ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
| FMNL1 |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オーソログ検索: PDBe RCSB |
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| 識別子 |
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| エイリアス | FMNL1、C17orf1、C17orf1B、FHOD4、FMNL、KW-13、ホルミン 1 のような |
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| 外部ID | オミム:604656; MGI : 1888994;ホモロジーン: 136798;ジーンカード:FMNL1; OMA :FMNL1 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | キリスト | 11番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 11|11 E1 | 始める | 103,061,933 bp [2] |
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| 終わり | 103,089,727 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| 上位の表現 | - 顆粒球
- 単球
- 血
- 脾臓
- 右肺
- 左肺の上葉
- リンパ節
- 骨髄細胞
- 付録
- 胆嚢
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| | 上位の表現 | - 顆粒球
- 一次視覚野
- 上前頭回
- 海馬歯状回顆粒細胞
- 嗅周皮質
- 脛大腿関節
- 胸腺
- 嗅内皮質
- 腰椎神経節
- 心室中隔
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| | より多くの参照表現データ |
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| バイオGPS |  | | より多くの参照表現データ |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- プロフィリン結合
- GTPase活性化タンパク質結合
- アクチンフィラメント結合
- タンパク質結合
- アクチン結合
- 分子機能
| | 細胞成分 |
- 細胞質
- 細胞投影
- 膜
- 細胞膜
- 細胞皮質
- 貪食小胞
- ブレブ
- 細胞外エクソソーム
- 細胞質小胞
- 細胞質
- 膜の不可欠な構成要素
| | 生物学的プロセス |
- アクチンフィラメントの切断
- 基質依存性細胞移動
- 細胞骨格の組織
- 細胞形状の調節
- 細胞成分の組織化
- 皮質アクチン細胞骨格組織
- アクチン細胞骨格の組織化
- 細胞プロセスまたは現象
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オーソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | | |
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| RefSeq(タンパク質) | | NP_001071166 NP_062653 NP_001390541 NP_001390542 NP_001390543
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NP_001390544 NP_001390545 NP_001390546 NP_001390547 |
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| 場所(UCSC) | 17章: 45.22 – 45.25 Mb | 11章: 103.06 – 103.09 MB |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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フォルミン様タンパク質1は、ヒトではFMNL1遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
この遺伝子はフォルミン関連タンパク質をコードしています。フォルミン関連タンパク質は、形態形成、細胞質分裂、および細胞極性に関与していることが示唆されています。選択的スプライスバリアントが報告されていますが、その全長配列は未だ決定されていません。[6]
相互作用
FMNL1はプロフィリン1、[7]、PFN2 [7]、RAC1 [7]と相互作用することが示されている。
参照
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000184922 – Ensembl、2017年5月
- ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000055805 – Ensembl、2017年5月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ Aronsson FC, Magnusson P, Andersson B, Karsten SL, Shibasaki Y, Lendon CL, Goate AM, Brookes AJ (1998年11月). 「NIKタンパク質キナーゼとC17orf1遺伝子:染色体マッピング、遺伝子構造、および17番染色体に関連する前頭側頭型認知症およびパーキンソン病における変異スクリーニング」Hum Genet . 103 (3): 340– 345. doi :10.1007/s004390050827. PMID 9799091. S2CID 11305597.
- ^ ab "Entrez Gene: FMNL1 formin-like 1".
- ^ abc Yayoshi-Yamamoto, S; Taniuchi I; Watanabe T (2000年9月). 「新規フォルミン関連タンパク質FRLはRacに結合し、マクロファージの細胞運動性と生存を制御する」Mol. Cell. Biol . 20 (18). アメリカ合衆国: 6872– 6881. doi :10.1128/MCB.20.18.6872-6881.2000. ISSN 0270-7306. PMC 86228. PMID 10958683 .
さらに読む
- Kennerson ML, Nassif NT, Nicholson GA (1998). 「C17orf1のゲノム構造と物理マッピング:CMT1A-REPバイナリーリピートの近位要素に関連する遺伝子」. Genomics . 53 (1): 110–112 . doi :10.1006/geno.1998.5453. PMID 9787083.
- Yayoshi-Yamamoto S, Taniuchi I, Watanabe T (2000). 「新規フォルミン関連タンパク質FRLはRacに結合し、マクロファージの細胞運動性と生存を制御する」Mol. Cell. Biol . 20 (18): 6872– 6881. doi :10.1128/MCB.20.18.6872-6881.2000. PMC 86228. PMID 10958683 .
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 16903. Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
- Katoh M, Katoh M (2003). 「ヒトDAAM2遺伝子のin silico同定と特性解析」. Int. J. Oncol . 22 (4): 915–20 . doi :10.3892/ijo.22.4.915. PMID 12632087.
- Katoh M, Katoh M (2003). 「ヒトFMNL1、FMNL2、FMNL3遺伝子のin silico同定と解析」. Int. J. Oncol . 22 (5): 1161–8 . doi :10.3892/ijo.22.5.1161. PMID 12684686.
- Favaro PM, de Souza Medina S, Traina F, et al. (2004). 「ヒト白血球フォルミン:リンパ系悪性腫瘍で発現しAktと関連する新規タンパク質」Biochem. Biophys. Res. Commun . 311 (2): 365– 371. doi :10.1016/j.bbrc.2003.10.012. PMID 14592423.
- Colland F, Jacq X, Trouplin V, et al. (2004). 「ヒトシグナル伝達経路の機能的プロテオミクスマッピング」Genome Res . 14 (7): 1324– 1332. doi :10.1101/gr.2334104. PMC 442148. PMID 15231748 .
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). 「NIH完全長cDNAプロジェクトの現状、品質、そして拡大:哺乳類遺伝子コレクション(MGC)」. Genome Res . 14 (10B): 2121– 2127. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 .
- Rual JF, Venkatesan K, Hao T, et al. (2005). 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップの構築に向けて」Nature . 437 (7062): 1173– 1178. Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
- Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, et al. (2006). 「シグナル伝達ネットワークにおける全体的、in vivo、および部位特異的なリン酸化ダイナミクス」. Cell . 127 (3): 635– 648. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983. S2CID 7827573.