ヒトゲノムの一部
HLA-Cw7 (Cw7) は、HLA-C血清型グループ内のヒト白血球抗原 血清型です。(HLA血清型のより一般的な情報については、 「ヒト白血球抗原の歴史と命名」の記事を参照してください。) Cw7は、HLA-Cw α鎖のα7サブセットの抗体認識によって決定されます。血清型Cw7では、α鎖はHLA-Cw *07対立遺伝子グループによってコードされ、β鎖はB2M遺伝子座によってコードされています。[1] Cw7とCw *07はほぼ同義です。Cw7は西アフリカからアイルランドでより一般的です。ヨーロッパのCw7は、AH8.1およびHLA B7-DR15-DQ6ハプロタイプの一部です。これらのスーパータイプのクラス I 領域は、 HLA A1-B8 ハプロタイプ、HLA A3-B7、HLA-A2-B7、および HLA A24-B7 です。
血清型
Cw7による一部のHLA Cw*07遺伝子産物の認識[2]
| Cw*07
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Cw7
|
サンプル
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| 対立遺伝子 |
%
|
サイズ(N)
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| *0701 |
74 |
304
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| *0702 |
68 |
976
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分布
HLA Cw*0701頻度| 研究対象集団 | 頻度 (%)[3] |
|---|
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| カメルーンのピグミーバカ | 25.0 |
|---|
| アイルランド南部 | 21.2 |
|---|
| ドイツのエッセン | 20.9 |
|---|
| カメルーン・サワ | 19.2 |
|---|
| アイルランド北部 | 18.7 |
|---|
| フランス西部 | 18.1 |
|---|
| ケニア | 17.8 |
|---|
| ブルキナファソ フラニ語 | 17.4 |
|---|
| オーストラリア ニューサウスウェールズ州 | 17.3 |
|---|
| フランス南東部 | 17.3 |
|---|
| モロッコ「ベルベル」ナドールメ… | 16.7 |
|---|
| スーダン人 | 16.5 |
|---|
| イギリスの白人 | 16.1 |
|---|
| ウガンダ カンパラ | 16.0 |
|---|
| ブラジル | 15.6 |
|---|
| アメリカ白人 (2) | 15.5 |
|---|
| ケニア・ナンディ | 15.2 |
|---|
| パキスタン・バローチ | 15.2 |
|---|
| ブルキナファソ リマイベ | 14.9 |
|---|
| フィンランド | 14.4 |
|---|
| チェコ共和国 | 14.2 |
|---|
| スイス・ジュネーブ | 13.6 |
|---|
| 南アフリカ ナタール タミル | 13.5 |
|---|
| カメルーン・バミレケ | 13.0 |
|---|
| インド カンデシュ・パウラ | 13.0 |
|---|
| カメルーン・ベティ | 12.9 |
|---|
| チュニジア | 12.6 |
|---|
| インド ニューデリー | 12.5 |
|---|
| サウジアラビア グライアットと… | 12.3 |
|---|
| 七面鳥 | 12.3 |
|---|
| ザンビア ルサカ | 12.2 |
|---|
| ルオ・ケニア | 11.7 |
|---|
| ブルキナファソ・モシ | 11.3 |
|---|
| 韓国 (1) | 11.1 |
|---|
| スペイン 東アンダルシア | 11.0 |
|---|
| アメリカのヒスパニック | 10.9 |
|---|
| レバノン | 10.8 |
|---|
| インド タミル・ナードゥ州 ナダール | 10.7 |
|---|
| ジンバブエ ハラレ ショナ語 | 10.6 |
|---|
| ロシア アルハンゲリスク ポモール | 10.0 |
|---|
| ジョージア トビリシ ジョージア… | 9.8 |
|---|
| メキシコ ザプトテック オアハカ | 9.7 |
|---|
| イスラエル・アラブ・ドルーズ | 9.0 |
|---|
| セネガル ニオホロ・マンデンカ | 8.7 |
|---|
| 米国北米先住民… | 8.6 |
|---|
| パキスタン・シンディー語 | 8.3 |
|---|
| インド北デリー | 8.0 |
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| イラン・バローチ | 7.8 |
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| タイ | 7.7 |
|---|
| シンガポール リアウ マレー語 | 7.5 |
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| インド西海岸のパルシー | 7.0 |
|---|
| ジョージア トビリシ クルド人 | 6.9 |
|---|
| パキスタン・カラシュ | 6.5 |
|---|
| マリ・バンディアガラ | 6.2 |
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| パキスタン・ブルショ | 5.6 |
