FAM114A1
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| 識別子 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| エイリアス | FAM114A1、Noxp20、配列類似性114のメンバーA1を持つファミリー | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 外部ID | MGI : 1915553 ; HomoloGene : 12259 ; GeneCards : FAM114A1 ; OMA : FAM114A1 - オルソログ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| ウィキデータ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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タンパク質FAM114A1は、神経系過剰発現タンパク質20（NOXP20）としても知られ、ヒトではFAM114A1遺伝子によってコードされるタンパク質です。[ 4 ] FAM114A1の相同遺伝子は、ショウジョウバエのように ホモ・サピエンスから分類学的に遠い生物にも見られます。しかし、予想通り、ヒトのFAM114A1は他の相同遺伝子よりも霊長類のFAM114A1に類似しています。FAM114A1には相同遺伝子FAM114A2が1つ存在し、これも機能不明のタンパク質をコードしています。
遺伝子
FAM114A1はヒトの第4染色体短腕（4.p14）の順方向鎖に位置し、塩基対38869354から始まり、38947365で終わる。[ 4 ] mRNAの長さは4138bpである。この遺伝子は、同一染色体上に以下の隣接遺伝子を持つ。
- TLR1 ：Toll様受容体（TLR）1は、病原体の認識と自然免疫の活性化に役割を果たします。
- TLR6 : Toll様受容体（TLR）6は、病原体の認識と自然免疫の活性化に役割を果たします。
- TMEM156: この遺伝子は膜貫通タンパク質をコードします。
- KLHL5：ケルチ様5タンパク質はリンパ球の活性化に関与していると考えられている。[ 5 ]
相同性
| 属と種 | 通称 | 受入番号 | シーケンス長 | シーケンスの同一性 | 配列類似度 |
| パン・トログロダイト | チンパンジー | XP_517149.2 | 563 a | 99% | 99% |
| マカカ・ムラッタ | アカゲザル | EHH25809.1 | 563 a | 97% | 98% |
| ノマスカス・ロイコゲニス | シロテテナガザル | XP_003258632.1 | 562 a | 97% | 98% |
| マカク属 | カニクイザル | EHH53615.1 | 563 a | 96% | 98% |
| ポンゴ・アベリイ | スマトラオランウータン | XP_002814719.1 | 563 a | 98% | 96% |
| エクウス・カバルス | 馬 | XP_001498667.1 | 562 a | 88% | 93% |
| アフリカトビネズミ | アフリカゾウ | XP_003411349.1 | 558 a | 85% | 91% |
| ヘテロセファルス・グラバー | ハダカデバネズミ | EHB16215.1 | 561 a | 86% | 90% |
| モルモット | モルモット | XP_003471670.1 | 569 a | 86% | 90% |
| ウシ | 牛 | XP_588946.3 | 563 a | 84% | 90% |
| イノシシ | イノシシ | XP_003128969.1 | 562 a | 84% | 90% |
| メラノレウカ | ジャイアントパンダ | XP_002928170.1 | 570 a | 83% | 89% |
| イヌ | 犬 | XP_536261.3 | 560 a | 83% | 88% |
| ドブネズミ | ねずみ | XP_573600.2 | 567 a | 78% | 83% |
| ハツカネズミ | ねずみ | BAB30694.1 | 569 a | 77% | 83% |
| モノデルフィス・ドメスティカ | 灰色の短い尾を持つオポッサム | XP_001374188.1 | 562 a | 72% | 81% |
| メレアグリス・ガロパボ | 野生の七面鳥 | XP_003205919.1 | 563 a | 64% | 76% |
| ガルス・ガルス | チキン | XP_423859.3 | 561 a | 64% | 75% |
| テニオピギア・グッタタ | キンカチョウ | XP_002189709.1 | 565 a | 61% | 75% |
| アノール・カロリネンシス | カロライナアノール | XP_003226293.1 | 539 a | 61% | 75% |
