| サルタープロウイルス | |
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| ウイルス粒子の構造 図 | |
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| 酢酸ウラニルでネガティブ染色したウイルス粒子の透過型電子顕微鏡写真。スケールバー＝100 nm。 | |
ウイルスの分類 
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| （ランク外）: | ウイルス |
| 家族： | ハルスピウイルス科 |
| 属: | サルタープロウイルス |
| 種 | |
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| 隔離場所:オーストラリア、ビクトリア州アバロンの塩田結晶化装置 | |
| 同義語 | |
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サルタープロウイルス
サルタープロウイルス His1
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ハルスピウイルス科は、サルタープロウイルス属（Salterprovirus）からなるウイルス科であり、この属はハロウイルスHis1（His1、 Salterprovirus australiense ）という1種のみから構成されています。このウイルスはオーストラリアの高塩分水から分離され、好塩性古細菌 Haloarcula hispanicaで培養されました。他の多くの古細菌と同様に、His1はほぼレモン型のウイルス粒子を有します。 [1] [2] [3] [4]
語源
科名のハルスピウイルス科（Halspiviridae）は、それぞれ生息地とウイルス粒子の形態に由来する、好塩性（ hal ophilic）と紡錘形（spindle -shaped）に由来する。属名のサルテルプロウイルス（ Salterprovirus ）は、直鎖状dsDNAゲノムの5'末端にタンパク質が結合していることに由来する、塩性末端タンパク質ウイルス（salty terminal protein virus）に由来する。[1]
分類学
ウイルス粒子は紡錘形の形態をしており、好熱性古細菌に感染するウイルスであるフセロウイルス科のウイルスと形状が類似しており、His1は当初、このグループに属する可能性が高いと説明された。[1]しかし、後に遺伝的関係はなく、複製戦略が全く異なることが判明したため、His1はハルスピウイルス科内のサルテルプロウイルス属という新しいグループに分類された。[5]ハルスピウイルス科は、これより上位の分類群には分類されていない。[6]
ナミブ塩田から得られた環境DNA配列は、 His1の現在認識されていない遠い親戚の存在を示している。 [7]
ガンマプレオリポウイルスHis2 （以下「His2」）と名付けられた別のウイルス種は、もともとHis1と関連があると考えられていましたが、[2] [3] 、その後のHis2ビリオンの分析により、この種は実際にはプレオリポウイルス科に属することが明らかになりました。[8]
構造
ウイルスはエンベロープに覆われ、リモニフォーム状または紡錘形の形態をしています。ゲノムは線状で、長さは約14.5kbです。ゲノムには35のオープンリーディングフレームがあります。[3] His1ウイルス粒子のネガティブ染色電子顕微鏡（EM）像は、このページの右側に示されています。粒子の長さには多少のばらつきがありますが（例えば、中央左側の例）、ほとんどのウイルス粒子は短い尾部を持つ典型的なリモニフォームカプシドを示しています。Hongら（2015）は高解像度の顕微鏡写真とクライオ電子顕微鏡（CREM）再構成画像を発表しており、[9]平均粒子径は92 x 40 nm、尾部の長さは12 nmであるとしています。
| 構造 | カプシド | ゲノム配列 | ゲノムセグメンテーション |
|---|---|---|---|
| リモニフォーム | タンパク質 | リニア | 一党制 |
複製サイクル
ウイルスの複製は細胞質内で起こる。宿主細胞への侵入は、ウイルスが宿主細胞に付着することによって達成される。His1の吸着速度定数は、Pietiläら（2013）によって実験的に1.9 x 10 −12 ml min −1と測定されている。[10]転写はDNAテンプレート転写によって行われる。Haloarcula hispanicaが宿主となる可能性がある。伝播は受動拡散によって起こる。[3]