|---|
| パキスタン・カラチ・パルシー | 5.5 |
|---|
| パキスタン・パタン | 5.5 |
|---|
| ロシア ムルマンスク サオミ | 4.0 |
|---|
| シンガポール ジャワ インドネシア… | 4.0 |
|---|
| インド ムンバイ マラーター | 3.7 |
|---|
| オーストラリア・インディグ。ケープ・ヨー… | 3.4 |
|---|
| パキスタン・ブラフイ | 3.4 |
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| インド西部ビルス | 3.0 |
|---|
| 中国北漢 | 2.9 |
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| ヨルダン アンマン | 2.8 |
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| 中国内モンゴル | 2.5 |
|---|
| イタリア北部パヴィア | 2.5 |
|---|
| ロシア ネネツ | 2.4 |
|---|
| 中国青海省 | 2.3 |
|---|
| オーストラリア インディグ グルート E… | 2.1 |
|---|
| ロシア・トゥヴァ共和国 (2) | 2.0 |
|---|
| アメリカ ハワイ 沖縄 | 1.9 |
|---|
| アメリカアジア人 | 1.8 |
|---|
| 中国南漢 | 1.6 |
|---|
| 中国 北京 | 1.5 |
|---|
| パプアニューギニア ワニゲラ | 1.4 |
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| 対立遺伝子頻度のみ提示 |
HLA Cw*0702頻度| 研究対象集団 | 頻度 (%)[3] |
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| ベネズエラ シエラ・デ・ペリ… | 71.4 |
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| PNGニューブリテンラバウル | 57.1 |
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| メキシコ ミシュテカ オアハカ | 33.3 |
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| 中国雲南省リス族 | 32.9 |
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| 台湾太魯閣 | 31.8 |
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| 中国雲南省 | 30.7 |
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| ベネズエラ ペルハ山 … | 30.3 |
|---|
| PNG マダン | 30.2 |
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| メキシコ ザプトテック オアハカ | 28.4 |
|---|
| 台湾ツオウ語 | 27.5 |
|---|
| メキシコ・ミセ・オアハカ | 26.4 |
|---|
| ロシア アルハンゲリスク ポモール | 26.0 |
|---|
| Ch.広東梅州市… | 25.8 |
|---|
| パキスタン・ブルショ | 25.5 |
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| アメリカ サウスダコタ州 ラコタ S… | 24.4 |
|---|
| ロシア ネネツ | 23.8 |
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| アメリカ ニューメキシコ州 キャノンシート … | 23.2 |
|---|
| 中国南漢 | 20.8 |
|---|
| ブラジル テレナ | 20.2 |
|---|
| 中国広州 | 19.9 |
|---|
| アメリカアジア人 | 19.5 |
|---|
| アイルランド北部 | 18.6 |
|---|
| スイス・ジュネーブ | 18.2 |
|---|
| 台湾ブヌン語 | 17.8 |
|---|
| アイルランド南部 | 17.4 |
|---|
| シンガポール ジャワ インドネシア… | 17.0 |
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| フィリピン イヴァタン | 16.0 |
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| 台湾ルカイ | 16.0 |
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| オーストラリア ニューサウスウェールズ州 | 15.8 |
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| フィンランド | 15.6 |
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| アメリカ南部テキサスのヒスパニック | 15.6 |
|---|
| パキスタン・シンディー語 | 15.5 |
|---|
| イギリスの白人 | 15.5 |
|---|
| サウジアラビア グライアットと… | 15.2 |
