ヒトのタンパク質コード遺伝子
ECHS1 利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB
識別子 エイリアス ECHS1 、SCEH、ECHS1D、エノイルCoAヒドラターゼ、短鎖、1、ミトコンドリア、エノイルCoAヒドラターゼ、短鎖1、mECH、mECH1 外部ID オミム ：602292; MGI : 2136460; ホモロジーン : 3018; ジーンカード ：ECHS1; OMA :ECHS1 - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） キリスト 7番染色体（マウス） [2] バンド 7|7 F4 始める 139,685,623 bp [2] 終わり 139,696,389 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） 上位の表現 肝臓の右葉 腎臓尿細管 耳下腺 人間の腎臓 横行結腸粘膜 小腸粘膜 腎髄質 糸球体 心臓の頂点 後腎糸球体
上位の表現 褐色脂肪組織 右心室 右腎臓 肝臓の左葉 心室の心筋 二腹筋 心室中隔 心筋 副腎 白色脂肪組織
より多くの参照表現データ
バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能
タンパク質結合 触媒活性 リアーゼ活性 エノイルCoAヒドラターゼ活性 細胞成分 生物学的プロセス
代謝 脂肪酸代謝プロセス 脂質代謝 脂肪酸のベータ酸化 出典：Amigo / QuickGO
ウィキデータ
エノイルコエンザイムAヒドラターゼ短鎖1ミトコンドリア遺伝子は ECHS1 としても知られ 、 ヒト 遺伝子 である。 [5]
この遺伝子によってコードされるタンパク質は、ミトコンドリア脂肪酸β酸化経路の第二段階で機能する。2-トランス-エノイル-コエンザイムA（CoA）中間体のL-3-ヒドロキシアシル-CoAへの水和を触媒する。この遺伝子産物は、ヒドラターゼ／イソメラーゼスーパーファミリーに属する。ミトコンドリアマトリックスに局在する。代替転写開始部位を利用する転写バリアントが文献で報告されている。 [5]
構造 ECHS1遺伝子はおよそ11 kbの長さで、8つの エクソン から構成され、エクソンIとVIIIにはそれぞれ5'非翻訳領域と3'非翻訳領域が含まれている。翻訳コドンの62と63 bp上流に位置する2つの主要な転写開始部位が、プライマー伸長解析によってマッピングされた。ECHS1遺伝子の5'フランキング領域はGCリッチで、SP1結合モチーフのコピーが複数含まれているが、典型的なTATAボックスやCAATボックスは見当たらない。Alu反復要素は、キャップ部位を基準とした-1052/-770の領域内と イントロン 7内に同定されている 。[6] 前駆体 ポリペプチド は290 アミノ酸 残基から構成され、N末端ミトコンドリア標的化ドメイン（1-27、28、29）が不揃いな成熟N末端につながっている。 mRNAは21bpの5'非翻訳配列と391bpの3'非翻訳配列を有する。 [7]
関数 エノイルCoAヒドラターゼ（ECH）は、 脂肪酸代謝の β酸化経路における第2段階を触媒する。この酵素はβ-ヒドロキシアシルCoA チオエステルの形成に関与する。2つの触媒グルタミン酸残基は協調して水分子を活性化すると考えられており、グリシン141は基質の活性化に関与すると提唱されている。ECHSには2つの強力な 阻害剤 があり 、これらは共有結合付加体の形成を介して酵素を不可逆的に不活性化する。 [8]
臨床的意義 エノイルCoAヒドラターゼ短鎖は STAT3 と相互作用することが確認されており、ECHS1はSTAT3のリン酸化を阻害することでSTAT3の活性を特異的に抑制する。 [9] STAT3はがん遺伝子としても腫瘍抑制因子としても作用する。ECHS1自体は多くのがん、特に 肝細胞癌 （HCC）の発生 において発現することが示されており [10] 、外因性および内因性のECHS1の両方がHBsに結合し、結果としてアポトーシスを誘導する。これは、ECHS1が将来、HBV関連 肝炎 またはHCC患者の治療薬として用いられる可能性があることを意味する。 [11]
参考文献
^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000127884 – Ensembl 、2017年5月 ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000025465 – Ensembl 、2017年5月 ^ 「Human PubMed Reference:」。 米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター 。 ^ 「マウスPubMedリファレンス：」。 米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター 。 ^ ab "Entrez Gene: ECHS1 エノイルコエンザイムAヒドラターゼ、短鎖、1、ミトコンドリア". ^ Janssen, U; Davis, EM; Le Beau, MM; Stoffel, W (1997). 「ヒトミトコンドリアエノイルCoAヒドラターゼ遺伝子（ECHS1）：構造的構成と染色体10q26.2-q26.3への割り当て」. Genomics . 40 (3): 470–5 . doi :10.1006/geno.1996.4597. PMID 9073515. ^ 金沢正之; 大竹明生; 阿部秀; 山本誠; 佐藤雄三; 高柳正治; 新見秀; 森正治; 橋本毅 (1993). 「ヒトミトコンドリア短鎖エノイルCoAヒドラターゼcDNAの分子クローニングと配列解析」. Enzyme & Protein . 47 (1): 9– 13. doi :10.1159/000468650. PMID 8012501. ^ Agnihotri, G; Liu, HW (2003). 「エノイルCoAヒドラターゼ。反応、メカニズム、そして阻害」. Bioorganic & Medicinal Chemistry . 11 (1): 9– 20. doi :10.1016/s0968-0896(02)00333-4. PMID 12467702. ^ Chang, Y; Wang, SX; Wang, YB; Zhou, J; Li, WH; Wang, N; Fang, DF; Li, HY; Li, AL; Zhang, XM; Zhang, WN (2013). 「ECHS1はSTAT3と相互作用し、STAT3シグナル伝達を負に制御する」. FEBS Letters . 587 (6): 607–13 . Bibcode :2013FEBSL.587..607C. doi :10.1016/j.febslet.2013.02.005. PMID 23416296. S2CID 23233213. ^ Zhu, XS; Dai, YC; Chen, ZX; Xie, JP; Zeng, W; Lin, YY; Tan, QH (2013). 「ECHS1タンパク質発現のノックダウンはAkt活性の抑制を介して肝細胞癌細胞の増殖を阻害する」. Critical Reviews in Eukaryotic Gene Expression . 23 (3): 275– 82. doi :10.1615/critreveukaryotgeneexpr.2013007531. PMID 23879543. ^ Xiao, CX; Yang, XN; Huang, QW; Zhang, YQ; Lin, BY; Liu, JJ; Liu, YP; Jazag, A; Guleng, B; Ren, JL (2013). 「ECHS1は HepG2細胞においてミトコンドリア経路を介してアポトーシスを促進する新規HBs 抗原結合タンパク質として機能する」 Cancer Letters . 330 (1): 67– 73. doi :10.1016/j.canlet.2012.11.030. PMID 23178449.
