HDAC3

HDAC3
利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 4A69
識別子
エイリアス	HDAC3、HD3、RPD3、RPD3-2、ヒストン脱アセチル化酵素3
外部ID	オミム: 605166 ; MGI : 1343091 ;ホモロジーン: 48250 ;ジーンカード: HDAC3 ; OMA : HDAC3 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 5番染色体（ヒト）[ 1 ] バンド 該当なし 始める 141,620,876 bp [ 1 ] 終わり 141,636,870 bp [ 1 ]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 18番染色体（マウス）[ 2 ] バンド 18 19.81 cM|18 B3 始める 38,068,897 bp [ 2 ] 終わり 38,088,069 bp [ 2 ]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 小脳の右半球 右副腎皮質 左副腎 左副腎皮質 脚の皮膚 顆粒球 腹部の皮膚 下垂体前葉 右卵巣 甲状腺の右葉 上位の表現 精母細胞 心室帯 性器結節 胚の尾 上前頭回 太ももの筋肉 リップ 卵黄嚢 一次視覚野 神経管 より多くの参照表現データ バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 NAD依存性ヒストン脱アセチル化酵素活性（H3-K14特異的） 転写コリプレッサー活性 ヒストン脱アセチル化酵素活性 タンパク質脱アセチル化酵素活性 転写因子結合 ヒストン脱アセチル化酵素結合 クロマチン結合 NF-κB結合 タンパク質結合 酵素結合 加水分解酵素活性 サイクリン結合 細胞成分 細胞質 ヒストン脱アセチル化酵素複合体 細胞質 ゴルジ体 細胞膜 転写抑制因子複合体 核質 紡錘体微小管 核 有糸分裂紡錘体 生物学的プロセス ヒストンH3の脱アセチル化 タンパク質リン酸化の正の制御 転写の制御、DNAテンプレート タンパク質安定性の調節 アポトーシス過程の負の調節 RNAポリメラーゼIIによる転写の負の制御 流体せん断応力に対する細胞応答 転写、DNAテンプレート スピンドルアセンブリ タンパク質の脱アセチル化 JNKカスケードの負の制御 概日リズム 筋管分化の負の制御 転写の負の制御、DNAテンプレート ヒストンの脱アセチル化 TORシグナル伝達の正の調節 RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御 核酸テンプレート転写の負の制御 脂質代謝プロセスの調節 クロマチン組織 核へのタンパク質輸入の正の制御 ヒストンH4の脱アセチル化 寒冷誘発性熱産生の正の調節 タンパク質ユビキチン化の正の制御 遺伝子発現の概日リズム制御 概日リズムの調節 リズミカルなプロセス 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 8841 15183 アンサンブル ENSG00000171720 ENSMUSG00000024454 ユニプロット O15379 O88895 RefSeq (mRNA) NM_003883 NM_010411 RefSeq（タンパク質） NP_003874 NP_001341968 NP_001341969 NP_001341970 NP_034541 場所（UCSC） 5番目の文字: 141.62 – 141.64 MB 18章: 38.07 – 38.09 MB PubMed検索 [ 3 ] [ 4 ]
ウィキデータ
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ヒストン脱アセチル化酵素3は、ヒトとマウスの両方においてHDAC3遺伝子によってコードされる酵素である。^{[ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ]}

関数

ヒストンは、 DNA をヌクレオソームと呼ばれる構造単位にまとめ、編成するアルカリ性の正に帯電したタンパク質です。ヌクレオソームはクロマチンの主要タンパク質成分です。^{[ 9 ]}翻訳後の酵素を介したヒストン尾部のリジンのアセチル化と脱アセチル化により、負に帯電した DNA 骨格とヒストン間の静電相互作用が変化し、局所的なクロマチン構造が修正されます。 ^{[ 10 ] [ 11 ]} HDAC3 はヒストン脱アセチル化酵素スーパーファミリーのクラス I メンバーであり、機能と配列相同性に基づいて4 つのクラスに分類されます。 ^{[ 12 ]} HDAC3 はエンハンサーにリクルートされ、そこでエピゲノムを変調させ、近くの遺伝子発現を制御します。これは細胞核にのみ存在し、 NCORとSMRT (NCOR2)を含む核受容体コリプレッサー複合体の一部として生化学的に精製された唯一の内因性ヒストン脱アセチル化酵素です。そのため、他のHDACとは異なり、HDAC3は核内受容体の転写活性を制御する上で明確な役割を果たしている。^{[ 12 ]}

