RBM9

RBFOX2
利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 2CQ3
識別子
別名	RBFOX2、FOX2、Fox-2、HNRBP2、HRNBP2、RBM9、RTA、dJ106I20.3、fxh、RNA結合タンパク質、fox-1ホモログ2、RNA結合fox-1ホモログ2
外部ID	OMIM : 612149 ; MGI : 1933973 ; HomoloGene : 49375 ; GeneCards : RBFOX2 ; OMA : RBFOX2 - オーソログ
遺伝子の位置（ヒト） 染色体 22番染色体（ヒト）[ 1 ] バンド 22q12.3 開始 35,738,736 bp [ 1 ] 終了 36,028,824 bp [ 1 ]
遺伝子の位置（マウス） 染色体 15番染色体（マウス）[ 2 ] バンド 15|15 D3 開始 77,078,990 bp [ 2 ] 終了 77,307,004 bp [ 2 ]
RNA発現パターン Bgee ヒト マウス（相同遺伝子） 最もよく発現している 神経節隆起 小脳皮質 小脳半球 小脳の右半球 平滑筋組織 子宮内膜間質細胞 上前頭回 アキレス腱 子宮体部 大腿筋 最もよく発現している 性器結節 外側中隔核 腹内側核 神経節隆起 胚尾部 上前頭回 乳頭体 海馬歯状回顆粒細胞 外側膝状体 小脳皮質 さらなる参照発現データ BioGPS さらなる参照発現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 転写コリプレッサー活性 転写因子結合 タンパク質結合 RNA結合 核酸結合 mRNA結合 細胞構成要素 核 核質 細胞質 細胞質ゾル 生物学的プロセス バランスを制御する神経筋プロセス 樹状突起の形態形成 mRNAのプロセシング スプライソソームを介した選択的mRNAスプライシングの調節 神経系の発達 RNAスプライシングの調節 細胞集団の増殖の調節 RNAスプライシング 放射状グリアによるプルキンエ細胞の移動 最終的な赤血球分化の調節 RNA代謝プロセス DNAテンプレートによる転写の負の調節 細胞内エストロゲン受容体シグナル伝達経路 線維芽細胞増殖因子受容体シグナル伝達経路 出典：Amigo / QuickGO
相同遺伝子 種 ヒト マウス Entrez 23543 93686 アンサンブル ENSG00000277564 ENSG00000100320 ENSMUSG00000033565 ユニプロット O43251 Q8BP71 RefSeq (mRNA) NM_001031695 NM_001082576 NM_001082577 NM_001082578 NM_001082579 NM_014309 NM_001349982 NM_001349983 NM_001349989 NM_001349990 NM_001349991 NM_001349992 NM_001349994 NM_001349995 NM_001349996 NM_001349997 NM_001349998 NM_001349999 NM_001394108 NM_001394109 NM_001394110 NM_001394111 NM_001394112 NM_001394113 NM_001394114 NM_001394115 NM_001110827 NM_001110828 NM_001110829 NM_001110830 NM_001286417 NM_001286418 NM_001286419 NM_053104 NM_175387 NM_001358770 NM_001358771 NM_001358772 RefSeq（タンパク質） NP_001026865 NP_001076045 NP_001076046 NP_001076047 NP_001076048 NP_055124 NP_001336911 NP_001336912 NP_001336918 NP_001336919 NP_001336920 NP_001336921 NP_001336923 NP_001336924 NP_001336925 NP_001336926 NP_001336927 NP_001336928 NP_001104297 NP_001104298 NP_001104299 NP_001104300 NP_001273346 NP_001273347 NP_001273348 NP_444334 NP_780596 NP_001345699 NP_001345700 NP_001345701 場所（UCSC） 22番地: 35.74～36.03 メガバイト 15番地: 77.08～77.31 メガバイト PubMed検索 [ 3 ] [ 4 ]
ウィキデータ
ヒトの表示/編集 マウスの表示/編集

RNA結合モチーフタンパク質9（RBM9）は、 Rbfox2としても知られ、ヒトではRBM9遺伝子によってコードされているタンパク質です。^{[ 5 ]}

機能

Rbfox2は、 C. elegansの遺伝子Fox-1に類似したいくつかのヒト遺伝子の1つです。この遺伝子は、神経系および他の細胞型における選択的スプライシングの重要な調節因子と考えられているRNA結合タンパク質をコードしています。Rbfox2と関連タンパク質Rbfox1は、多くの選択的スプライシングを受けたエクソンに隣接するイントロン内の保存された(U)GCAUG RNAモチーフに結合し、成熟した転写産物における選択的エクソンの包含または排除を促進します。^{[ 6 ] [ 7 ]}このタンパク質はまた、エストロゲン受容体1転写因子と相互作用し、エストロゲン受容体1の転写活性を制御します。この遺伝子には、異なるアイソフォームをコードする複数の転写産物バリアントが見つかっています。^{[ 5 ]}

CLIP-seqによって決定されたRbfox2は、選択的スプライシングを受けるエクソンの近くに結合し、エクソンの下流（インクルージョン）または上流（エクソンスキッピング）のイントロンに結合することで、選択的スプライシングにおけるエクソンの包含または排除を制御します。Rbfox2の存在は幹細胞の生存に重要であり、Rbfox2のノックダウンはアポトーシスマーカーを活性化します。^{[ 8 ]}

参照

• 選択的スプライシング
• RNA結合タンパク質

参考文献

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2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000033565 – Ensembl、2017年5月
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4. 「マウスPubMedリファレンス：」米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. 「Entrez Gene: RBM9 RNA結合モチーフタンパク質9」。
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さらに詳しい情報

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外部リンク

• PDBe-KBのUniProt : O43251（RNA結合タンパク質fox-1ホモログ2）のPDBで利用可能なすべての構造情報の概要