| ハロクアドラタム | |
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科学的分類 
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| ドメイン： | 古細菌 |
| 王国： | メタノバクテリア |
| 門: | メタノバクテリオタ |
| クラス： | ハロバクテリア |
| 注文： | ハロフェラ目 |
| 家族： | ハロフェラ科 |
| 属: | Haloquadratum Burns et al. 2007年 |
| タイプ種 | |
| ハロクアドラタム・ウォルスビイ バーンズら 2007
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| 種 | |
ハロクアドラタム（一般略称： Hqr.）は、ハロフェラカセ科に属する古細菌の属である。 [1]このグループで最初に同定された種であるハロクアドラタム・ウォルスビーは、その細胞が四角く平らな箱のような形をしているという点で珍しい。 [2]
この好塩性 古細菌は、1980年にAEウォルズビーによってエジプトのシナイ半島の沿岸高塩分プール（サブカ）であるガビッシュサブカ[3]で発見されましたが、2004年まで培養されていませんでした。[4]
細胞には通常、ポリヒドロキシアルカン酸（PHA）顆粒と、水環境で浮力を提供し、集光を最大限にするために細胞を配置するのに役立つ、屈折性のガス充填 液胞が多数含まれています。[5]細胞は他の細胞と結合して、最大40マイクロメートル幅の脆弱なシートを形成することがあります。
H. walsbyiは高塩分水域のどこにでも生息します。[6]海水が蒸発すると、炭酸カルシウムと硫酸カルシウムが高濃度に沈殿し、塩化ナトリウムを豊富に含む高塩分海水となります。さらに蒸発すると塩化ナトリウム、すなわち岩塩が沈殿し、にがりと呼ばれる高濃度の塩化マグネシウム海水となります。岩塩形成の最終段階、つまり塩化マグネシウムの濃縮によって海水が無菌状態になる前に、H. walsbyiは繁殖し、海水バイオマスの80%を占めることもあります。
説明と意義
H. walsbyiは、 1980年にAE Walsbyによってエジプトのシナイ半島沿岸の塩水プールであるガビッシュ・サブカで初めて発見され、 2007年にBurnsらによって正式に記載されました。[4]この生物は、非常に薄い（約0.15μm）四角形の構造で注目されました。実験室での培養は2004年まで行われていませんでした。
ゲノム構造
H. walsbyiのゲノムマッピングが完了し、この生物の系譜と分類、そして生態系における役割についての理解が深まりました。[7]スペインとオーストラリアの分離株（HBSQ001株とC23 T株）のゲノム比較は、両者の類似性が非常に高く、遺伝子配列（シンテニー）が維持されていることから、急速な世界的拡散を強く示唆しています。[8]
細胞構造と代謝
H.walsbyiは独特な細胞形状を持ち、最もよく知られている特徴は極めて薄い四角形です。細胞内にはガス胞と呼ばれる屈折体が豊富に存在し、ガスで満たされた液胞は浮力を与え、水柱内で浮力を維持します。個々の四角形細胞は互いに結合して大きなシートを形成し、その厚さは40μmにも達します。このシートは非常に脆く、細胞間の接続は容易に切断されます。
その代謝様式は完全には解明されていないが、完全な遺伝情報が研究者に必要な洞察を与えるだろう。
生態学
H. walsbyiはエジプトの塩水プールで初めて発見され、採取されましたが、世界中の高塩分水域で発見されています。これらのプールでは水が蒸発すると高濃度の塩分が残り、H. walsbyiにとって最適な生育環境となります。Bolhuisらによると、「この意味で、H. walsbyiは知られている中で最も好塩性が高い生物です。マグネシウム塩（にがり）のさらなる濃縮は塩水の無菌化につながるからです。」生態系におけるH. walsbyiの正確な役割は未だ解明されていませんが、その独特な形態から、H. walsbyiについてより深く理解することで、古細菌の進化と形態的適応に関する知見が得られることは間違いありません。
参照
参考文献
- ^ NCBIのHaloquadratumに関するウェブページを参照。データは「NCBI分類リソース」から抽出。国立生物工学情報センター。2007年3月19日閲覧。
- ^ Stoeckenius W (1981年10月1日). 「ウォルズビーの正方細菌：直交原核生物の微細構造」. J. Bacteriol . 148 (1): 352–60 . doi :10.1128/JB.148.1.352-360.1981. PMC 216199. PMID 7287626 .
- ^ Walsby, AE (1980). 「四角い細菌」. Nature . 283 (5742): 69– 71. Bibcode :1980Natur.283...69W. doi :10.1038/283069a0. S2CID 4341717.
- ^ ab Burns, DG; Janssen, PH; Itoh, T.; Kamekura, M.; Li, Z.; Jensen, G.; Rodriguez-Valera, F.; Bolhuis, H.; Dyall-Smith, ML (2007). 「オーストラリアとスペインの塩田結晶化装置から分離された、ウォルズビー産の角張ったハロアーキア、Haloquadratum walsbyi gen. nov., sp. nov.」International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 57 (2): 387– 392. doi : 10.1099/ijs.0.64690-0 . PMID 17267984.
- ^ オーレン A、プリエル N、シャピロ O、シボニ N (2006)。 「塩田晶析池における正方形のガス空胞古細菌の自然群集における浮力の研究」。生理食塩水システム。2 : 4.土井: 10.1186/1746-1448-2-4。PMC 1459177。PMID 16613609。
- ^ Bolhuis H, Martín-Cuadrado AB, Rosselli R, Pašić L, Rodriguez-Valera F (2017年7月). 「Haloquadratum walsbyiのトランスクリプトーム解析：虚栄心は表面的なものだ」. BMC Genomics . 18 (1) 510. doi : 10.1186/s12864-017-3892-2 . PMC 5496347. PMID 28673248 .
- ^ J. Craig Venter Instituteの情報（2014年2月23日archive.today）
- ^ Dyall-Smith, ML; Pfeiffer, F.; Klee, K.; Palm, P.; Gross, K.; Schuster, SC; Rampp, M.; Oesterhelt, D. (2011). Lopez-Garcia, Purification (ed.). "Haloquadratum walsbyi: Limited Diversity in a Global Pond". PLOS ONE . 6 (6) e20968. Bibcode :2011PLoSO...620968D. doi : 10.1371/journal.pone.0020968 . PMC 3119063. PMID 21701686 .
さらに読む
- Burns DG, Camakaris HM, Janssen PH, Dyall-Smith ML (2004). 「ウォルズビー方形ハロアーキアの培養」FEMS Microbiol. Lett . 238 (2): 469– 73. doi :10.1016/j.femsle.2004.08.016. PMID 15358434.
- Oren A, Ventosa A (2000). 「国際細菌分類学委員会 ハロバクテリア科の分類に関する小委員会 議事録、1999年8月16日、オーストラリア、シドニー」Int. J. Syst. Evol. Microbiol . 50 (3): 1405–7 . doi : 10.1099/00207713-50-3-1405 . PMID 10843089.
- ギボンズ, NE (1974). 「Halobacteriaceae科 V. 新種」 . RE Buchanan; NE Gibbons (編). Bergey's Manual of Determinative Bacteriology (第8版). ボルチモア: The Williams & Wilkins Co. ISBN 0-683-01117-0。
外部リンク
- ゲノム配列