腸管恒常性における役割

ヒストン脱アセチル化酵素は、内因性因子、食事成分、合成阻害剤、細菌由来のシグナルによって制御される。腸管上皮細胞（IEC）におけるHDAC3の特異的欠失を持つマウスを用いた研究では、IECにおける遺伝子発現の調節異常が示された。これらの欠失変異マウスでは、パネート細胞の喪失、IEC機能の低下、そして腸内常在細菌の組成変化が観察された。これらの有害影響は無菌マウスでは発生しなかったことから、腸内微生物叢の定着に依存していることが示唆される。しかし、変異体関連微生物叢が定着した正常な無菌マウスでは同様の欠陥は発現しなかったため、これらの有害影響は変化した微生物叢の存在によって引き起こされるものではない。

正確なメカニズムとシグナルは未だ解明されていないものの、HDAC3は腸内細菌叢から共生細菌由来のシグナルと相互作用することが知られている。これらの相互作用は、宿主と共生細菌との間のバランスの取れた関係を確立し、腸内恒常性を維持するために不可欠な上皮細胞応答を調整する。^{[ 13 ] [ 14 ] [ 15 ] [ 16 ]}

相互作用

HDAC3 は以下と相互作用することが示されています。

• CBFA2T3 , ^{[ 17 ] [ 18 ]}
• CCND1 , ^{[ 19 ] [ 20 ]}
• GATA1 , ^{[ 21 ]}
• GATA2 , ^{[ 22 ]}
• GPS2 , ^{[ 23 ]}
• GTF2I、^{[ 24 ] [ 25 ]}
• HDAC4、^{[ 26 ] [ 27 ] [ 28 ] [ 29 ]}
• HDAC5、^{[ 23 ] [ 27 ] [ 28 ] [ 29 ]}
• HDAC7A , ^{[ 26 ]}
• HDAC9、^{[ 30 ] [ 31 ]}
• MAP3K7IP2 , ^{[ 32 ]}
• MAPK11 , ^{[ 33 ]}
• NCOR1、^{[ 23 ] [ 26 ] [ 28 ] [ 34 ] [ 35 ] [ 36 ] [ 37 ]}
• NCOR2、^{[ 28 ] [ 34 ] [ 35 ] [ 36 ] [ 37 ] [ 38 ] [ 39 ]}
• PPARD、^{[ 40 ] [ 41 ]}
• PPARG、^{[ 40 ] [ 42 ]}
• PML ^{[ 43 ]}
• RBBP4 , ^{[ 44 ]}
• RELA、^{[ 45 ]}
• RP、^{[ 42 ] [ 46 ]}
• RUNX2 , ^{[ 47 ]}
• SUV39H1、^{[ 48 ]}
• TCP1 , ^{[ 39 ]}
• TBL1X、^{[ 23 ] [ 38 ]}
• TR2、^{[ 40 ] [ 49 ] [ 50 ]}
• UBC、^{[ 51 ]}
• YY1、^{[ 52 ] [ 53 ]} および
• ZBTB33 . ^{[ 34 ]}

参照

• ヒストン脱アセチル化酵素

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さらに読む

• Verdin E, Dequiedt F, Kasler HG (2003年5月). 「クラスIIヒストン脱アセチル化酵素：多用途制御因子」. Trends in Genetics . 19 (5): 286– 293. doi : 10.1016/S0168-9525(03)00073-8 . hdl : 2268/80861 . PMID  12711221 .

外部リンク

• 米国国立医学図書館の医学主題標目表（MeSH）におけるHDAC3+タンパク質、+ヒト

この記事には、パブリック ドメインである米国国立医学図書館のテキストが組み込まれています。