FKBP1A

FKBP1A
利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 1A7X、1B6C、1BKF、1BL4、1D6O、1D7H、1D7I、1D7J、1EYM、1F40、1FAP、1FKB、1FKD、1FKF、1FKG、1FKH、1FKI、1FKJ、1FKR、1FKS、1FKT、1J4H、1J4I、1J4R、1NSG、1QPF、1QPL、2DG3、2DG4、2DG9、2FAP、2FKE、2PPN、2PPO、2PPP、2RSE、3FAP、3H9R、3MDY、4DH0、4FAP、4IPX、4N19、4ODP、 4ODQ、4ODR
識別子
エイリアス	FKBP1A、FKBP-12、FKBP-1A、FKBP1、FKBP12、PKC12、PKCI2、PPIASE、FK506結合タンパク質1A、FKBPプロリルイソメラーゼ1A
外部ID	オミム: 186945; MGI : 95541;ホモロジーン: 105139;ジーンカード：FKBP1A; OMA :FKBP1A - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 20番染色体（ヒト）[1] バンド 20p13 始める 1,368,977 bp [1] 終わり 1,393,164 bp [1]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 染色体2（マウス）[2] バンド 2|2 G3 始める 151,384,403 bp [2] 終わり 151,403,612 bp [2]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 右肺 単球 左肺の上葉 甲状腺の右葉 甲状腺の左葉 側坐核 結腸上皮 直腸 左卵管 平滑筋組織 上位の表現 外側中隔核 嗅結節 外頸動脈 内頸動脈 海馬歯状回顆粒細胞 鉤状部 側坐核 前扁桃体領域 心内膜クッション 生殖腺隆起 より多くの参照表現データ バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 カルシウムチャネル阻害活性 アクチビン結合 イソメラーゼ活性 マクロライド結合 ペプチジルプロリルシス-トランスイソメラーゼ活性 信号伝達活性 タンパク質結合 SMAD結合 トランスフォーミング成長因子β受容体結合 FK506バインディング 酵素結合 Hsp70タンパク質結合 I型トランスフォーミング成長因子β受容体結合 タンパク質ホモ二量体化活性 膜貫通トランスポーター結合 細胞成分 細胞質 末端槽 Z ディスクカック 細胞外エクソソーム 細胞小器官膜の外因性成分 膜の細胞質側 リアノジン受容体複合体 細胞質 膜 筋小胞体 筋小胞体膜 細胞内膜小器官 軸索終末 生物学的プロセス SMADタンパク質複合体の組み立て アミロイド線維の形成 アクチビン受容体シグナル伝達経路の調節 タンパク質の折り畳みによるタンパク質の成熟 アミロイド前駆体タンパク質の分解プロセスの調節 タンパク質のペプチジル-プロリル異性化 リアノジン感受性カルシウム放出チャネル活性の負の制御 タンパク質の局在の制御 カルシウムイオン膜輸送 タンパク質のリフォールディング 免疫反応の調節 I-κBキナーゼ/NF-κBシグナル伝達の正の制御 細胞質への隔離されたカルシウムイオンの放出の負の調節 タンパク質結合の正の調節 タンパク質ユビキチン化の正の制御 「de novo」タンパク質フォールディング トランスフォーミング成長因子β受容体シグナル伝達経路 T細胞の活性化 シャペロンを介したタンパク質フォールディング 超分子繊維組織 リン酸化タンパク質ホスファターゼ活性の負の調節 タンパク質の折り畳み タンパク質リン酸化の負の制御 心臓の形態形成 筋肉の収縮 鉄イオンへの反応 サイトカインを介したシグナル伝達経路 カフェインへの反応 T細胞の増殖 隔離されたカルシウムイオンの細胞質への放出 心室筋組織の形態形成 リアノジン感受性カルシウム放出チャネル活性の調節 心臓の小柱形成 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 2280 14225 アンサンブル ENSG00000088832 ENSMUSG00000032966 ユニプロット P62942 P26883 RefSeq (mRNA) NM_054014 NM_000801 NM_001199786 NM_001302077 NM_001302078 NM_001302079 NM_001302080 NM_008019 NM_001355077 NM_001355078 RefSeq（タンパク質） NP_000792 NP_001186715 NP_463460 NP_001289006 NP_001289007 NP_001289008 NP_001289009 NP_032045 NP_001342006 NP_001342007 場所（UCSC） 20章: 1.37 – 1.39 MB 2番目の文字: 151.38 – 151.4 Mb PubMed検索 [3] [4]
ウィキデータ
人間の表示/編集 マウスの表示/編集

