グラフス

遺伝子ファミリー

GPCRスーパーファミリーは、約800個の遺伝子を含むヒトゲノム最大の遺伝子ファミリーです。[1]脊椎動物スーパーファミリーは系統学的に5つの主要なファミリーに分類できるため、GRAFS分類システムが提案されています。

GRAFSはグルタミン酸ロドプシン接着Frizzled / Taste2セクレチンの略称です[2]これらは、古典的なクラスC(クラスC、グルタミン酸)、A(ロドプシン様)、B2(セクレチン受容体ファミリー、長いN末端)、F(Frizzled / Smoothened)、およびB1+3(その他のセクレチン)に対応します。[3]最近では、 Taste2がロドプシン様受容体に近いと考えられています[4]

参照

参考文献

  1. ^ Lander, ES; Linton, LM; Birren; 国際ヒトゲノムシークエンシングコンソーシアム; 他 (2001年2月15日). 「ヒトゲノムの初期シークエンシングと解析」(PDF) . Nature . 409 (6822): 860– 921. Bibcode :2001Natur.409..860L. doi : 10.1038/35057062 . PMID  11237011.
  2. ^ Fredriksson, R; Lagerström, MC; Lundin, LG; Schiöth, HB (2003年6月). 「ヒトゲノム中のGタンパク質共役受容体は5つの主要ファミリーを形成する。系統解析、パラロゴングループ、およびフィンガープリント」. Molecular Pharmacology . 63 (6): 1256–72 . doi :10.1124/mol.63.6.1256. PMID  12761335.
  3. ^ Krishnan, A; Almén, MS; Fredriksson, R; Schiöth, HB (2012). 「GPCRの起源:真菌における哺乳類様ロドプシン、接着、グルタミン酸、およびFrizzled GPCRの同定」. PLOS ONE . 7 (1) e29817. Bibcode :2012PLoSO...729817K. doi : 10.1371/journal.pone.0029817 . PMC 3251606 . PMID  22238661. 
  4. ^ Nordström KJ, Sällman Almén M, Edstam MM, Fredriksson R, Schiöth HB (2011年9月). 「独立したHHsearch、Needleman-Wunsch法、およびモチーフ解析により、Gタンパク質共役受容体ファミリーの大部分の全体的な階層構造が明らかになった」. Molecular Biology and Evolution . 28 (9): 2471–80 . doi : 10.1093/molbev/msr061 . PMID  21402729.


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