ドミネデータベース

ドミネ
コンテンツ
説明既知および予測されるドメイン間相互作用の包括的なコレクション。
接触
研究センター国立環境衛生科学研究所、国立衛生研究所
研究室システム生物学
主な引用イェラボイナら(2011)[1]
発売日2010
アクセス
Webサイトhttps://manticore.niehs.nih.gov/domine

DOMINEは、既知および予測されるタンパク質ドメイン相互作用(またはドメイン間相互作用)のデータベースです。 [1] PDB結晶構造で観察された相互作用と、いくつかの計算手法によって予測された相互作用が含まれています。DOMINEは、タンパク質ドメインの定義にPfam HMMプロファイルを使用しています。DOMINEデータベースには、5,410のドメイン間の26,219の相互作用が含まれており、これにはPDB構造データから推定された6,634の既知の相互作用が含まれています

参考文献

  1. ^ ab Yellaboina; et al. (2011年1月). 「DOMINE:既知および予測されるドメイン間相互作用の包括的なコレクション」. Nucleic Acids Res . 39 (データベース版). イギリス: D730-5. doi :10.1093/nar/gkq1229. PMC 3013741.  PMID 21113022  .

参照

  • DOMINEデータベース
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