ペプチジルプロリルシストランスイソメラーゼFKBP1Aは、ヒトではFKBP1A遺伝子によってコードされる酵素である。^[5] FKBP-12またはFKBP12とも呼ばれ、FK506結合タンパク質（FKBP）ファミリーのメンバーである。

関数

この遺伝子によってコードされるタンパク質は、免疫調節およびタンパク質の折り畳みと輸送に関わる基本的な細胞プロセスにおいて役割を果たすイムノフィリンタンパク質ファミリーのメンバーである。このタンパク質は、免疫抑制剤FK506（タクロリムス）およびラパマイシン（シロリムス）に結合するシス-トランスプロリルイソメラーゼである。I型TGF-β受容体を含むいくつかの細胞内シグナル伝達タンパク質と相互作用する。また、四量体骨格筋リアノジン受容体を含む複数の細胞内カルシウム放出チャネルとも相互作用する。マウスでは、この相同遺伝子の欠失により、左室心筋緻密化不全症として知られる先天性心疾患が引き起こされる。同じタンパク質をコードする複数の選択的スプライシング変異体が同定されている。ヒトゲノムには、この遺伝子に関連する5つの偽遺伝子が含まれており、少なくとも1つは転写される。^[6]

相互作用

FKBP1A は以下と相互作用することが示されています。

• GLMN、^{[7] [8]}
• ITPR1 ^{[9] [10]}
• KIAA1303、^{[11] [12]}
• 哺乳類ラパマイシン標的, ^{[11] [12] [13] [14] [15] [16]}
• RYR1、^{[17] [18] [19]} および
• TGFβ受容体1 [ ^{20] [21]}