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| カメルーンのピグミーバカ | 15.0 |
|---|
| インド タミル・ナードゥ州 ナダール | 14.8 |
|---|
| 日本中央 | 14.6 |
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| ロシア ムルマンスク サオミ | 14.0 |
|---|
| アメリカ ハワイ 沖縄 | 13.8 |
|---|
| 中国 北京 | 13.6 |
|---|
| 中国チベット | 13.3 |
|---|
| 中国青海省 | 13.2 |
|---|
| タイ | 13.0 |
|---|
| 米国北米先住民… | 12.8 |
|---|
| 中国内モンゴル | 12.7 |
|---|
| 日本 (3) | 12.7 |
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| パキスタン・ブラフイ | 12.5 |
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| PNG ワニゲラ | 12.5 |
|---|
| アメリカの白人ポップ2 | 12.5 |
|---|
| アメリカのヒスパニック | 12.4 |
|---|
| チェコ共和国 | 12.3 |
|---|
| 中国北漢 | 11.9 |
|---|
| 台湾パイワン族 | 11.8 |
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| 中国 武漢 | 11.6 |
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| カメルーン・サワ | 11.5 |
|---|
| 台湾シラヤ語 | 10.8 |
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| 台湾アミ | 10.7 |
|---|
| ニューカレドニア | 10.0 |
|---|
| インド北デリー | 9.9 |
|---|
| オーストラリア・インディグ。ケープ・ヨー… | 9.6 |
|---|
| パキスタン・パタン | 9.5 |
|---|
| フランス西部 | 9.4 |
|---|
| イラン・バローチ | 9.4 |
|---|
| 南アフリカ ナタール タミル | 9.4 |
|---|
| ドイツのエッセン | 9.1 |
|---|
| 台湾プユマ語 | 9.0 |
|---|
| インド ニューデリー | 8.9 |
|---|
| パキスタン・カラシュ | 8.7 |
|---|
| インド ムンバイ マラーター | 8.6 |
|---|
| ロシア トゥヴァ 人口 2 | 8.6 |
|---|
| 韓国 (3) | 8.3 |
|---|
| アメリカ領サモア | 8.0 |
|---|
| ブラジル | 8.0 |
|---|
| アメリカ合衆国 アフリカ系アメリカ人 | 8.0 |
|---|
| フランス南東部 | 7.2 |
|---|
| カメルーン・バミレケ | 7.1 |
|---|
| インド西部ビルス | 7.0 |
|---|
| オーストラリア独立ユエンドゥム | 6.8 |
|---|
| カメルーン・ベティ | 6.6 |
|---|
| ジョージア トビリシ ジョージア… | 6.5 |
|---|
| ウガンダ カンパラ | 6.1 |
|---|
| 七面鳥 | 6.0 |
|---|
| スペイン 東アンダルシア | 5.5 |
|---|
| PNG ウォセラ | 5.4 |
|---|
| マリ・バンディアガラ | 4.7 |
|---|
| ジンバブエ ハラレ ショナ語 | 4.6 |
|---|
| メキシコ チワワ州 タ… | 4.5 |
|---|
| パキスタン・バローチ | 4.5 |
|---|
| ケニア | 4.4 |
|---|
| ザンビア ルサカ | 4.4 |
|---|
| レバノン | 4.1 |
|---|
| イスラエル・アラブ・ドルーズ | 4.0 |
|---|
| ルオ・ケニア | 3.8 |
|---|
| チュニジア | 3.6 |
|---|
| PNG イースタンハイランド ゴア… | 3.5 |
|---|
| スーダン人 | 3.5 |
|---|
| ジョージア トビリシ クルド人 | 3.4 |
|---|
| モロッコ「ベルベル」ナドールメ… | 3.2 |
|---|
| イギリス ロンドン アシュケナージ … | 2.9 |
|---|
|
|
|---|
| 対立遺伝子頻度のみ提示 |
参考文献
- ^ Arce-Gomez B, Jones EA, Barnstable CJ, Solomon E, Bodmer WF (1978年2月). 「体細胞雑種におけるHLA-A抗原およびB抗原の遺伝的制御:β2ミクログロブリンの必要性」. Tissue Antigens . 11 (2): 96– 112. doi :10.1111/j.1399-0039.1978.tb01233.x. PMID 77067.
- ^ アレルクエリフォームIMGT/HLA -欧州バイオインフォマティクス研究所
- ^ ab Middleton, D.; Menchaca, L.; Rood, H.; Komerofsky, R. (2003). 「新しいアレル頻度データベース: http://www.allelefrequencies.net」. Tissue Antigens . 61 (5): 403– 407. doi :10.1034/j.1399-0039.2003.00062.x. PMID 12753660.