ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
HNRNPL 利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB
識別子 エイリアス HNRNPL 、HNRPL、hnRNP-L、P/OKcl.14、異種核リボ核タンパク質L 外部ID オミム ：603083; MGI : 104816; ホモロジーン : 1174; ジーンカード ：HNRNPL; OMA :HNRNPL - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） キリスト 7番染色体（マウス） [2] バンド 7|7 B1 始める 28,507,966 bp [2] 終わり 28,521,691 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） 上位の表現 心室帯 神経節隆起 甲状腺の左葉 甲状腺の右葉 腹部の皮膚 子宮体部 顆粒球 脚の皮膚 鼻粘膜の嗅覚領域 右卵管
上位の表現 網膜の神経層 性器結節 心室帯 胚の尾 精母細胞 胚葉上層 リップ 上前頭回 心内膜クッション 卵黄嚢
より多くの参照表現データ
バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能
タンパク質結合 プレmRNAイントロン結合 核酸結合 RNA結合 mRNA 3'-UTR結合 mRNA CDS結合 細胞成分
細胞質 リボ核タンパク質顆粒 細胞外エクソソーム 膜 核 核質 前核 細胞質 細胞質の核周囲領域 リボ核タンパク質複合体 生物学的プロセス
スプライソソームを介したmRNAスプライシング mRNA処理 RNA処理 RNA代謝プロセス スプライソソームを介した選択的mRNAスプライシングの制御 概日リズム アミノ酸飢餓に対する細胞反応 翻訳の積極的な規制 スプライソソームを介したmRNAスプライシングの負の制御 ペプチドへの反応 mRNA結合の正の調節 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ENSG00000104824 ENSG00000282947
ユニプロット RefSeq (mRNA) RefSeq（タンパク質） NP_796275 NP_001389864 NP_001389865 NP_001389866 NP_001389867 NP_001389868
場所（UCSC） 19章: 38.84 – 38.85 Mb 7章: 28.51 – 28.52 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
異種核リボ核タンパク質L は、 ヒトでは HNRNPL 遺伝子によってコードされる タンパク質 である。 [5] [6]
関数 mRNA 前駆体と成熟mRNAを含む 異種核RNA （hnRNA）は、特定のタンパク質と結合して異種リボ核タンパク質（hnRNP）複合体を形成する。異種核リボ核タンパク質Lは、hnRNP複合体と安定して結合しているタンパク質の1つであり、他のhnRNPタンパク質とともに、mRNAの形成、パッケージング、プロセシング、および機能に主要な役割を果たすと考えられる。異種核リボ核タンパク質Lは、HNRP複合体の一部として核質に存在する。HNRPタンパク質は核質外にも同定されている。mRNA結合タンパク質とhnRNPの交換は、mRNAを核から細胞質に輸送するのに伴います。HNRPタンパク質は 核 と 細胞質 の間を往復することが示されているため、細胞質での機能も有する可能性があります。この遺伝子には異なるアイソフォームをコードする2つの転写変異体が見つかっている。 [6]
相互作用 HNRNPL は以下と相互作用する ことが示されています 。
参考文献
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さらに読む
Dreyfuss G, Choi YD, Adam SA (1990). 「mRNA形成経路に沿ったリボ核タンパク質構造」. Endocr. Res . 15 (4): 441–74 . doi :10.3109/07435808909036348. PMID 2576798. Rasmussen HH, van Damme J, Puype M, et al. (1993). 「正常ヒト表皮角化細胞の2次元ゲルタンパク質データベースに記録された145種のタンパク質のマイクロシーケンス」. Electrophoresis . 13 (12): 960–9 . doi :10.1002/elps.11501301199. PMID 1286667. S2CID 41855774. Hahm B, Cho OH, Kim JE, et al. (1998). 「ポリピリミジントラクト結合タンパク質はHnRNP Lと相互作用する」. FEBS Lett . 425 (3): 401–6 . doi : 10.1016/S0014-5793(98)00269-5 . PMID 9563502. S2CID 4980318. Shih SC, Claffey KP (1999). 「低酸素状態における異種核リボ核タンパク質Lによるヒト血管内皮増殖因子mRNAの安定性制御」 J. Biol. Chem . 274 (3): 1359–65 . doi : 10.1074/jbc.274.3.1359 . PMID 9880507. Hamilton BJ, Nichols RC, Tsukamoto H, et al. (1999). 