FRAT1

FRAT1
利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 1GNG、3ZRK、3ZRL、3ZRM、4AFJ
識別子
エイリアス	FRAT1、WNTシグナル伝達経路調節因子、WNTシグナル伝達経路1のFRAT調節因子
外部ID	オミム：602503; MGI : 109450;ホモロジーン: 3999;ジーンカード：FRAT1; OMA :FRAT1 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 10番染色体（ヒト）[1] バンド 10q24.1 始める 97,319,271 bp [1] 終わり 97,321,915 bp [1]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 19番染色体（マウス）[2] バンド 19 C3|19 35.3 cM 始める 41,818,409 bp [2] 終わり 41,821,022 bp [2]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 血 単球 睾丸 顆粒球 膵管細胞 二次卵母細胞 生殖腺 肝臓の右葉 骨髄 脾臓 上位の表現 精子細胞 顆粒球 太ももの筋肉 網膜の神経層 胚 精母細胞 桑実胚 十二指腸 CA3領域 吻側回遊流 より多くの参照表現データ バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 タンパク質結合 細胞成分 細胞質 細胞内膜小器官 細胞質 生物学的プロセス Wntシグナル伝達経路 β-カテニン破壊複合体の分解 標準的なWntシグナル伝達経路 標準的なWntシグナル伝達経路の正の制御 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 10023 14296 アンサンブル ENSG00000165879 ENSMUSG00000067199 ユニプロット Q92837 P70339 RefSeq (mRNA) NM_181355 NM_005479 NM_008043 RefSeq（タンパク質） NP_005470 NP_032069 場所（UCSC） 10章: 97.32 – 97.32 Mb 19章: 41.82 – 41.82 Mb PubMed検索 [3] [4]
ウィキデータ
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FRAT1原癌遺伝子は、ヒトではFRAT1遺伝子によってコードされるタンパク質である。^{[5] [6]}

この遺伝子によってコードされるタンパク質はGSK-3結合タンパク質ファミリーに属し、腫瘍の進行およびリンパ腫の形成に機能する可能性がある。^[6]

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000165879 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000067199 – Ensembl、2017年5月
3. 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. Jonkers J, Korswagen HC, Acton D, Breuer M, Berns A (1997年3月). 「新規プロトオンコゲンFrat1の活性化はマウスT細胞リンパ腫の進行に寄与する」. EMBO J. 16 ( 3): 441–50 . doi :10.1093/emboj/16.3.441. PMC 1169648. PMID  9034327 . 
6. 「Entrez Gene: FRAT1 は進行した T 細胞リンパ腫で頻繁に再編成される」。

さらに読む

• Li L, Yuan H, Weaver CD, et al. (1999). 「AxinとFrat1はdvlおよびGSKと相互作用し、Wntシグナルを介したLEF-1の制御においてDvlとGSKを橋渡しする」EMBO J. 18 ( 15): 4233–40 . doi :10.1093/emboj/18.15.4233. PMC  1171499. PMID  10428961 .
• 斉藤 剛志、加藤 正之 (2001). 「ヒト染色体10q24.1領域にクラスター化したFRAT1およびFRAT2は胃癌において発現が亢進している」. Int. J. Oncol . 19 (2): 311–5 . doi :10.3892/ijo.19.2.311. PMID  11445844.
• Bax B, Carter PS, Lewis C, et al. (2002). 「β-カテニンのリン酸化を阻害するペプチドFRATtideと複合体を形成したリン酸化GSK-3βの構造」Structure . 9 (12): 1143–52 . doi : 10.1016/S0969-2126(01)00679-7 . PMID  11738041.
• 斉藤 剛志、峯 剛志、加藤 正之 (2002). 「ヒト癌におけるプロトオンコゲンFRAT1の分子クローニングと発現」. Int. J. Oncol . 20 (4): 785–9 . doi :10.3892/ijo.20.4.785. PMID  11894125.
• Freemantle SJ, Portland HB, Ewings K, et al. (2002). 「ヒトGSK-3結合タンパク質FRAT1およびFRAT2の特性解析と組織特異的発現」Gene . 291 ( 1– 2): 17– 27. doi :10.1016/S0378-1119(02)00594-2. PMID  12095675.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241. PMID  12477932 .
• 日野 聡、道上 剛、浅島 正治、菊池 明 (2003). 「カゼインキナーゼIイプシロンはDvl-1とFrat-1の結合を促進し、Wnt-3a誘導性β-カテニン蓄積に必須である」. J. Biol. Chem . 278 (16): 14066– 73. doi : 10.1074/jbc.M213265200 . PMID  12556519.
• Khambata-Ford S, Liu Y, Gleason C, et al. (2003). 「レトロウイルスプラスミドライブラリーに基づく機能レポーター遺伝子アッセイを用いたヒトゲノムプロモーター領域の同定」Genome Res . 13 (7): 1765–74 . doi :10.1101/gr.529803. PMC 403750.  PMID 12805274  .
• Deloukas P, Earthrowl ME, Grafham DV, et al. (2004). 「ヒト第10染色体のDNA配列と比較解析」. Nature . 429 (6990): 375–81 . Bibcode :2004Natur.429..375D. doi : 10.1038/nature02462 . PMID  15164054.
• Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). 「NIH完全長cDNAプロジェクトの現状、品質、そして拡大：哺乳類遺伝子コレクション（MGC）」. Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928.  PMID 15489334  .
• Wang Y, Hewitt SM, Liu S, et al. (2006). 「ヒトFRAT1発現の組織マイクロアレイ解析と卵巣腫瘍におけるβ-カテニンの細胞内局在との相関」Br. J. Cancer . 94 (5): 686–91 . doi :10.1038/sj.bjc.6602988. PMC 2361213.  PMID 16479254  .
• Hagen T, Cross DA, Culbert AA, et al. (2007). 「グリコーゲン合成酵素キナーゼ3活性の基質特異的制御因子であるFRAT1は、プロテインキナーゼAの細胞内基質である。」J. Biol. Chem . 281 (46): 35021–9 . doi : 10.1074/jbc.M607003200 . PMID  16982607.

外部リンク

• UCSC ゲノム ブラウザにおける FRAT1 ヒト遺伝子の位置。
• UCSC ゲノム ブラウザにおける FRAT1 ヒト遺伝子の詳細。