| ホストの詳細 | 組織向性 | エントリー詳細 | リリースの詳細 | 複製サイト | 組立場所 | 伝染 ; 感染 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 古細菌：Haloarcula hispanica | なし | 注射 | 溶解性 | 細胞質 | 細胞質 | 受動拡散 |
ゲノム
| ゲノムサイズ | 14,464ヌクレオチド |
|---|---|
| 完成年 | 2020 |
His1の直鎖状dsDNAゲノムは14,464塩基対（bp）から構成され、105bpの不完全な逆方向末端反復配列を有し、35個のタンパク質コード遺伝子（タンパク質プライミングDNAポリメラーゼ（Bファミリー）を指定する遺伝子を含む）を担うとアノテーションされている。ゲノムの末端にはタンパク質が結合している。[2]
参考文献
- ^ abc Bath C、Dyall-Smith ML (1998 年 11 月)。 「His1、Haloarcula hispanica に感染するフセロウイルス科の古細菌ウイルス」。ウイルス学ジャーナル。72 (11): 9392–5 .土井:10.1128/JVI.72.11.9392-9395.1998。PMC 110367。PMID 9765495。
- ^ abc Bath C, Cukalac T, Porter K, Dyall-Smith ML (2006年6月). 「His1とHis2は遠縁の紡錘形ハロウイルスであり、新規ウイルス群サルタープロウイルスに属する」. Virology . 350 (1): 228–39 . doi :10.1016/j.virol.2006.02.005. PMID 16530800.
- ^ abcd "Viral Zone". ExPASy . 2015年6月15日閲覧。
- ^ 「ウイルス分類：2024年版」国際ウイルス分類委員会. 2025年3月28日閲覧。
- ^ Adriaenssens EM, Sullivan MB, Knezevic P, van Zyl LJ, Sarkar BL, Dutilh BE, et al. (2020年5月). 「原核生物ウイルスの分類：ICTV細菌・古細菌ウイルス小委員会による2018-2019年最新情報」Archives of Virology . 165 (5): 1253– 1260. doi : 10.1007/s00705-020-04577-8 . hdl : 2381/43909 . PMID 32162068.
- ^ 「分類群の歴史：科：ハルスピウイルス科（2024年版、MSL #40）」国際ウイルス分類委員会。 2025年3月28日閲覧。
- ^ Adriaenssens EM、van Zyl LJ、Cowan DA、Trindade MI (2016 年 1 月)。 「ナミブ砂漠の塩田のメタウイルスミクス：塩古細菌サルタープロウイルスの新しい系統とssDNAウイルスの豊富な供給源」。ウイルス。8 (1): 14.土井: 10.3390/v8010014。PMC 4728574。PMID 26761024。
- ^ バンフォード DH、ピエティラ MK、ロイネ E、アタナソバ NS、ディエンストビア A、オクサネン HM (2017 年 12 月)。 「ICTV ウイルス分類プロファイル: プレオリポウイルス科」。一般ウイルス学ジャーナル。98 (12): 2916–2917。土井:10.1099/jgv.0.000972。PMC 5882103。PMID 29125455。
- ^ Hong C, Pietilä MK, Fu CJ, Schmid MF, Bamford DH, Chiu W (2015年2月). 「均一な尾部を持ちながら可変的なカプシド構造を持つレモン型ハロー古細菌ウイルスHis1」. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 112 (8): 2449–54 . Bibcode :2015PNAS..112.2449H. doi : 10.1073/pnas.1425008112 . PMC 4345568. PMID 25675521 .
- ^ Pietilä MK, Atanasova NS, Oksanen HM, Bamford DH (2013年6月). 「修飾されたコートタンパク質は、ハロアーキアウイルスHis1の柔軟な紡錘形ビリオンを形成する」. Environmental Microbiology . 15 (6): 1674–86 . Bibcode :2013EnvMi..15.1674P. doi :10.1111/1462-2920.12030. PMID 23163639.
外部リンク
- ウイルスゾーン：サルテルプロウイルス
- 国際ウイルス分類委員会（ICTV）