「hnRNP A2とhnRNP Lはグルコーストランスポーター1 mRNAの3'UTRに結合し、生体内で複合体として存在する」 Biochem. Biophys. Res. Commun . 261 (3): 646–51 . doi : 10.1006/bbrc.1999.1040 . PMID 10441480. Dias Neto E, Correa RG, Verjovski-Almeida S, et al. (2000). 「ORF発現配列タグを用いたヒトトランスクリプトームのショットガンシーケンシング」 Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 97 (7): 3491–6 . Bibcode :2000PNAS...97.3491D. doi : 10.1073/pnas.97.7.3491 . PMC 16267. PMID 10737800 . Kim JH, Hahm B, Kim YK, et al. (2000). 「核と細胞質間を移動するhnRNP間のタンパク質間相互作用」 J. Mol. Biol . 298 (3): 395– 405. doi :10.1006/jmbi.2000.3687. PMID 10772858. Shnyreva M, Schullery DS, Suzuki H, et al. (2000). 「2つの多機能タンパク質の相互作用：異種核リボ核タンパク質KとYボックス結合タンパク質」 J. Biol. Chem . 275 (20): 15498– 503. doi : 10.1074/jbc.275.20.15498 . PMID 10809782. 伊藤 正之、七条 聡、津田 暢、他 (2001). 「T細胞を介した膵臓癌細胞認識の分子基盤」. Cancer Res . 61 (5): 2038–46 . PMID 11280764. Kuninger DT, Izumi T, Papaconstantinou J, Mitra S (2002). 「ヒトAPエンドヌクレアーゼ1とhnRNP-LはAPエンドヌクレアーゼ1プロモーター内のnCaRE様リプレッサーエレメントと相互作用する」 Nucleic Acids Res . 30 (3): 823–9 . doi :10.1093/nar/30.3.823. PMC 100287 . PMID 11809897. Söderberg M, Raffalli-Mathieu F, Lang MA (2002). 「炎症は、異種核リボ核タンパク質（hnRNP）I/ポリピリミジン鎖結合タンパク質およびhnRNP Lと、マウス誘導性一酸化窒素合成酵素mRNAの3'非翻訳領域との相互作用を調節する」 Mol. Pharmacol . 62 (2): 423–31 . doi :10.1124/mol.62.2.423. PMID 12130696. S2CID 14855837. Hui J, Stangl K, Lane WS, Bindereif A (2007). 「HnRNP Lは可変長CAリピートに結合してeNOS遺伝子のスプライシングを促進する」 Nat. Struct. Biol . 10 (1): 33–7 . doi :10.1038/nsb875. PMID 12447348. S2CID 19057994. Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」 Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 . Costain WJ, Mishra RK (2003). 「PLGはラット線条体および前頭前皮質におけるhnRNP-Lの発現を制御する：ddPCRによる同定」. Peptides . 24 (1): 137–46 . doi :10.1016/S0196-9781(02)00286-3. PMID 12576095. S2CID 44677561. Hui J, Reither G, Bindereif A (2003). 「RNAの安定性におけるCAリピートとhnRNP Lの新たな機能的役割」. RNA . 9 (8): 931–6 . doi :10.1261/rna.5660803. PMC 1370459. PMID 12869704 . Gulesserian T, Engidawork E, Fountoulakis M, Lubec G (2004). 「胎児ダウン症候群における脳内Lupus Laタンパク質レベルの低下とU5小リボ核タンパク質特異的40 kDaタンパク質の増加」 Cell. Mol. Biol. (Noisy-le-grand) . 49 (5): 733–8 . PMID 14528909. 太田 剛志、鈴木 雄志、西川 剛志、他 (2004). 「21,243個の完全長ヒトcDNAの完全配列決定と特性解析」 Nat. Genet . 36 (1): 40–5 . doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039. Cheng J, Kapranov P, Drenkow J, et al. (2005). 「5ヌクレオチド分解能における10個のヒト染色体の転写マップ」. Science . 308 (5725): 1149–54 . Bibcode :2005Sci...308.1149C. doi :10.1126/science.1108625. PMID : 15790807. S2CID : 13047538.
