HOXC5

ホメオボックスタンパク質Hox-C5は、ヒトではHOXC5遺伝子によってコードされるタンパク質である。^{[ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]}

HOXC5
識別子
エイリアス	HOXC5、CP11、HOX3、HOX3D、ホメオボックスC5
外部ID	オミム: 142973 ; MGI : 96196 ;ホモロジーン: 41296 ;ジーンカード：HOXC5 ; OMA : HOXC5 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 12番染色体（ヒト）[ 1 ] バンド 12q13.13 始める 54,033,050 bp [ 1 ] 終わり 54,035,361 bp [ 1 ]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 15番染色体（マウス）[ 2 ] バンド 15 F3|15 58.07 cM 始める 102,875,878 bp [ 2 ] 終わり 102,925,861 bp [ 2 ]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 生殖腺 左卵管 右卵巣 右卵管 左卵巣 眼底 胃の体 顆粒球 膝窩動脈 脛骨動脈 上位の表現 胸椎 胚の尾 上頸部神経節 尿道 男性尿道 食道 性器結節 神経管 胚 沿軸中胚葉 より多くの参照表現データ バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 DNA結合転写因子活性 配列特異的DNA結合 DNA結合 DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的 RNAポリメラーゼIIシス調節領域配列特異的DNA結合 DNA結合転写活性化因子活性、RNAポリメラーゼII特異的 転写因子活性、RNAポリメラーゼII遠位エンハンサー配列特異的結合 細胞成分 細胞接合 核 核質 生物学的プロセス RNAポリメラーゼIIによる転写の調節 多細胞生物の発達 転写の制御、DNAテンプレート 転写、DNAテンプレート 前後パターンの指定 胎児骨格系の発達 RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 3222 15424 アンサンブル ENSG00000172789 ENSMUSG00000022485 ユニプロット Q00444 P32043 RefSeq (mRNA) NM_018953 NM_175730 RefSeq（タンパク質） NP_061826 NP_783857 場所（UCSC） 12章: 54.03 – 54.04 Mb 15章: 102.88 – 102.93 MB PubMed検索 [ 3 ] [ 4 ]
ウィキデータ
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関数

この遺伝子はホメオボックス遺伝子ファミリーに属します。ホメオボックス遺伝子は、あらゆる多細胞生物の形態形成に重要な役割を果たす、高度に保存された転写因子ファミリーをコードしています。哺乳類は、異なる染色体上に位置し、縦列に並んだ9～11個の遺伝子からなる、類似したホメオボックス遺伝子クラスターを4つ持っています。この遺伝子 HOXC5 は、 12番染色体上のクラスターに位置する複数のホメオボックス HOXC 遺伝子の1つです。3つの遺伝子 HOXC5、HOXC4、HOXC6は、5' 非コードエクソンを共有しています。転写産物には、遺伝子特異的エクソンにスプライスされた共有エクソンが含まれる場合もあれば、遺伝子特異的エクソンのみが含まれる場合もあります。HOXC5 については、選択的スプライス変異体が2つ記載されています。共有エクソンを含む転写変異体は、明らかにタンパク質をコードしていません。タンパク質をコードする転写変異体には遺伝子特異的なエクソンのみが含まれる。^{[ 7 ]}

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000172789 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000022485 – Ensembl、2017年5月
3. 「ヒトPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. McAlpine PJ, Shows TB (1990年7月). 「ヒトホメオボックス遺伝子の命名法」. Genomics . 7 (3): 460. doi : 10.1016/0888-7543(90)90186-X . PMID 1973146 . 
6. Scott MP (1992年11月). 「脊椎動物ホメオボックス遺伝子命名法」. Cell . 71 (4): 551–3 . doi : 10.1016/0092-8674(92)90588-4 . PMID 1358459. S2CID 13370372 .  
7. 「Entrez遺伝子：HOXC5ホメオボックスC5」。

さらに読む

• Arcioni L, Simeone A, Guazzi S, Zappavigna V, Boncinelli E, Mavilio F (1992年1月). 「ヒトホメオボックス遺伝子HOX3Dの上流領域は、レチノイン酸およびHOXホメオタンパク質による制御の標的である」 . The EMBO Journal . 11 (1): 265–77 . doi : 10.1002/j.1460-2075.1992.tb05049.x . PMC  556447. PMID  1346761 .
• アカンポーラ D、デスポジート M、ファイエラ A、パンネーゼ M、ミリアッチョ E、モレッリ F、ストルナイウオーロ A、ニグロ V、シメオネ A、ボンチネッリ E (1989 年 12 月)。「ヒトHOX遺伝子ファミリー」。核酸研究。17 (24): 10385–402 .土井: 10.1093/nar/17.24.10385。PMC  335308。PMID  2574852。
• ボンチネッリ E、アカンポーラ D、パンネーゼ M、デスポジート M、ソンマ R、ガウディーノ G、ストルナイウオーロ A、カフィエロ M、ファイエラ A、シメオネ A (1990)。 「ヒトクラスIホメオボックス遺伝子の構成」。ゲノム。31 (2): 745–56 .土井: 10.1139/g89-133。PMID  2576652。
• Rabin M, Ferguson-Smith A, Hart CP, Ruddle FH (1986年12月). 「ヒトおよびマウスの相同染色体上にマッピングされた同族ホメオボックス遺伝子座」 .米国科学アカデミー紀要. 83 (23): 9104–8 . Bibcode : 1986PNAS...83.9104R . doi : 10.1073/pnas.83.23.9104 . PMC  387083. PMID  2878432 .
• Simeone A, Pannese M, Acampora D, D'Esposito M, Boncinelli E (1988年6月). 「12番染色体上の少なくとも3つのヒトホメオボックスは同じ転写単位に属する」 . Nucleic Acids Research . 16 (12): 5379–90 . doi : 10.1093/nar/16.12.5379 . PMC  336773. PMID  2898768 .
• Guazzi S, Lonigro R, Pintonello L, Boncinelli E, Di Lauro R, Mavilio F (1994年7月). 「甲状腺転写因子1遺伝子はHoxタンパク質による制御の候補標的である」 . The EMBO Journal . 13 (14): 3339–47 . doi : 10.1002/j.1460-2075.1994.tb06636.x . PMC  395231. PMID  7913891 .
• Apiou F, Flagiello D, Cillo C, Malfoy B, Poupon MF, Dutrillaux B (1996). 「ヒトHOX遺伝子クラスターの精密マッピング」.細胞遺伝学と細胞遺伝学. 73 ( 1–2 ): 114–5 . doi : 10.1159/000134320 . PMID  8646877 .
• 小崎 憲治, 小崎 亮, 鈴木 剛, 吉橋 秀次, 高橋 剛, 佐々木 憲治, 富田 正之, マクギニス W, 松尾 暢 (2002年2月). 「ヒトHOX遺伝子39種の完全変異解析パネル」.奇形学. 65 (2): 50– 62. doi : 10.1002/tera.10009 . PMID  11857506 .

外部リンク

• HOXC5+タンパク質、+ヒト、米国国立医学図書館医学件名表（MeSH）

この記事には、パブリック ドメインである米国国立医学図書館のテキストが組み込まれています。