欧州ゲノム・フェノムアーカイブ

人間の遺伝的および表現型データのオンラインアーカイブ
欧州ゲノム・フェノムアーカイブ
プロデューサー欧州分子生物学研究所-欧州バイオインフォマティクス研究所ゲノム制御センター英国およびスペイン
言語英語
アクセス
料金無料
カバレッジ
分野生物医学
フォーマットカバレッジデータセット
リンク
WebサイトEGA公式ポータル

欧州ゲノム・フェノム・アーカイブEGA )は、英国スペインにあるヒトの生体分子および表現型データのリポジトリです[1][2] [3]生物医学研究プログラムによって生成された、識別可能なすべての遺伝子データ、表現型データ、臨床データを安全に保管します[4]

2022年3月現在、世界中の1,000以上の機関から4,500以上の研究調査に関するデータを保存・収集しています。[2]

歴史

EGAは、欧州分子生物学研究所(EMBL-EBI)の欧州バイオインフォマティクス研究所(EMBL-EBI)によって2008年に設立されました。ヒトゲノムデータの自主的なアーカイブ化と配布を支援することを目的としており、安全な保管と、被験者が署名した同意書を尊重する方法で、承認された研究者のみへの配布が求められています。その後、EGAはバルセロナのゲノム規制センター(CRG)との協力範囲を拡大しました[5]

制御されたアクセス

アクセスを規制し、患者の機密性を保護し、アクセス制御されたデータを閲覧する権限を持つ研究者や臨床医にアクセスを提供するために必要なセキュリティを提供します。ただし、データアクセスに関する決定はEGAではなく、適切なデータアクセス許可組織(DAO)によって行われます。[6]

  • ega-archive.org

参考文献

  1. ^ Fernández-Orth D, Lloret-Villas A, De Argila JR (2019年6月). 「欧州ゲノム・フェノム・アーカイブ(EGA) - 今後10年間に向けた粒度分布型ソリューション」. 2019 IEEE 第32回コンピュータベース医療システム国際シンポジウム (CBMS) . pp.  4– 6. doi :10.1109/CBMS.2019.00011. ISBN 978-1-7281-2286-1. S2CID  199490012。
  2. ^ ab Morello F (2022年3月15日). 「機密性の高い研究データの公開と再利用のための、欧州ゲノム・フェノム・アーカイブ連合の設立に向けた協働」CSC . 2022年9月21日閲覧
  3. ^ Lappalainen I, Almeida-King J, Kumanduri V, Senf A, Spalding JD, Ur-Rehman S, et al. (2015年7月). 「生物医学研究のために同意を得たヒトデータの欧州ゲノム・フェノームアーカイブ」. Nature Genetics . 47 (7): 692– 695. doi :10.1038/ng.3312. PMC 5426533. PMID 26111507  . 
  4. ^ フリーバーグ MA、フロモント LA、ダルトリ T、ロメロ AF、シジェス JI、ジェネ A、他。 (2022年1月)。 「2021年のヨーロッパのゲノム現象アーカイブ」。核酸研究50 (D1): D980 – D987土井:10.1093/nar/gkab1059。PMC 8728218PMID  34791407。  
  5. ^ Lappalainen I, Almeida-King J, Kumanduri V, Senf A, Spalding JD, Ur-Rehman S, et al. (2015年7月). 「生物医学研究のために同意を得たヒトデータの欧州ゲノム・フェノームアーカイブ」. Nature Genetics . 47 (7): 692– 695. doi :10.1038/ng.3312. PMC 5426533. PMID 26111507  . 
  6. ^ 「欧州ゲノムフェノームアーカイブ」www.re3data.org . 2022年9月21日閲覧
「https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=European_Genome-phenome_Archive&oldid=1307787890」より取得