ヒトのタンパク質とコード遺伝子
| ホーマー3 |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オーソログ検索: PDBe RCSB |
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| 識別子 |
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| エイリアス | HOMER3、HOMER-3、VESL3、ホーマー足場タンパク質3、ホーマー足場タンパク質3 |
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| 外部ID | オミム:604800; MGI : 1347359;ホモロジーン: 37972;ジーンカード:HOMER3; OMA :HOMER3 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | キリスト | 8番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 8|8 B3.3 | 始める | 70,282,827 bp [2] |
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| 終わり | 70,294,361 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| 上位の表現 | - 小脳虫部
- 小脳の右半球
- C1セグメント
- 脾臓
- 太ももの筋肉
- 腓腹筋
- 迷走神経下神経節
- 子宮内膜間質細胞
- 神経節隆起
- 甲状腺の右葉
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| | 上位の表現 | - 小脳皮質
- 小脳葉
- 心室帯
- 卵黄嚢
- 小脳虫部
- 海馬歯状回顆粒細胞
- 網膜の神経層
- リップ
- 神経節隆起
- 胚
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| | より多くの参照表現データ |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- タンパク質C末端結合
- タンパク質結合
- タンパク質ドメイン特異的結合
- Gタンパク質共役グルタミン酸受容体結合
- 同一のタンパク質結合
| | 細胞成分 |
- 細胞の基底部
- 細胞接合
- シナプス後膜
- シナプス
- シナプス後密度
- 膜
- 細胞質
- 細胞質
- 細胞膜
- 細胞成分
- グルタミン酸作動性シナプス
- 樹状突起
- ニューロン投射
| | 生物学的プロセス |
- Gタンパク質共役グルタミン酸受容体シグナル伝達経路
- タンパク質標的化
- インターロイキン-2産生の負の調節
- カルシニューリン-NFATシグナル伝達カスケードの負の制御
- シナプス後神経伝達物質受容体の活性調節
- ストア作動性カルシウム流入の調節
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オーソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_001145721 NM_001145722 NM_001145724 NM_004838 |
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| RefSeq(タンパク質) | NP_001139193 NP_001139194 NP_001139196 NP_004829 NP_001139194.1
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NP_001139196.1 |
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| 場所(UCSC) | 19章: 18.93 – 18.94 Mb | 8章: 70.28 – 70.29 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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ホーマータンパク質ホモログ3は、ヒトではHOMER3遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6] [7]
関数
この遺伝子は、樹状タンパク質のHomerファミリーのメンバーをコードしています。このファミリーのメンバーは、グループ1代謝型グルタミン酸受容体の機能を制御します。コードされているタンパク質は、細胞増殖に関与している可能性があります。[7]
相互作用
HOMER3はTRPC1 [8]およびRYR1 [9]と相互作用することが示されている。
参照
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000051128 – Ensembl、2017年5月
- ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000003573 – Ensembl、2017年5月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ Soloviev MM, Ciruela F, Chan WY, McIlhinney RA (2000年2月). 「広範な選択的スプライシングによって生成された、構造的に異なる2つのヒトホーマー群の分子的特徴づけ」. Journal of Molecular Biology . 295 (5): 1185–200 . doi :10.1006/jmbi.1999.3436. PMID 10653696.
- ^ Tu JC, Xiao B, Yuan JP, Lanahan AA, Leoffert K, Li M, Linden DJ, Worley PF (1998年10月). 「Homerは新規プロリンリッチモチーフに結合し、グループ1代謝型グルタミン酸受容体とIP3受容体を連結する」. Neuron . 21 (4): 717–26 . doi : 10.1016/S0896-6273(00)80589-9 . PMID 9808459. S2CID 2851554.
- ^ ab "Entrez Gene: HOMER3 homer homolog 3 (Drosophila)".
- ^ Yuan JP, Kiselyov K, Shin DM, Chen J, Shcheynikov N, Kang SH, Dehoff MH, Schwarz MK, Seeburg PH, Muallem S, Worley PF (2003年9月). 「HomerはTRPCファミリーチャネルに結合し、IP3受容体によるTRPC1のゲーティングに必須である」. Cell . 114 (6): 777–89 . doi : 10.1016/S0092-8674(03)00716-5 . PMID 14505576. S2CID 10552676.
- ^ Feng W, Tu J, Yang T, Vernon PS, Allen PD, Worley PF, Pessah IN (2002年11月). 「Homerはリアノジン受容体1型チャネル複合体の増強を制御する」. The Journal of Biological Chemistry . 277 (47): 44722–30 . doi : 10.1074/jbc.M207675200 . PMID 12223488.
さらに読む
- Brakeman PR, Lanahan AA, O'Brien R, Roche K, Barnes CA, Huganir RL, Worley PF (1997年3月). 「Homer:代謝型グルタミン酸受容体に選択的に結合するタンパク質」. Nature . 386 (6622): 284–8 . Bibcode :1997Natur.386..284B. doi :10.1038/386284a0. PMID 9069287. S2CID 4346579.
- Xiao B, Tu JC, Petralia RS, Yuan JP, Doan A, Breder CD, Ruggiero A, Lanahan AA, Wenthold RJ, Worley PF (1998年10月). 「Homerはグループ1代謝型グルタミン酸受容体とHomer関連シナプスタンパク質の多価複合体との会合を制御する」Neuron . 21 (4): 707–16 . doi : 10.1016/S0896-6273(00)80588-7 . PMID 9808458. S2CID 16431031.
- Feng W, Tu J, Yang T, Vernon PS, Allen PD, Worley PF, Pessah IN (2002年11月). 「Homerはリアノジン受容体1型チャネル複合体の増幅を制御する」. The Journal of Biological Chemistry . 277 (47): 44722–30 . doi : 10.1074/jbc.M207675200 . PMID 12223488.
- Yuan JP, Kiselyov K, Shin DM, Chen J, Shcheynikov N, Kang SH, Dehoff MH, Schwarz MK, Seeburg PH, Muallem S, Worley PF (2003年9月). 「HomerはTRPCファミリーチャネルに結合し、IP3受容体によるTRPC1のゲーティングに必須である」. Cell . 114 (6): 777–89 . doi : 10.1016/S0092-8674(03)00716-5 . PMID 14505576. S2CID 10552676.
- 石黒 功、ザビエル R (2004年3月). 「Homer-3はEVH1ドメインを介してT細胞における血清応答エレメントの活性化を制御する」Blood . 103 (6): 2248–56 . doi : 10.1182/blood-2003-08-2671 . PMID 14645007.
- Cooper ST, Hanson IM (2006). 「PAX6と相互作用するタンパク質のスクリーニング:C末端変異はHOMER3、DNCL1、TRIM11との相互作用を阻害する」BMC Genetics . 6 43. doi : 10.1186/1471-2156-6-43 . PMC 1208879. PMID 16098226 .
- Schreiner D, Müller K, Hofer HW (2006年10月). 「ヒトプロトカドヘリンhFat1の細胞内ドメインはHomerシグナル伝達スキャフォールディングタンパク質と相互作用する」. FEBS Letters . 580 (22): 5295–300 . Bibcode :2006FEBSL.580.5295S. doi :10.1016/j.febslet.2006.08.079. PMID: 16979624. S2CID : 10267922.