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000088832 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000032966 – Ensembl、2017年5月
3. 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. DiLella AG (1991年9月). 「ヒト免疫フィリンFKBP-12遺伝子の染色体配列決定」.生化学および生物理学的研究通信. 179 (3): 1427–33 . Bibcode :1991BBRC..179.1427D. doi :10.1016/0006-291X(91)91732-R. PMID  1930186.
6. 「Entrez Gene: FKBP1A FK506結合タンパク質1A、12kDa」。
7. Chambraud B, Radanyi C, Camonis JH, Shazand K, Rajkowski K, Baulieu EE (1996年12月). 「FAP48は、免疫フィリンFKBP59およびFKBP12と特異的複合体を形成する新規タンパク質である。免疫抑制剤FK506およびラパマイシンによる予防効果」The Journal of Biological Chemistry . 271 (51): 32923–9 . doi : 10.1074/jbc.271.51.32923 . PMID  8955134.
8. Neye H (2001年3月). 「FKBP関連タンパク質48（FAP48）のプロリン219位の変異はFKBP12およびFKBP52との相互作用を阻害する」. Regulatory Peptides . 97 ( 2–3 ): 147–52 . doi :10.1016/s0167-0115(00)00206-8. PMID  11164950. S2CID  20617551.
9. MacMillan D, Currie S, Bradley KN, Muir TC, McCarron JG (2005年12月). 「平滑筋において、FK506結合タンパク質はIP3受容体を介したmTORおよびカルシニューリンによるCa2+放出を調節する」. Journal of Cell Science . 118 (Pt 23): 5443–51 . doi : 10.1242/jcs.02657 . PMID  16278292.
10. Cameron AM, Nucifora FC, Fung ET, Livingston DJ, Aldape RA, Ross CA, Snyder SH (1997年10月). 「FKBP12はイノシトール1,4,5-トリスリン酸受容体のロイシン-プロリン（1400-1401）に結合し、カルシニューリンをこのFK506様ドメインに固定する」. The Journal of Biological Chemistry . 272 (44): 27582–8 . doi : 10.1074/jbc.272.44.27582 . PMID  9346894.
11. Jacinto E, Loewith R, Schmidt A, Lin S, Rüegg MA, Hall A, Hall MN (2004年11月). 「哺乳類TOR複合体2はアクチン細胞骨格を制御し、ラパマイシン非感受性である」Nature Cell Biology . 6 (11): 1122–8 . doi :10.1038/ncb1183. PMID  15467718. S2CID  13831153.
12. Sarbassov DD, Ali SM, Kim DH, Guertin DA, Latek RR, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Sabatini DM (2004年7月). 「mTORの新規結合パートナーであるRictorは、ラパマイシン非感受性かつraptor非依存性で細胞骨格を制御する経路を定義する」Current Biology . 14 (14): 1296– 302. Bibcode :2004CBio...14.1296D. doi : 10.1016/j.cub.2004.06.054 . PMID  15268862. S2CID  4658268.
13. Choi J, Chen J, Schreiber SL, Clardy J (1996年7月). 「ヒトFRAPの結合ドメインと相互作用するFKBP12-ラパマイシン複合体の構造」. Science . 273 (5272): 239–42 . Bibcode :1996Sci...273..239C. doi :10.1126/science.273.5272.239. PMID  8662507. S2CID  27706675.
14. Luker KE, Smith MC, Luker GD, Gammon ST, Piwnica-Worms H, Piwnica-Worms D (2004年8月). 「ホタルルシフェラーゼ相補性イメージングによる細胞および生体動物における制御されたタンパク質間相互作用の動態」. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 101 (33): 12288–93 . Bibcode :2004PNAS..10112288L. doi : 10.1073/pnas.0404041101 . PMC 514471. PMID  15284440 . 
15. Banaszynski LA, Liu CW, Wandless TJ (2005年4月). 「FKBP.ラパマイシン.FRB三元複合体の特性評価」.アメリカ化学会誌. 127 (13): 4715–21 . doi :10.1021/ja043277y. PMID  15796538.
16. Sabers CJ, Martin MM, Brunn GJ, Williams JM, Dumont FJ, Wiederrecht G, Abraham RT (1995年1月). 「哺乳類細胞におけるFKBP12-ラパマイシン複合体の標的タンパク質の単離」. The Journal of Biological Chemistry . 270 (2): 815–22 . doi : 10.1074/jbc.270.2.815 . PMID  7822316.
17. Avila G, Lee EH, Perez CF, Allen PD, Dirksen RT (2003年6月). 「FKBP12のRyR1への結合はマウス骨格筋管における興奮収縮連関を調節する」. The Journal of Biological Chemistry . 278 (25): 22600–8 . doi : 10.1074/jbc.M205866200 . PMID  12704193.
18. Bultynck G, De Smet P, Rossi D, Callewaert G, Missiaen L, Sorrentino V, De Smedt H, Parys JB (2001年3月). 「リアノジン受容体およびイノシトール1,4,5-トリスリン酸受容体の異なるアイソフォームにおける12 kDa FK506結合タンパク質（FKBP12）結合部位の特性評価とマッピング」The Biochemical Journal . 354 (Pt 2): 413–22 . doi :10.1042/bj3540413. PMC 1221670. PMID 11171121  . 
19. Gaburjakova M, Gaburjakova J, Reiken S, Huang F, Marx SO, Rosemblit N, Marks AR (2001年5月). 「FKBP12結合はリアノジン受容体チャネルのゲーティングを制御する」. The Journal of Biological Chemistry . 276 (20): 16931–5 . doi : 10.1074/jbc.M100856200 . PMID  11279144.
20. Wang T, Donahoe PK, Zervos AS (1994年7月). 「TGF-βファミリーのI型受容体と免疫フィリンFKBP-12の特異的相互作用」. Science . 265 (5172): 674–6 . Bibcode :1994Sci...265..674W. doi :10.1126/science.7518616. PMID  7518616.
21. Liu F, Ventura F, Doody J, Massagué J (1995年7月). 「ヒトの骨形成タンパク質（BMP）に対するII型受容体：2キナーゼ受容体モデルのBMPへの拡張」. Molecular and Cellular Biology . 15 (7): 3479–86 . doi :10.1128/mcb.15.7.3479. PMC 230584. PMID 7791754  . 

