| エイドーズ | |
|---|---|
| 初回リリース | 1999年 （1999年） |
| 安定版リリース | 3.10 / 2019年12月 （2019年12月） |
| 書かれた | MATLAB / GNU Octave、Objective C、C++ |
| オペレーティング·システム | Windows、Linux、SunOS/Solaris |
| ライセンス | GNU GPL 2または3 |
| Webサイト | eidors.org |
EIDORSは、主にMATLAB / GNU Octaveで記述されたオープンソースのソフトウェアツールボックスで、バイオメディカル、産業、または地球物理学の分野における電気インピーダンス・トモグラフィー（EIT）データからの画像再構成を目的として設計されています。EIDORSという名称は、元々はElectrical Impedance TomographyとDiffuse Optical Reconstruction Softwareの頭字語でした。この名称は、数学的に類似した近赤外拡散光学イメージングからのデータの画像再構成をカバーするという当初の意図を反映していますが、現在までこの分野での開発はほとんど行われていません。
このプロジェクトは1999年に開始されました[1]。2次元EIT再構成用のMatlabコードは、マルコ・ヴァウコネンの博士論文と、クオピオ大学の指導教官ヤリ・カイピオ氏の研究に基づいています。クオピオは3次元EITコードも開発しましたが[2]、こちらはオープンソースとして公開されませんでした。その代わりに、 UMIST（現マンチェスター大学）のニック・ポリドリデス氏とウィリアム・ライオンハート氏による研究成果を基に、EIDORSの3次元バージョンが開発されました[3] 。
方法とモデル
EIDORSの順方向モデルは有限要素法を用いており、人体などの不規則な形状の物体に対してメッシュ生成が必要となる場合があります。また、メッシュ生成にはEITにおける電流駆動・測定に用いられる電極を反映させる必要があります。この目的のために、Netgen Mesh Generatorへのインターフェースが開発されました。
歴史
プロジェクトが拡大するにつれ、様々なグループからのフォワードモデリングと再構築コードを統合したいという要望が高まり、アンディ・アドラーとライオンハートはより拡張性の高いソフトウェアシステムを開発しました。[4]最新バージョンは2019年12月にリリースされた3.10です。
EIDORS プロジェクトには、オープンソース ライセンスに基づいて配布される EIT データのリポジトリも含まれています。
アプリケーション
EIDORSは、肺画像診断[5]や心拍出量測定[6 ]など、EITの生物医学的応用に広く利用されている。また、脳内の電気活動の画像化の研究[7]や高周波アブレーション中の導電率変化のモニタリング[8]にも利用されている。医療画像診断以外では、このツールボックスはプロセストモグラフィー[9] 、地球物理学[10] 、材料科学[11]にも利用されている。
参考文献
- ^ WRB Lionheart、SR Arridge、M Schweiger、M Vauhkonen、JP Kaipio、「電気インピーダンスと拡散光トモグラフィー再構成ソフトウェア」、第1回世界工業プロセストモグラフィー会議議事録、pp 474–477、バクストン、ダービーシャー、1999年
- ^ ヴァウコネン、PJ、ヴァウコネン、M.、サヴォライネン、T.、カイピオ、JP (1999)。完全な電極モデルに基づく三次元電気インピーダンス断層撮影法。生物医学工学、IEEE トランザクション、46(9)、1150–1160。
- ^ Polydorides N, Lionheart WRB, 3次元電気インピーダンストモグラフィーのためのMatlabツールキット：電気インピーダンスおよび拡散光学再構成ソフトウェアプロジェクトへの貢献, Meas. Sci. Technol. 13 (2002年12月) 1871–1883
- ^ A Adler と WRB Lionheart、「EIDORS の使用と乱用: EIT 用の拡張可能なソフトウェア ベース」、Physiol Meas 27、S25–S42、2006 年。
- ^ A. Biguri; B. Grychtol; A. Adler; M. Soleimani (2015). 「肺EITイメージングにおける境界移動の追跡と外部形状モデリング」(PDF) .生理学的測定. 36 (6): 1119– 35. Bibcode :2015PhyM...36.1119B. doi :10.1088/0967-3334/36/6/1119. PMID 26007150. S2CID 30064176.
- ^ Martin Proença et al. , 電気インピーダンストモグラフィーによる心拍出量推定における心臓の動きの影響：事例研究 Physiological Measurement 2015 36 1075
- ^ Kirill Y. Aristovich et al 電気インピーダンストモグラフィーによる脳内の高速電気活動の画像化 NeuroImage 2016 124 204
- ^ Hun Wi et al. 高周波アブレーション中の温度と組織特性変化のリアルタイム導電率イメージング：加重周波数差を用いた生体外モデル Bioelectromagnetics 2015 36 277
- ^ Kent Wei et al. , ITS再構成ツールスイート：産業プロセストモグラフィーのための逆アルゴリズムパッケージ Flow Measurement and Instrumentation 2015 46 292
- ^ Suze-Anne KortelandとTimo Heimovaara、「ERTを用いた実験室での円筒形物体の定量的逆モデリング：誤差分析」Journal of Applied Geophysics 2015
- ^ Gerard J. GalloとErik T. Thostenson「カーボンナノチューブネットワークを用いた電気的異方性繊維強化複合材料の空間損傷検出」Composite Structures 2015
外部リンク
- Sourceforge の EIDORS ウェブサイト
