電子伝達フラビンタンパク質

タンパク質ドメイン
電子伝達フラビンタンパク質ドメイン
パラコッカス・デニトリフィカンス由来の電子伝達フラボタンパク質(ETF)
識別子
シンボルETF
ファムPF01012
ファム一族CL0039
インタープロIPR014730
プロサイトPDOC00583
SCOP21efv / スコープ / SUPFAM
利用可能なタンパク質構造:
ファム  構造 / ECOD  
PDBRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBサム構造の概要
タンパク質ドメイン
電子伝達フラビンタンパク質FAD結合ドメイン
メチロフィラス・メチロトロファスの電子伝達フラビンタンパク質の構造。
識別子
シンボルETF_アルファ
ファムPF00766
ファム一族CL0085
インタープロIPR014731
プロサイトPDOC00583
SCOP21efv / スコープ / SUPFAM
利用可能なタンパク質構造:
ファム  構造 / ECOD  
PDBRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBサム構造の概要

電子伝達フラビンタンパク質ETF[1]または電子伝達フラビンタンパク質複合体CETF)は、ミトコンドリア内膜のマトリックス面に位置するフラビンタンパク質であり、一次脱水素酵素の特異的電子受容体として機能し、電子伝達フラビンタンパク質脱水素酵素などの末端呼吸器系に電子を伝達する。これらは機能的に、主に脂肪酸の酸化に関与する恒常的な「ハウスキーピング」ETF (グループI)と、特定の生育条件下で一部の原核生物によって産生され、特定の基質の酸化からのみ電子を受け取るETF(グループII)に分類できる。[2]

ETF は、アルファサブユニットとベータサブユニット ( ETFAETFB ) から構成されるヘテロ二量体タンパク質であり、FAD補因子とAMP を含む。[3] [4] ETF は 3 つのドメインから成る。ドメイン I と II はそれぞれアルファサブユニットの N 末端と C 末端部分から形成され、ドメイン III はベータサブユニットから形成される。ドメイン I と III はほぼ同じアルファ - ベータ - アルファ サンドイッチ フォールドを共有しているが、ドメイン II は細菌性フラボドキシンに類似したアルファ - ベータ - アルファ サンドイッチを形成する。FAD はドメイン II と III の間の溝に結合し、ドメイン III は AMP 分子に結合します。ドメイン I と III 間の相互作用によってタンパク質が安定化され、ドメイン II が存在する浅いボウルが形成される。

LYRMタンパク質 スーパーファミリーに属するLYRM5は、ETFAとETFBの両方と相互作用することでETFを脱フラビン化する。[5]これによりFAD結合部位が不安定化し、FADが遊離し、結果として電子伝達が阻害される。[5]

ETFの変異は、 FADH2の還元当量を電子伝達系に渡す機能の欠乏につながり、グルタル酸血症2型を引き起こす可能性がある。

参照

参考文献

  1. ^ Logan CM, Rice MK (1987). Logan's Medical and Scientific Abbreviations (ハードカバー). JB Lippincott . p. 182. ISBN 0-397-54589-4
  2. ^ Weidenhaupt M, Rossi P, Beck C, Fischer HM, Hennecke H (1996). 「Bradyrhizobium japonicumは2つの独立した電子伝達フラビンタンパク質遺伝子群、fixA、fixB、etfS、etfLを有する」. Arch. Microbiol . 165 (3): 169– 78. Bibcode :1996ArMic.165..169W. doi :10.1007/BF01692858. PMID  8599534.
  3. ^ Tsai MH, Saier MH (1995). 「普遍的な電子伝達フラビンタンパク質ファミリーETF-αおよびETF-βの系統学的特徴づけ」Res. Microbiol . 146 (5): 397– 404. doi : 10.1016/0923-2508(96)80285-3 . PMID  8525056.
  4. ^ Roberts DL, Frerman FE, Kim JJ (1996). 「ヒト電子伝達フラビンタンパク質の2.1Å分解能における三次元構造」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 93 (25): 14355–60 . doi : 10.1073/pnas.93.25.14355 . PMC 26136 . PMID  8962055. 
  5. ^ ab Floyd, Brendan J.; Wilkerson, Emily M.; Veling, Mike T.; Minogue, Catie E.; Xia, Chuanwu; Beebe, Emily T.; Wrobel, Russell L.; Cho, Holly; Kremer, Laura S.; Alston, Charlotte L.; Gromek, Katarzyna A.; Dolan, Brendan K.; Ulbrich, Arne; Stefely, Jonathan A.; Bohl, Sarah L. (2016年8月). 「ミトコンドリアタンパク質相互作用マッピングによる呼吸鎖機能の調節因子の同定」. Molecular Cell . 63 (4): 621– 632. doi : 10.1016/j.molcel.2016.06.033 . ISSN  1097-2765. PMC 4992456 . PMID  27499296 . 
  • 電子伝達フラビンタンパク質ドメインのPfamエントリ
  • 電子伝達フラビンタンパク質FAD結合ドメインのPfamエントリ
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