| ダニオ・レリオ | ゼブラフィッシュ | NP_001082947.1 | 546 a | 57% | 72% |
| アフリカツメガエル（シルラナ）トロピカリス | ニシツメガエル | XP_002938704.1 | 424 a | 66% | 79% |
表現
NOXP20は脳で過剰発現しており[ 6 ] 、 Allen Brain Atlasを使用したマイクロアレイデータ[ 7 ]がその発現の証拠を示しています。NCBI GEO Profileのデータ[ 8 ]によると、FAM114A1は脳で発現していますが、その発現は神経組織を超えて人体のほとんどの組織タイプに及んでいます。GEO Profilesはまた、FAM114A1は未分化幹細胞よりも間葉系幹細胞で多く発現していることも示しています。さらなる実験[ 8 ]により、FAM114A1の発現に影響を与える特定の因子があることが示されています。1つの例は、CLDN-1の過剰発現とFAM114A1の過剰発現との直接的な関係です。
タンパク質
NOXP20は563個のアミノ酸から構成され、質量は60742 Da、等電点は4.415999です。このタンパク質の詳細についてはほとんど解明されていませんが、その構造と機能については多くの科学的予測が存在します。他のタンパク質と同様に、このタンパク質も翻訳後修飾を受けます。実際に起こっていることが証明されている修飾は、タンパク質の196番目と199番目のアミノ酸の リン酸化です。
構造
タンパク質の二次構造を予測するツールはいくつかあります。それらの結果を組み合わせるツールの一つが、SDSC Biology WorkBenchのPELEです。[ 9 ]このツールによると、タンパク質の二次構造は主にαヘリックスとコイルで構成され、その周囲にβストランドがいくつか配置されています。
相互作用
FAM114A1タンパク質がヒト体内の他のタンパク質と相互作用するという証拠は存在しません。しかしながら、マウスにおいてはFAM114A1とCDGSH鉄硫黄ドメイン2との相互作用が検出されています。[ 10 ] NOXP20のアミノ酸配列は、ヒト（ Homo sapiens）とマウス（Mus musculus ）の2種間で 77%の同一性と83%の類似性を有しています。この2種の近縁性から、NOXP20はヒトにおいても同様の相互作用を示すと考えられます。
関数
NOXP20の正確な機能はまだ十分に解明されていません。しかしながら、このタンパク質にはカスパーゼリクルートドメインが存在するという証拠があります。[ 6 ]カスパーゼがアポトーシスに関与していることを考えると、この情報からNOXP20はアポトーシスと細胞増殖の調節に役割を果たしている可能性があると考えられます。
参考文献
- ^ a b c GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000029185 – Ensembl、2017年5月
- ^ 「ヒトPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ a b「配列類似性114を持つFAM114A1ファミリー、メンバーA1 [ホモ・サピエンス]」 NCBI . 2012年4月22日閲覧。
- ^ "GeneCards" . Genecards . 2012年4月28日閲覧。
- ^ a b Boucquey M, De Plaen E, Locker M, Poliard A, Mouillet-Richard S, Boon T, Kellermann O (2006年10月). 「Noxp20とNoxp70、初期神経分化の2つの新たなマーカー、奇形癌由来神経外胚葉前駆細胞で検出された」 . Journal of Neurochemistry . 99 (2): 657–69 . doi : 10.1111/j.1471-4159.2006.04093.x . PMID 17029606 .
- ^ 「マイクロアレイデータ」アレン脳科学研究所. 2012年4月28日閲覧。
- ^ a b「Geo Profiles」 . NCBI . 2012年4月28日閲覧。
- ^ 「生物学ワークベンチ」 . SDSC生物学ワークベンチ. 2012年4月28日閲覧。
- ^ “String” . STRING9.0. 2015年6月26日時点のオリジナルよりアーカイブ。2012年4月28日閲覧。
さらに読む
- Boucquey M, De Plaen E, Locker M, Poliard A, Mouillet-Richard S, Boon T, Kellermann O (2006年10月). 「Noxp20とNoxp70、初期神経分化の2つの新たなマーカーが、奇形癌由来神経外胚葉前駆細胞で検出された」 . Journal of Neurochemistry . 99 (2): 657–69 . doi : 10.1111/j.1471-4159.2006.04093.x . PMID 17029606 .
