ダームシジン

DCD
利用可能な構造
PDBヒトUniProt検索：PDBe RCSB
識別子
エイリアスDCD、AIDD、DCD-1、DSEP、HCAP、PIF、ダームシジン
外部IDオミム：606634;ホモロジーン: 89039;ジーンカード：DCD; OMA :DCD - オルソログ
オーソログ
種人間ねずみ
エントレズ

117159

該当なし

アンサンブル

ENSG00000161634

該当なし

ユニプロット

P81605

該当なし

RefSeq (mRNA)

NM_053283
NM_001300854

該当なし

RefSeq（タンパク質）

NP_001287783
NP_444513

該当なし

場所（UCSC）12章: 54.64 – 54.65 Mb該当なし
PubMed検索[2]該当なし
ウィキデータ
人間の表示/編集

ダームシジンは110個のアミノ酸からなるタンパク質で、ヒトではDCD 遺伝子によってコードされています。[3] [4]全長タンパク質は、タンパク質分解誘導因子（PIF）やその他の抗菌 ペプチドなどの派生ペプチドを産生します。[4]これらは、免疫系の自然宿主防御の一環として、ヒトのエクリン汗腺から皮膚に分泌されます。PIFは筋肉のタンパク質分解に関与しています。 [4]

関数

デルムシジンは分泌タンパク質であり、その後、異なる生物学的活性を有する成熟ペプチドへと処理されます。C末端ペプチドは汗中に恒常的に発現し、抗菌・抗真菌活性を有します。拡散性生存回避ペプチドとしても知られるN末端ペプチドは、重度の酸化ストレス下における神経細胞の生存を促進します。N末端ペプチドのグリコシル化型は、癌患者の悪液質（筋萎縮）と関連している可能性があります。[4] 

      生存回避ペプチド                           抗菌ペプチド

YDPEAASAPGSGNPCHEASAAQKENAGEDPGLARQAPKPRKQR SSLLEKGLDGAKKAVGGLGKLGKDAVEDLESVGKGAVHDVKDVLDSVL

C末端前駆体DCD-1Lは48残基からなるペプチドで、溶液中で部分的ならせん構造を示すことがNMRおよびCD分光法による溶液構造の決定によって証明されている。全長前駆体は、ヒトの汗中に存在する未同定のプロテアーゼによって処理され、様々な抗菌活性を示す複数の短いペプチドを形成する。これらのペプチドは、C末端のアミノ酸トリプレットと残基長に基づいて命名されている。そのような活性ペプチドの一つがSSL25であり、DCD-1Lと比較して大腸菌に対する活性が2倍に増加している。[5] 

DCD-1L SSLLEKGLDGAKKAVGGLGKLGKDAVEDLESSVGKGAVHDVKDVLDSVL
DCD-1 SSLLEKGLDGAKKAVGGLGKLGKDAVEDLESVGKGAVHDVKDVLDSV
SSL25 SSLLEKGLDGAKKAVGGLGKLGKDA

機構

デルムシジンの結晶構造は溶液中で解読され、亜鉛イオン結合を介した六量体らせん束を形成することが明らかになった。[6]分子動力学シミュレーションによる計算解析では、これが膜中に傾斜チャネルを形成することが観察されており、この観察結果から推測される抗菌作用のメカニズムの一つは、生体膜を介したイオン勾配の分離によるものである。これは、脂質二重層の電圧依存性脱分極に関する実験研究における同時観察によって裏付けられている。[要出典]

参考文献

  1. ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000161634 – Ensembl、2017年5月
  2. ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
  3. ^ Schittek B, Hipfel R, Sauer B, Bauer J, Kalbacher H, Stevanovic S, Schirle M, Schroeder K, Blin N, Meier F, Rassner G, Garbe C (2001年11月). 「デルミシジン：汗腺から分泌される新規ヒト抗生物質ペプチド」Nat Immunol . 2 (12): 1133–7 . doi :10.1038/ni732. PMID  11694882. S2CID  26126901.
  4. ^ abcd "Entrez Gene: DCD ダーミシジン".
  5. ^ Baechle D, Flad T, Cansier A, et al. (2006). 「カテプシンDはヒトエクリン汗腺に存在し、抗菌ペプチドDCD-1Lの分泌後処理に関与している」J. Biol. Chem . 281 (9): 5406–15 . doi : 10.1074/jbc.M504670200 . PMID  16354654.
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さらに読む

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  • Todorov PT, Deacon M, Tisdale MJ (1997). 「筋タンパク質分解を誘導する腫瘍産生硫酸化糖タンパク質の構造解析」J. Biol. Chem . 272 (19): 12279–88 . doi : 10.1074/jbc.272.19.12279 . PMID  9139670.
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