さらに読む
Hochstrasser DF, Frutiger S, Paquet N, et al. (1993). 「ヒト肝臓タンパク質マップ：マイクロシークエンシングとゲル比較により構築された参照データベース」. Electrophoresis . 13 (12): 992–1001 . doi :10.1002/elps.11501301201. PMID 1286669. S2CID 23518983. Dawson SJ, White LA (1992). 「シプロフロキサシンによるヘモフィルス・アフロフィルス心内膜炎の治療」. J. Infect . 24 (3): 317–20 . doi :10.1016/S0163-4453(05)80037-4. PMID 1602151. Li J, Norwood DL, Mao LF, Schulz H (1991). 「バルプロ酸のミトコンドリア代謝」. 生化学 . 30 (2): 388–94 . doi :10.1021/bi00216a012. PMID 1988037. Jackson S, Schaefer J, Middleton B, Turnbull DM (1995). 「ヒト脂肪酸β酸化の新規酵素：マトリックス関連型ミトコンドリア2-エノイルCoAヒドラターゼの特性解析」 Biochem. Biophys. Res. Commun . 214 (1): 247–53 . doi :10.1006/bbrc.1995.2281. PMID 7669045. 金沢正之、大竹明生、阿部秀、他 (1994). 「ヒトミトコンドリア短鎖エノイルCoAヒドラターゼcDNAの分子クローニングと配列解析」. 酵素とタンパク質 . 47 (1): 9– 13. doi :10.1159/000468650. PMID 8012501. Janssen U, Davis EM, Le Beau MM, Stoffel W (1997). 「ヒトミトコンドリアエノイルCoAヒドラターゼ遺伝子（ECHS1）：構造的構成と染色体10q26.2-q26.3への割り当て」. Genomics . 40 (3): 470–5 . doi :10.1006/geno.1996.4597. PMID 9073515. Hubbard MJ, McHugh NJ (2001). 「ヒトERp29：単離、一次構造解析、および2次元ゲルマッピング」. 電気泳動 . 21 (17): 3785–96 . doi :10.1002/1522-2683(200011)21:17<3785::AID-ELPS3785>3.0.CO;2-2. PMID 11271497. S2CID 42538820. Jiang LQ, Wen SJ, Wang HY, Chen LY (2003). 「酵母ツーハイブリッドシステムを用いたヒト心臓cDNAライブラリー中のカルパインと相互作用するタンパク質のスクリーニング」. Hypertens. Res . 25 (4): 647–52 . doi : 10.1291/hypres.25.647 . PMID 12358155. Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」 Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 . Deloukas P, Earthrowl ME, Grafham DV, et al. (2004). 「ヒト第10染色体のDNA配列と比較解析」. Nature . 429 (6990): 375–81 . Bibcode :2004Natur.429..375D. doi : 10.1038/nature02462 . PMID 15164054. Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). 「NIH完全長cDNAプロジェクトの現状、品質、そして拡大：哺乳類遺伝子コレクション（MGC）」. Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 . Bruneel A, Labas V, Mailloux A, et al. (2006). 「ヒト臍帯静脈内皮細胞のプロテオミクスとエトポシド誘導性アポトーシスへの応用」. Proteomics . 5 (15): 3876–84 . doi :10.1002/pmic.200401239. PMID 16130169. S2CID 26007149. Ewing RM, Chu P, Elisma F, et al. (2007). 「質量分析法によるヒトタンパク質間相互作用の大規模マッピング」 Mol. Syst. Biol . 3 (1): 89. doi :10.1038/msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931 . 高橋正之、渡利英介、真矢英樹、他 (2007). 「ヒト神経膠芽腫細胞におけるミトコンドリア短鎖エノイルCoAヒドラターゼのダウンモジュレーションによるウイルス複製抑制」. Antiviral Res . 75 (2): 152–8 . doi :10.1016/j.antiviral.2007.02.002. PMID 17395278.
