| FMRIB ソフトウェア ライブラリ (FSL) | |
|---|---|
| 開発者 | FMRIB解析グループ |
| 安定版リリース | 6.0.7.18 / 2025年5月22日 （2025年5月22日） |
| 書かれた | C++、TCL |
| オペレーティング·システム | Linux、macOS |
| 入手可能な | 英語 |
| タイプ | 科学的視覚化と画像コンピューティング |
| ライセンス | カスタム、非商用 |
| Webサイト | fsl |
FMRIBソフトウェア ライブラリ(略称FSL ) は、機能的、構造的、拡散MRI 脳画像データ 用の画像分析および統計ツールを含むソフトウェア ライブラリです。
FSLは、AppleおよびPC（Linux）コンピュータ向けのコンパイル済みバイナリとソースコードの両方で利用可能です。非商用利用であれば無料でご利用いただけます。
FSL機能
| 機能的MRI | |
|---|---|
| ファバー | FABBER は、 ASL データのタスク モデリングに使用することを目的としたベイズモデル フィッティング ツールです。 |
| 偉業 | わかりやすく強力な GUI を備えたモデルベースの fMRI 分析: データ前処理 (スライス タイミング補正、MCFLIRT モーション補正、PRELUDE+FUGUE EPI アンワーピングを含む)、事前ホワイトニングによる FILM GLM時系列分析、構造および/または標準空間画像への登録、高度なベイズ手法を使用した完全に一般化された混合効果グループ分析。 |
| メロディック | 確率的独立成分分析（PICA）を用いたモデルフリーのfMRI解析。MELODICは、データ内の重要なノイズ源と信号源の数を自動的に推定し、関連する「ノイズモデル」を用いて、出力空間マップに有意性（「p値」）を割り当てることができます。 |
| フロブ | 最適な HRF 基底関数の生成とベイズ活性化推定。 |
| SMM | 空間混合モデリング - ボクセル分類を活性化と非活性化に空間的に正規化するヒストグラム混合モデリングを使用した対立仮説検定。 |
| 構造MRI | |
| ベット / ベット2 | 脳抽出ツール – 構造的・機能的データから脳と非脳を分離し、頭蓋骨と頭皮の表面をモデル化します。[ 1 ] |
| スーザン | 非線形ノイズ低減。 |
| 速い | FMRIB の自動セグメンテーション ツール – 脳のセグメンテーション (さまざまな組織タイプへ) とバイアス フィールド補正。 |
| いちゃつく | FMRIBの線形画像登録ツール – 線形インターモーダルおよびイントラモーダル登録。[ 2 ] |
| フーガ | B 0フィールド マップ を使用して EPI 画像の幾何学的歪みを補正します。 |
| シエナ | 脳萎縮を推定するための脳構造変化解析。 |
| 拡散MRI | |
| FDT | FMRIB の拡散ツールボックス – 低レベルの拡散パラメータ再構築と確率的トラクトグラフィーのためのツール。 |
| TBSS | トラクトベースの空間統計（FMRIBの拡散ツールボックスの一部） - 複数被験者の拡散データのボクセル単位の解析。[ 3 ] |
| その他のツール | |
| 推論 | さまざまな推論/しきい値設定ツール、これには以下が含まれます: Randomise (非パラメトリック統計しきい値設定用の順列ベースの推論ツール)、cluster (推論に GRF 理論を使用するクラスターベースのしきい値設定)、FDR (偽発見率推論)、および Glm (モデル設計マトリックスを作成するための GUI)。 |
| FSLeyes | 3D および 4D データのインタラクティブな表示ツール。 |
| AVWUTILS | 画像を変換および処理するためのその他のユーティリティ。 |
歴史と発展
FSLは、英国オックスフォード大学のFMRIB（脳機能的磁気共鳴画像）解析グループのメンバーを中心に作成されています。FSLの最初のリリースは2000年で、現在までに毎年約1つのメジャーリリースが発表されています。FMRIB解析グループは、主にウェルカム・トラスト、英国EPSRCおよび MRC研究評議会の資金提供を受けています。
参照
外部リンク
参考文献
- ^ SM Smith.高速かつ堅牢な自動脳画像抽出. ヒューマン・ブレイン・マッピング, 17(3):143-155, 2002年11月.
- ^ Jenkinson, M., Bannister, P., Brady, JM and Smith, SM「脳画像の堅牢かつ正確な線形登録と動き補正のための最適化の改善」 NeuroImage, 17(2), 825-841, 2002.
- ^ SM Smith, M. Jenkinson, H. Johansen-Berg, D. Rueckert, TE Nichols, CE Mackay, KE Watkins, O. Ciccarelli, MZ Cader, PM Matthews, TEJ Behrens. Tract-based spatial statistics: Voxelwise analysis of multisubject diffusion data . NeuroImage, 31:1487-1505, 2006.
