ダグラス・リー・ブルトラグ

ダグラス・リー・ブルトラグ(1946年12月19日生まれ)は、アメリカの分子生物学者であり、スタンフォード大学の生化学・医学名誉教授です。バイオインフォマティクスと計算分子生物学の分野における先駆者として知られています。[ 1 ] [ 2 ]

教育と初期の研究

ブルトラグは1968年にカリフォルニア工科大学(Caltech)で生物学の学士号を優等で取得し、ジェームズ・ボナー博士の研究室で3本の論文を発表しました。ハーバード大学、バークレー大学、スタンフォード大学の大学院に進学し、最終的にスタンフォード大学で生化学の博士号を取得し、1972年に優秀な成績で博士号を取得しました。[ 1 ]

スタンフォード大学在学中、ブルトラグはノーベル賞受賞者アーサー・コーンバーグの研究室に加わった。博士論文には、DNAポリメラーゼIの2つの主要な機能の発見が含まれていた。1つはDNA複製中に誤った塩基対を修正する3'エキソヌクレアーゼ校正機能、もう1つは岡崎断片処理中にRNAプライマー除去に関与する5'エキソヌクレアーゼ機能である。[ 3 ] [ 4 ]

キャリア

1972年から1974年まで、ブルトラグはオーストラリアのキャンベラにある連邦科学産業研究機構(CSIRO)で、著名な分子生物学者でオーストラリア科学協会会長のジム・ピーコック博士の指導の下、博士研究員として研究を続けました。 [ 5 ]そこで彼は、細菌における真核生物DNAのクローニング法を開発し、ショウジョウバエのヘテロクロマチンDNA配列の大部分を特徴づけ、最終的にそのゲノムの約20%の配列を解読しました。[ 1 ]

彼は1974年にスタンフォード大学に戻り、教員としてショウジョウバエのヘテロクロマチンに関する研究を続けました。同時に、人工知能の先駆者であるエドワード・ファイゲンバウムとの共同研究を開始しました。この共同研究は、遺伝子やタンパク質の機能を予測するための計算手法の開発につながりました。[ 1 ]

貢献

Brutlag の研究室では、タンパク質の機能予測のための初期のデータベースとアルゴリズムをいくつか開発しました。

  • エモチーフ:タンパク質の機能部位を識別する短いアミノ酸配列モチーフ。[ 6 ] [ 1 ]
  • Eblocks:遠縁の生物における機能的タンパク質部位を同定するための隠れマルコフモデルのデータベース。[ 6 ]

Efold プロジェクトを通じて 3D 活性部位モデルを作成する初期の試みはあまり成功しませんでしたが、その後のタンパク質折り畳み予測における飛躍的な進歩につながる基礎を築きました。

ブルトラグは1980年にインテリコープ、1981年にインテリジェネティクスを共同設立しました。後者はバイオインフォマティクス・ソフトウェアの大手プロバイダーとなり、主要な公開DNA配列データベースであるGenBankの管理を担当しました。また、世界中の特許庁と協力し、特許取得済みのDNAおよびタンパク質配列のデータベースの管理と同期化を行いました。[ 7 ]

1993年、ブルトラグは国際計算生物学会(ISCB) [ 8 ]の創設メンバーとなり、スタンフォードで開催された第1回分子生物学のためのインテリジェントシステム(ISMB)シンポジウムの開催に協力した。

学術サービスと教育

彼はスタンフォード大学スタンフォード大学医学部で数多くの委員会に所属しました。また、スタンフォード図書館における初期のデジタル化プロジェクトにも貢献し、 Googleなどと協力してパブリックドメイン資料のデジタル化にも取り組みました。[ 9 ] [ 10 ] [ 11 ]

栄誉と任命

ブルトラグは、そのキャリアを通じて数々の学術賞を受賞し、以下のような名誉ある顧問役を歴任してきました。[ 12 ] [ 9 ]

業界および編集の役割

  • インテリコープ取締役会(1980~1985年)
  • IntelliGenetics 取締役(1986~1991年)
  • 計算生物学ジャーナル編集委員(1993–1998)
  • パスワーク・インフォマティクス科学諮問委員会委員長(2003~2006年)
  • DoubleTwist Inc. 最高科学責任者 (2000–2002)

私生活

ダグラス・ブルトラグは、妻のシモーヌ・クロード・ブルトラグと共にカリフォルニア州メンロパークに居住しています。ダグラス・ブルトラグはシモーヌ・ブルトラグと結婚し、娘のポーリン・ベッカー(ブライアン・ベッカーと結婚)[ 13 ]と息子のベンジャミン・ブルトラグ(サマンサ・ヒルとしても知られる)をもうけました[ 14 ] 。

Google Scholar

参考文献

  1. ^ a b c d e「Brutlag (Douglas L.) Papers」 . oac.cdlib.org . 2025年7月17日閲覧
  2. ^パーク、ポーラ. 「バラをバラと呼ばなければならないとき」 .ザ・サイエンティスト. 2025年7月17日閲覧
  3. ^ Doig, Andrew J.; Chakrabartty, Avijit; Klingler, Tod M.; Baldwin, Robert L. (1994-03-22). 「α-ヘリックスにおけるN-キャッピングの自由エネルギーの決定:Lifson-Roigヘリックスコイル理論のN-およびC-キャッピングを含むように修正」 .生化学. 33 (11): 3396– 3403. doi : 10.1021/bi00177a033 . ISSN 0006-2960 . 
  4. ^ Setlow, Peter; Brutlag, Douglas; Kornberg, Arthur (1972-01-01). 「デオキシリボ核酸ポリメラーゼ:1つのポリペプチドに含まれる2つの異なる酵素:I. ポリメラーゼ機能と3′→5′エキソヌクレアーゼ機能を含むタンパク質分解断片」 . Journal of Biological Chemistry . 247 (1): 224– 231. doi : 10.1016/S0021-9258(19)45779-7 . ISSN 0021-9258 . PMID 4552924 .  
  5. ^ 「リズ・デニス博士、植物生物学者|オーストラリア科学アカデミー」 www.science.org.au . 2025年7月18日閲覧
  6. ^ a b Brutlag, Douglas Lee (2007)、「配列からタンパク質機能を推論する」バイオインフォマティクス - ゲノムから治療まで、John Wiley & Sons, Ltd、pp.  1087– 1119、doi : 10.1002/9783527619368.ch30ISBN 978-3-527-61936-8、 2025年7月17日閲覧{{citation}}: CS1 maint: ISBNによる作業パラメータ(リンク
  7. ^ 「IntelliCorp, Inc. | Encyclopedia.com」 . www.encyclopedia.com . 2025年7月17日閲覧
  8. ^ 「過去の役員および理事」www.iscb.org . 2025年7月17日閲覧
  9. ^ a b「Douglas L. Brutlagのプロフィール | Stanford Profiles」profiles.stanford.edu . 2025年7月17日閲覧
  10. ^ 「ゲノミクスと医学」biochem118.stanford.edu . 2025年10月30日閲覧
  11. ^ 「ゲノミクス、バイオインフォマティクス、医学」biochem158.stanford.edu . 2025年10月30日閲覧
  12. ^ 「Douglas Brutlag, PhD | AMIA - American Medical Informatics Association」 . amia.org . 2025年7月18日閲覧
  13. ^ 「Pauline Becker's Profile | Stanford Profiles」profiles.stanford.edu . 2025年7月18日閲覧
  14. ^ 「サマンサ・ヒル、ベンジャミン・ブルトラグ」 .ニューヨーク・タイムズ. 2010年4月17日. ISSN 0362-4331 . 2025年7月17日閲覧