ハロアルキュラ・マリスモルトゥイ

ハロアルキュラ・マリスモルトゥイ
科学的分類
ドメイン：	古細菌
王国：	メタノバクテリア
門:	メタノバクテリオタ
クラス：	ハロバクテリア
注文：	ハロバクテリア目
家族：	ハロアークラ科
属:	ハロアルキュラ
種：	H. マリスモルトゥイ
二名法名
	ハロアルキュラ・マリスモルトゥイ (ex Volcani 1940) Oren et al. 1990年

Haloarcula marismortuiは死海から分離された好塩性古細菌です。

形態学

ハロアルキュラ・マリスモルトゥイは、細胞径1.0～2.0μm（直径×長さ）のグラム陰性古細菌である。細胞は短桿体から長方形まで多様な形態を示す。ハロアルキュラ・マリスモルトゥイは古細菌を介して運動し、トリグリコシル、ジエーテル脂質、および糖タンパク質からなる細胞膜を有する。^{[ 2 ]}

代謝

H. marismortuiは、解糖系と改良エントナー・ドゥダロフ経路を利用して栄養素を分解する好気性化学有機栄養生物である。H . marismortuiは、グルコース、スクロース、フルクトース、グリセロール、リンゴ酸、酢酸、コハク酸などのエネルギー源を利用し、副産物として窒素、代謝炭素、酸を生成する。また、硝酸を電子受容体として利用することで嫌気的にも生育することができる。^[²^]

ゲノム特性

H. marismortuiのゲノムは9つの環状レプリコンで構成されており、個々のG+C含有量は54～62%の範囲で変化します。^{[ 3 ]} H. marismortuiには4,366個の遺伝子と4,274,642塩基対が含まれています（ATCC 43049株）。^{[ 4 ]}

H. marismortui は、これまでに結晶化された数少ない原核生物の大型リボソームサブユニットのうちの1つを有します。もう1つは、デイノコッカス・ラジオデュランスです。

生態学

生息地

ハロアルキュラ・マリスモルトゥイは高度好塩菌と考えられており、死海から分離されています。^{[ 3 ]}ハロアルキュラ・マリスモルトゥイの最適生育温度は40～50℃、pH範囲は5.5～8.0です。生育可能な塩化ナトリウム濃度は5～35%と広く、最適な生育濃度は15～25%です。^{[ 2 ]}ハロアルキュラ・マリスモルトゥイのゲノムには異常に多くの環境調節遺伝子が見つかっており、これは他のハロバクテリウム属細菌と比較して、極限環境への適応性が高いことを示唆しています。^{[ 3 ]}

適応性

H. marismortuiは、オプシンタンパク質「Sop I & II, Hop, Bop」を含む、センサーや調節因子として機能するマルチドメインタンパク質（49）の大規模なファミリーをコードしています。これらのタンパク質は、生理的イオン濃度の維持、光走性促進、そしてプロトン勾配による化学エネルギー生成に役立ちます。^[³^] H. marismortuiは、環境ストレス下で同様の機能を果たす100以上のエコパラログ（環境適応システムの維持に役立つ遺伝子）を有すると考えられています。複数の遺伝子が、温度制御（rrnA/B/C）と細胞運動（FlaA2 & FlaB）に関与することが発見されています。^[⁵^] H. marismortuiは、環境調節因子およびセンサーとして機能するマルチドメインタンパク質（49）の大規模なファミリーをコードしています。^[³^]これにより、H. marimortuiは非常に変化の激しい環境条件下で生存することができます。

高い環境適応性を持つH. marismortuiは、環境浄化に環境感覚遺伝子を利用する可能性を秘めた将来のバイオレメディエーション研究にとって理想的な候補です。^{[ 3 ]}

参考文献

^ "LPSN - 命名法に定められた原核生物の名前のリスト" . Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen 。2022-07-12に取得。
^ ^a ^b ^c Oren, Aharon (2014), Rosenberg, Eugene; DeLong, Edward F.; Lory, Stephen; Stackebrandt, Erko (eds.), "The Family Halobacteriaceae" , The Prokaryotes: Other Major Lineages of Bacteria and The Archaea , Berlin, Heidelberg: Springer, pp. 41– 121, Bibcode : 2014prok.book...41O , doi : 10.1007/978-3-642-38954-2_313 , ISBN 978-3-642-38954-2、 2021年11月17日取得{{citation}}: CS1 maint: ISBNによる作業パラメータ（リンク）
^ ^a ^b ^c ^d ^e ^f Baliga, Nitin S.; Bonneau, Richard; Facciotti, Marc T.; Pan, Min; Glusman, Gustavo; Deutsch, Eric W.; Shannon, Paul; Chiu, Yulun; Weng, Rueyhung Sting; Gan, Rueichi Richie; Hung, Pingliang (2004-11-01). 「Haloarcula marismortuiのゲノム配列：死海産好塩性古細菌」 . Genome Research . 14 (11): 2221– 2234. doi : 10.1101/gr.2700304 . ISSN 1088-9051 . PMC 525680. PMID 15520287 .
^ “Haloarcula marismortui” . NCBI 。2021年11月22日閲覧。
^シュトキン、アレクセイ S.;ピャティブラトフ、ミハイル・G。ガルジツカヤ、オクサナ V。ロドリゲス・バレラ、フランシスコ。フェドロフ、オレグ V. (2014-03-01)。「エコパラログとしての Haloarcula marismortui アーケリン遺伝子」。極限環境微生物。18 (2): 341–349。土井: 10.1007/s00792-013-0619-4。ISSN 1433-4909。PMID 24368632。S2CID 254084670。

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[LPSN-1] "LPSN - 命名法に定められた原核生物の名前のリスト" . Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen 。2022-07-12に取得。

[:02-2] Oren, Aharon (2014), Rosenberg, Eugene; DeLong, Edward F.; Lory, Stephen; Stackebrandt, Erko (eds.), "The Family Halobacteriaceae" , The Prokaryotes: Other Major Lineages of Bacteria and The Archaea , Berlin, Heidelberg: Springer, pp. 41– 121, Bibcode : 2014prok.book...41O , doi : 10.1007/978-3-642-38954-2_313 , ISBN 978-3-642-38954-2、 2021年11月17日取得{{citation}}: CS1 maint: ISBNによる作業パラメータ（リンク）

[:1-3] ^ ^a ^b ^c ^d ^e ^f Baliga, Nitin S.; Bonneau, Richard; Facciotti, Marc T.; Pan, Min; Glusman, Gustavo; Deutsch, Eric W.; Shannon, Paul; Chiu, Yulun; Weng, Rueyhung Sting; Gan, Rueichi Richie; Hung, Pingliang (2004-11-01). 「Haloarcula marismortuiのゲノム配列：死海産好塩性古細菌」 . Genome Research . 14 (11): 2221– 2234. doi : 10.1101/gr.2700304 . ISSN 1088-9051 . PMC 525680. PMID 15520287 .

[4] “Haloarcula marismortui” . NCBI 。2021年11月22日閲覧。

[5] シュトキン、アレクセイ S.;ピャティブラトフ、ミハイル・G。ガルジツカヤ、オクサナ V。ロドリゲス・バレラ、フランシスコ。フェドロフ、オレグ V. (2014-03-01)。「エコパラログとしての Haloarcula marismortui アーケリン遺伝子」。極限環境微生物。18 (2): 341–349。土井: 10.1007/s00792-013-0619-4。ISSN 1433-4909。PMID 24368632。S2CID 254084670。

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