ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
| FBXO6 |
|---|
|
| 識別子 |
|---|
| エイリアス | FBXO6、FBG2、FBS2、FBX6、Fbx6b、Fボックスタンパク質6 |
|---|
| 外部ID | オミム：605647; MGI : 1354743;ホモロジーン: 9274;ジーンカード：FBXO6; OMA :FBXO6 - オルソログ |
|---|
|
| 遺伝子の位置（マウス） |
|---|
 | | キリスト | 4番染色体（マウス）[2] |
|---|
| | バンド | 4 E2|4 78.67 cM | 始める | 148,230,173 bp [2] |
|---|
| 終わり | 148,236,597 bp [2] |
|---|
|
| RNA発現パターン |
|---|
| ブギー | | 人間 | マウス（相同遺伝子） |
|---|
| 上位の表現 | - 顆粒球
- 単球
- 太ももの筋肉
- 腓腹筋
- 気管支上皮細胞
- 血
- 肝臓の右葉
- 鼻粘膜の嗅覚領域
- 回腸粘膜
- 右副腎
|
| | 上位の表現 | - 膀胱
- 太ももの筋肉
- 副腎
- 筋肉組織
- 骨格筋組織
- 大腿四頭筋
- 胎盤
- 白色脂肪組織
- リップ
- 右腎臓
|
| | より多くの参照表現データ |
|
|---|
| バイオGPS | |
|---|
|
| 遺伝子オントロジー |
|---|
| 分子機能 |
- ユビキチンタンパク質リガーゼ活性
- 炭水化物結合
- ユビキチンタンパク質転移酵素活性
- タンパク質結合
| | 細胞成分 |
- 細胞質
- SCFユビキチンリガーゼ複合体
- 小胞体品質管理コンパートメント
- 細胞質
| | 生物学的プロセス |
- DNA損傷刺激に対する細胞応答
- DNA損傷チェックポイントシグナル伝達
- SCF依存性プロテアソームユビキチン依存性タンパク質分解プロセス
- 折り畳まれていないタンパク質への反応
- DNA修復
- タンパク質のユビキチン化
- タンパク質分解
- ユビキチン依存性ERAD経路
- 糖タンパク質の分解プロセス
- タンパク質ポリユビキチン化
- 翻訳後タンパク質修飾
| | 出典：Amigo / QuickGO |
|
| オーソログ |
|---|
| 種 | 人間 | ねずみ |
|---|
| エントレズ | | |
|---|
| アンサンブル | | |
|---|
| ユニプロット | | |
|---|
| RefSeq (mRNA) | | |
|---|
NM_001163704
NM_001163705
NM_001163706
NM_001163707
NM_015797 |
|
|---|
| RefSeq（タンパク質） | | |
|---|
NP_001157176
NP_001157177
NP_001157178
NP_001157179
NP_056612 |
|
|---|
| 場所（UCSC） | 1章: 11.66 – 11.67 Mb | 4章: 148.23 – 148.24 Mb |
|---|
| PubMed検索 | [3] | [4] |
|---|
|
| ウィキデータ |
|
Fボックス専用タンパク質6は、ヒトではFBXO6遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6] [7]
この遺伝子は、約40アミノ酸からなるFボックスモチーフを特徴とするFボックス タンパク質ファミリーのメンバーをコードしています。Fボックスタンパク質は、リン酸化依存性ユビキチン化に機能するSCF（SKP1-cullin-Fボックス）と呼ばれるユビキチンタンパク質リガーゼ複合体の4つのサブユニットの1つを構成しています。Fボックスタンパク質は、WD-40ドメインを含むFbws、ロイシンリッチリピートを含むFbls、そして異なるタンパク質間相互作用モジュールを含むか、あるいは認識可能なモチーフを持たないFbxsの3つのクラスに分類されます。この遺伝子によってコードされるタンパク質はFbxsクラスに属し、そのC末端領域は細胞周期の制御に関与していると考えられるラットNFB42（神経Fボックス42 kDa）のC末端領域と高い類似性を示しています。[7]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000116663 – Ensembl、2017年5月
- ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000055401 – Ensembl、2017年5月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ Cenciarelli C, Chiaur DS, Guardavaccaro D, Parks W, Vidal M, Pagano M (1999年12月). 「ヒトF-boxタンパク質ファミリーの同定」. Curr Biol . 9 (20): 1177–9 . Bibcode :1999CBio....9.1177C. doi : 10.1016/S0960-9822(00)80020-2 . PMID 10531035. S2CID 7467493.
- ^ Ilyin GP, Rialland M, Pigeon C, Guguen-Guillouzo C (2000年11月). 「哺乳類F-boxタンパク質ファミリーの新規メンバーのcDNAクローニングと発現解析」. Genomics . 67 (1): 40–7 . doi :10.1006/geno.2000.6211. PMID 10945468.
- ^ ab "Entrez Gene: FBXO6 F-box タンパク質 6".
さらに読む
- Gregory SG, Barlow KF, McLay KE, et al. (2006). 「ヒト染色体1のDNA配列と生物学的アノテーション」. Nature . 441 (7091): 315–21 . Bibcode :2006Natur.441..315G. doi : 10.1038/nature04727 . PMID 16710414.
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). 「NIH完全長cDNAプロジェクトの現状、品質、そして拡大：哺乳類遺伝子コレクション（MGC）」. Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 .
- 吉田 勇、徳永 史、千葉 剛、他 (2003). 「Fbs2は糖鎖を認識するE3ユビキチンリガーゼファミリーの新規メンバーである」. J. Biol. Chem . 278 (44): 43877–84 . doi : 10.1074/jbc.M304157200 . PMID 12939278.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
- Ilyin GP, Sérandour AL, Pigeon C, et al. (2003). 「構造的に関連するヒトF-boxタンパク質の新たなサブファミリー」. Gene . 296 ( 1– 2): 11– 20. doi :10.1016/S0378-1119(02)00867-3. PMID 12383498.
- Winston JT, Koepp DM, Zhu C, et al. (1999). 「哺乳類F-boxタンパク質ファミリー」. Curr. Biol . 9 (20): 1180–2 . Bibcode :1999CBio....9.1180W. doi : 10.1016/S0960-9822(00)80021-4 . PMID 10531037. S2CID 14341845.