さらに読む

• Schiene-Fischer C, Yu C (2001年4月). 「受容体アクセサリーフォールディングヘルパー酵素：ペプチジルプロリルシス/トランスイソメラーゼの機能的役割」. FEBS Letters . 495 ( 1–2 ): 1–6 . Bibcode :2001FEBSL.495....1S. doi : 10.1016/S0014-5793(01)02326-2 . PMID  11322937. S2CID  42263861.
• DiLella AG, Hawkins A, Craig RJ, Schreiber SL, Griffin CA (1992年12月). 「ヒトFKBP12およびFKBP13をコードする遺伝子の染色体バンド割り当て」.生化学および生物物理学的研究通信. 189 (2): 819–23 . Bibcode :1992BBRC..189..819D. doi :10.1016/0006-291X(92)92276-4. PMID  1281998.
• Jayaraman T, Brillantes AM, Timerman AP, Fleischer S, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Marks AR (1992年5月). 「カルシウム放出チャネル（リアノジン受容体）に関連するFK506結合タンパク質」. The Journal of Biological Chemistry . 267 (14): 9474–7 . doi : 10.1016/S0021-9258(19)50114-4 . PMID  1374404.
• Lepre CA, Thomson JA, Moore JM (1992年5月). 「FKBP-12に結合したFK506の溶液構造」. FEBS Letters . 302 (1): 89– 96. Bibcode :1992FEBSL.302...89L. doi : 10.1016/0014-5793(92)80292-O . PMID  1375171. S2CID  41469360.
• 牧 暢、関口 文、西巻 淳、三輪 健、早野 剛、高橋 暢、鈴木 正治 (1990年7月). 「ヒトT細胞FK506結合タンパク質をコードする相補DNA、シクロフィリンとは異なるペプチジルプロリルシス-トランスイソメラーゼ」米国科学アカデミー紀要. 87 (14): 5440–3 . Bibcode :1990PNAS...87.5440M. doi : 10.1073/pnas.87.14.5440 . PMC  54340. PMID  1695378 .
• Standaert RF, Galat A, Verdine GL, Schreiber SL (1990年8月). 「ヒトFK506結合タンパク質FKBPの分子クローニングと過剰発現」. Nature . 346 (6285): 671–4 . Bibcode :1990Natur.346..671S. doi :10.1038/346671a0. PMID:  1696686. S2CID  : 4368221.
• Siekierka JJ, Wiederrecht G, Greulich H, Boulton D, Hung SH, Cryan J, Hodges PJ, Sigal NH (1990年12月). 「免疫抑制剤FK-506の細胞質結合タンパク質は、普遍的かつ高度に保存されたペプチジルプロリルシス-トランスイソメラーゼである」. The Journal of Biological Chemistry . 265 (34): 21011–5 . doi : 10.1016/S0021-9258(17)45319-1 . PMID  1701173.
• Michnick SW, Rosen MK, Wandless TJ, Karplus M, Schreiber SL (1991年5月). 「FKBPの溶液構造。FKBPはロタマーゼ酵素であり、FK506およびラパマイシンの受容体である。」Science . 252 (5007): 836–9 . Bibcode :1991Sci...252..836M. doi :10.1126/science.1709301. PMID  1709301. S2CID  28289138.
• Van Duyne GD, Standaert RF, Karplus PA, Schreiber SL, Clardy J (1991年5月). 「免疫フィリン-免疫抑制剤複合体FKBP-FK506の原子構造」. Science . 252 (5007): 839–42 . Bibcode :1991Sci...252..839V. doi :10.1126/science.1709302. PMID  : 1709302. S2CID  : 32539611.
