 亜綱から Chloroflexi 門 Thermomicrobia 綱（修正記述）への再分類」（International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology）. 54 (6): 2049– 2051. doi : 10.1099/ijs.0.03028-0 . PMID 15545432.
^ Lebron, CA; Petrovskis, E.; Loeffler, F. & Henn, K. (2011). 「ガイダンスプロトコル：塩素化溶媒処理施設における自然減衰（MNA）、バイオスティミュレーション、バイオオーグメンテーションのモニタリングのための核酸ベースツールの適用」（PDF） . {{cite journal}}:ジャーナルを引用するには|journal=（ヘルプ）が必要です
^ ab Maymo-Gatell, X.; Chien, Y.; Gossett, JM; Zinder, SH (1997). 「テトラクロロエチレンを還元的に脱塩素化してエチレンにする細菌の分離」. Science . 276 (5318): 1568– 1571. doi :10.1126/science.276.5318.1568. PMID 9171062.
^ ab Moe WM; Yan J.; Nobre MF; Da Costa MS; Rainey FA (2009). 「塩素化溶媒に汚染された地下水から分離された還元脱ハロゲン化細菌、新属新種Dehalogenimonas lykanthroporepellens」. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 59 (11): 2692– 2697. doi : 10.1099/ijs.0.011502-0 . PMID 19625421.
^ LPSNにおける分類；Parte, Aidan C.；Sardà Carbasse, Joaquim；Meier-Kolthoff, Jan P.；Reimer, Lorenz C.；Göker, Markus（2020年11月1日）「命名法上の地位を有する原核生物名リスト（LPSN）がDSMZに移行」International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 70 (11): 5607– 5612. doi : 10.1099/ijsem.0.004332 .
^ LPSNのDehalogenimonas ; Parte, Aidan C.; Sardà Carbasse, Joaquim; Meier-Kolthoff, Jan P.; Reimer, Lorenz C.; Göker, Markus (2020年11月1日). 「List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) moves to the DSMZ」. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 70 (11): 5607– 5612. doi : 10.1099/ijsem.0.004332 .
^ Maymo-Gatell X, Chien Y, Gossett JM, Zinder SH (1997). 「テトラクロロエチレンを還元的に脱塩素化してエチレンに変換する細菌の分離」. Science . 276 (5318): 1568– 1571. doi :10.1126/science.276.5318.1568. PMID 9171062.
^ ドン・J・ブレナー、ノエル・R・クリーグ、ジェームズ・T・ステイリー（2005年7月26日）[1984年（ウィリアムズ＆ウィルキンス）]。ジョージ・M・ギャリティ編。『細菌学入門』第2A巻（第2版）。ニューヨーク：シュプリンガー。304ページ。ISBN 978-0-387-24143-2大英図書館番号GBA561951。
^ Fazi, S.; Aulenta, F.; Majone, M.; Rossetti, S. (2008). 「蛍光in situハイブリダイゼーションと触媒レポーター沈着によるDehalococcoides属細菌の定量分析の改善」. Systematic and Applied Microbiology . 31 (1): 62– 67. doi :10.1016/j.syapm.2007.11.001. PMID 18249080.

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[Löffler-1] ロフラー FE、ヤン J、リタラハティ KM、エイドリアン L、エドワーズ EA、コンスタンティニディス KT、ミュラー JA、フラートン H、ジンダー SH、スポルマン AM (2013)。「Dehalococcoides mccartyi gen. nov., sp. nov.、ハロゲンサイクリングとバイオレメディエーションに関連する偏性有機ハロゲン化物呼吸嫌気性細菌は、Chloroflexi門内の新規細菌綱、 Dehalococcoidia classis nov.、Dehalococcoidales ord. nov. およびDehalococcoidaceae fam. nov. に属します。」。Int J Syst Evol 微生物。63 (Pt 2): 625–635。土井:10.1099/ijs.0.034926-0。PMID 22544797。

[2] Hugenholtz, P.; Stackebrandt, E. (2004). 「Sphaerobacter thermophilus の Actinobacteria 門 Sphaerobacteridae 亜綱から Chloroflexi 門 Thermomicrobia 綱（修正記述）への再分類」（International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology）. 54 (6): 2049– 2051. doi : 10.1099/ijs.0.03028-0 . PMID 15545432.

[3] Lebron, CA; Petrovskis, E.; Loeffler, F. & Henn, K. (2011). 「ガイダンスプロトコル：塩素化溶媒処理施設における自然減衰（MNA）、バイオスティミュレーション、バイオオーグメンテーションのモニタリングのための核酸ベースツールの適用」（PDF） . {{cite journal}}:ジャーナルを引用するには|journal=（ヘルプ）が必要です

[Dehalococcoides-4] Maymo-Gatell, X.; Chien, Y.; Gossett, JM; Zinder, SH (1997). 「テトラクロロエチレンを還元的に脱塩素化してエチレンにする細菌の分離」. Science . 276 (5318): 1568– 1571. doi :10.1126/science.276.5318.1568. PMID 9171062.

[Dehalogenimonas-5] Moe WM; Yan J.; Nobre MF; Da Costa MS; Rainey FA (2009). 「塩素化溶媒に汚染された地下水から分離された還元脱ハロゲン化細菌、新属新種Dehalogenimonas lykanthroporepellens」. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 59 (11): 2692– 2697. doi : 10.1099/ijs.0.011502-0 . PMID 19625421.

[6] LPSNにおける分類；Parte, Aidan C.；Sardà Carbasse, Joaquim；Meier-Kolthoff, Jan P.；Reimer, Lorenz C.；Göker, Markus（2020年11月1日）「命名法上の地位を有する原核生物名リスト（LPSN）がDSMZに移行」International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 70 (11): 5607– 5612. doi : 10.1099/ijsem.0.004332 .

[7] LPSNのDehalogenimonas ; Parte, Aidan C.; Sardà Carbasse, Joaquim; Meier-Kolthoff, Jan P.; Reimer, Lorenz C.; Göker, Markus (2020年11月1日). 「List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) moves to the DSMZ」. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 70 (11): 5607– 5612. doi : 10.1099/ijsem.0.004332 .

[science-8] Maymo-Gatell X, Chien Y, Gossett JM, Zinder SH (1997). 「テトラクロロエチレンを還元的に脱塩素化してエチレンに変換する細菌の分離」. Science . 276 (5318): 1568– 1571. doi :10.1126/science.276.5318.1568. PMID 9171062.

[Bergey-9] ドン・J・ブレナー、ノエル・R・クリーグ、ジェームズ・T・ステイリー（2005年7月26日）[1984年（ウィリアムズ＆ウィルキンス）]。ジョージ・M・ギャリティ編。『細菌学入門』第2A巻（第2版）。ニューヨーク：シュプリンガー。304ページ。ISBN 978-0-387-24143-2大英図書館番号GBA561951。

[10] Fazi, S.; Aulenta, F.; Majone, M.; Rossetti, S. (2008). 「蛍光in situハイブリダイゼーションと触媒レポーター沈着によるDehalococcoides属細菌の定量分析の改善」. Systematic and Applied Microbiology . 31 (1): 62– 67. doi :10.1016/j.syapm.2007.11.001. PMID 18249080.