エドワード・マルコット

エドワード・マルコットは、テキサス大学オースティン校の生化学教授であり、遺伝学、プロテオミクス、バイオインフォマティクスを専門としています。[ 1 ]マルコットは、バイオインフォマティクスに基づく予測を検証するために実験にも頼る計算生物学者の一人です。[ 2 ]

教育と職位

マルコット氏はテキサス大学オースティン校で1990年に微生物学の学士号を取得しました。 1995年には同校で生化学の博士号を取得し、テキサス大学オースティン校とカリフォルニア大学ロサンゼルス校でデビッド・アイゼンバーグ教授の指導の下、博士研究員として研究を行いました。マルコット氏は2001年からテキサス大学オースティン校の教授を務めています。

研究

マルコットの主な研究貢献は、バイオインフォマティクス、プロテオミクス、システム生物学、合成生物学の分野です。

バイオインフォマティクスとシステム生物学

初期の研究で、マルコットと同僚は、あらゆる複合生物（酵母サッカロミセス・セレビシエ）におけるタンパク質間の機能的つながりのゲノム規模のマップを初めて作成しました。この手法により、特徴付けられていない酵母タンパク質の半分以上に対して機能を予測することができました。[ 3 ] マルコットはまた、系統学的プロファイリング、[ 4 ] [ 5 ] [ 6 ]ロゼッタストーン遺伝子融合、[ 7 ] mRNA共発現、[ 3 ]およびミラーツリー[ 8 ]アプローチを含む、タンパク質間の機能的相互作用を特定するいくつかの手法も開発しました。

2010年にマルコットとその同僚は、表現型に基づいて深い相同性の症例を識別するアルゴリズムを特定しました。[ 1 ] [ 9 ]

プロテオミクス

プロテオミクスの分野では、マルコットの貢献には、ヒトタンパク質相互作用ネットワークの初期バージョンの開発[ 10 ] [ 11 ]と7,000を超えるヒトタンパク質相互作用のマッピングが含まれます。[ 12 ]マルコットと同僚は、タンパク質発現、細胞内局在および機能をハイスループットで測定するスポット細胞マイクロアレイ技術を開発し、[ 11 ] [ 13 ] [ 14 ] [ 15 ]質量分析データを解析するためのアルゴリズムを開発し、[ 16 ] [ 17 ] [ 18 ] [ 19 ]質量分析プロテオミクスデータのオープンアクセスデータベースを開始し、[ 20 ]プロテオーム全体の絶対タンパク質定量のためのAPEX法を開発しました。[ 21 ] [ 22 ] APEXを用いて、Marcotteらは下等真核生物のタンパク質の豊富さは主にmRNAレベルによって決定されるのに対し、ヒトのタンパク質の豊富さは転写と転写後の調節によってほぼ同等に決定されることを実証した。[ 23 ]

参考文献

  1. ^ a bカール・ジマー（2010年4月26日）「遺伝子の探索は予期せぬ場所につながる」ニューヨーク・タイムズ。
  2. ^ 「Edward M Marcotte」 .人物. テキサス大学オースティン校細胞分子生物学研究所. 2016年8月16日閲覧。
  3. ^ a b Marcotte, EM; Pellegrini, M.; Thompson, MJ; Yeates, T.; Eisenberg, D. (1999). 「タンパク質機能のゲノムワイド予測のための複合アルゴリズム」. Nature . 402 (6757): 83– 86. Bibcode : 1999Natur.402...83M . doi : 10.1038 / 47048 . PMID 10573421. S2CID 144447 .  
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