• Rosen MK, Michnick SW, Karplus M, Schreiber SL (1991年5月). 「ヒトFK506およびラパマイシン結合タンパク質のプロトンおよび窒素の連続割り当てと二次構造決定」.生化学. 30 (19): 4774–89 . CiteSeerX  10.1.1.559.2890 . doi :10.1021/bi00233a020. PMID  1709363.
• Jin YJ, Albers MW, Lane WS, Bierer BE, Schreiber SL, Burakoff SJ (1991年8月). 「膜結合型ヒトFK506およびラパマイシン結合タンパク質FKBP-13の分子クローニング」. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 88 (15): 6677–81 . Bibcode :1991PNAS...88.6677J. doi : 10.1073/pnas.88.15.6677 . PMC  52151. PMID  1713687 .
• DiLella AG, Craig RJ (1991年9月). 「ヒトFKBP-12遺伝子のエクソン構成：構造・機能タンパク質ドメインとの相関」.生化学. 30 (35): 8512–7 . doi :10.1021/bi00099a002. PMID  1716149.
• Harding MW, Galat A, Uehling DE, Schreiber SL (1989年10月). 「免疫抑制剤FK506の受容体はシス-トランスペプチジルプロリルイソメラーゼである」. Nature . 341 (6244): 758–60 . Bibcode :1989Natur.341..758H. doi :10.1038/341758a0. PMID:  2477715. S2CID  : 4349152.
• Wang T, Donahoe PK, Zervos AS (1994年7月). 「TGF-βファミリーI型受容体と免疫フィリンFKBP-12の特異的相互作用」. Science . 265 (5172): 674–6 . Bibcode :1994Sci...265..674W. doi :10.1126/science.7518616. PMID  : 7518616.
• Peattie DA, Hsiao K, Benasutti M, Lippke JA (1994年12月). 「3つの異なるメッセンジャーRNAがヒト免疫抑制剤結合タンパク質FKBP12をコードする」. Gene . 150 (2): 251–7 . doi :10.1016/0378-1119(94)90434-0. PMID  7529739.
• Yang WM, Inouye CJ, Seto E (1995年6月). 「シクロフィリンAとFKBP12はYY1と相互作用し、その転写活性を変化させる」. The Journal of Biological Chemistry . 270 (25): 15187–93 . doi : 10.1074/jbc.270.25.15187 . PMID  7541038.
• Kawamura A, Su MS (1995年6月). 「FKBP12-FK506とカルシニューリンAのBサブユニット結合ドメインにおける相互作用」. The Journal of Biological Chemistry . 270 (26): 15463–6 . doi : 10.1074/jbc.270.26.15463 . PMID  7541044.
• Griffith JP, Kim JL, Kim EE, Sintchak MD, Thomson JA, Fitzgibbon MJ, Fleming MA, Caron PR, Hsiao K, Navia MA (1995年8月). 「イムノフィリン-免疫抑制剤FKBP12-FK506複合体によって阻害されたカルシニューリンのX線構造」. Cell . 82 (3): 507–22 . doi : 10.1016/0092-8674(95)90439-5 . PMID  7543369. S2CID  15502270.
• Van Duyne GD, Standaert RF, Karplus PA, Schreiber SL, Clardy J (1993年1月). 「ヒト免疫フィリンFKBP-12とFK506およびラパマイシンとの複合体の原子構造」. Journal of Molecular Biology . 229 (1): 105–24 . doi :10.1006/jmbi.1993.1012. PMID  7678431.