遺伝子トラッピング

遺伝子トラッピングは、生物のゲノム全体に 挿入変異を導入するために使用されるハイスループットアプローチです。

方法

トラッピングは、プロモーターのないレポーター遺伝子および/または選択可能な遺伝子マーカーと、上流の 3' スプライス サイト (スプライス アクセプター; SA) および下流の転写終結配列 (ポリアデニル化配列; polyA)が挟んだ遺伝子トラッピング カセットを主要素とする遺伝子トラッピング ベクターを使用して実行されます。

遺伝子トラップカセットは、発現遺伝子のイントロンに挿入されると、その遺伝子の内因性プロモーターから融合転写産物として転写され、挿入部位の上流のエクソンがレポーター/選択マーカー遺伝子にインフレームで接合される。挿入されたポリアデニル化部位で転写は未熟に終結するため、処理された融合転写産物は、細胞タンパク質とレポーター/選択マーカーの切断された非機能的バージョンをコードする。このように、遺伝子トラップは、挿入部位でトラップされた遺伝子の発現を同時に不活性化し、報告するとともに、破壊された遺伝子を迅速に同定するためのDNAタグ（遺伝子トラップ配列タグ、GTST）を提供する。^{[ 1 ] [ 2 ]}

アクセス

国際遺伝子トラップコンソーシアムはデータを一元管理し、改変細胞株を供給している。^{[ 3 ]}

参考文献

1. Cobellis, G; Nicolaus, G; et al. (2005). 「カセット交換部位による遺伝子のタグ付け」 . Nucleic Acids Res . 33 (4): e44. doi : 10.1093/nar/ gni045 . PMC  552971. PMID  15741177 .
2. De-Zolt, S; Schnutgen, F; et al. (2006). 「マウス胚性幹細胞における分泌経路遺伝子のハイスループットトラッピング」 . Nucleic Acids Res . 34 (3): 25. doi : 10.1093/nar/gnj026 . PMC 1369290. PMID 16478711 .  
3. 「IGTC、国際遺伝子トラップコンソーシアム」 www.genetrap.org . 2018年2月11日閲覧。

さらに読む

• Gossler A, Joyner AL, Rossant J, Skarnes WC (1989年4月). 「マウス胚性幹細胞とレポーター構築物を用いた発生制御遺伝子の検出」. Science . 244 (4903): 463–5 . doi : 10.1126/science.2497519 . PMID  2497519 .
• von Melchner H, Ruley HE (1989年8月). 「レトロウイルスプロモータートラップを用いた細胞プロモーターの同定」 . Journal of Virology . 63 (8): 3227–33 . doi : 10.1128/JVI.63.8.3227-3233.1989 . PMC  250892. PMID  2545900 .
• Friedrich G, Soriano P (1991年9月). 「胚性幹細胞におけるプロモータートラップ：マウスにおける発生遺伝子の同定と変異のための遺伝子スクリーニング」 . Genes & Development . 5 (9): 1513–23 . doi : 10.1101/gad.5.9.1513 . PMID  1653172 .
• Zambrowicz BP, Friedrich GA, Buxton EC, Lilleberg SL, Person C, Sands AT (1998年4月). 「マウス胚性幹細胞における2,000遺伝子の破壊と配列同定」. Nature . 392 ( 6676): 608–11 . doi : 10.1038/33423 . PMID  9560157. S2CID  4329895 .
• Wiles MV, Vauti F, Otte J, Füchtbauer EM, Ruiz P, Füchtbauer A, Arnold HH, Lehrach H, Metz T, von Melchner H, Wurst W (2000年1月). 「胚性幹細胞から変異マウスを作製するための遺伝子トラップ配列タグライブラリーの構築」. Nature Genetics . 24 (1): 13–4 . doi : 10.1038/71622 . PMID  10615117. S2CID  29505338 .
• Stanford WL, Cohn JB, Cordes SP (2001年10月). 「遺伝子トラップ突然変異誘発：過去、現在、そして未来」. Nature Reviews Genetics . 2 (10): 756–68 . doi : 10.1038/35093548 . PMID  11584292. S2CID  11468334 .
• Skarnes WC, von Melchner H, Wurst W, Hicks G, Nord AS, Cox T, Young SG, Ruiz P, Soriano P, Tessier-Lavigne M, Conklin BR, Stanford WL, Rossant J (2004年6月). 「マウス機能ゲノミクスのための公開遺伝子トラップリソース」 . Nature Genetics . 36 (6): 543–4 . doi : 10.1038/ng0604-543 . PMC  2716026. PMID  15167922 .
• Hansen J, Floss T, Van Sloun P, Füchtbauer EM, Vauti F, Arnold HH, Schnütgen F, Wurst W, von Melchner H, Ruiz P (2003年8月). 「マウスゲノムの機能解析のための大規模遺伝子駆動型突然変異誘発アプローチ」 .米国科学アカデミー紀要. 100 (17): 9918–22 . doi : 10.1073/pnas.1633296100 . PMC  187885. PMID  12904583 .
• Zambrowicz BP, Abuin A, Ramirez-Solis R, Richter LJ, Piggott J, BeltrandelRio H, 他 (2003年11月). 「Wnk1キナーゼ欠損はマウスの血圧を低下させる：治療介入の潜在的標的を同定するための遺伝子トラップスクリーニング」 .米国科学アカデミー紀要. 100 (24): 14109–14 . doi : 10.1073/pnas.2336103100 . PMC  283554. PMID  14610273 .
• Schnütgen F, De-Zolt S, Van Sloun P, Hollat​​z M, Floss T, Hansen J, Altschmied J, Seisenberger C, Ghyselinck NB, Ruiz P, Chambon P, Wurst W, von Melchner H (2005年5月). 「マウスゲノムの機能解析のための多目的アレルのゲノムワイドな作製」 .米国科学アカデミー紀要. 102 (20): 7221–6 . doi : 10.1073/pnas.0502273102 . PMC  1129123. PMID  15870191 .
• Springer PS (2000年7月). 「遺伝子トラップ：植物の発育とゲノミクスのためのツール」 . The Plant Cell . 12 (7): 1007–20 . doi : 10.2307/3871251 . JSTOR  3871251. PMC  149045. PMID  10899970 .

外部リンク