ハルヴァリア

ハルヴァリア
	重要なハルヴァリア類のグループ。左上から時計回りに：水生菌類（卵菌類）、褐藻類（褐藻類）、珪藻類（珪藻類）、渦鞭毛藻類（ミオゾア）、繊毛虫類（繊毛虫類）、オパリナ類（ビギラ）。
科学的分類
ドメイン：	真核生物
クレード:	サール
クレード:	ハルヴァリア; ・キャバリエ＝スミス、2010年
ランク付けされていない系統群
	ストラメノパイル（ヘテロコンタ）; 歯槽骨;

原生生物の系統

ハルヴァリアは、アルベオラータ亜綱とストラメノパイル亜綱（異コンタ亜綱）を含む原生生物の分類群です。キャバリエ＝スミスは、このグループを「ハルヴァリア」ではなく「ハルバリア」と名付けることを初めて提唱しました。^[2]

2007年と2008年の解析により、ストラメノパイル類とアルベオラータ類は近縁であり、側系統群と考えられていたクロマルベオラータ類の縮退クレードを形成することが明らかになりました。この2つのクレードは、リザリア類（元々は6つの主要な真核生物群の1つ）とともに、 SARスーパーグループと呼ばれるクレードを形成しています。^[3]^[4]^[5]

2016年の系統ゲノム解析ではハルヴァリアに疑問が投げかけられ、新たなリザリアの配列データにより、アルベオラータがリザリアの姉妹群（R + A系統群を形成）である可能性が示唆され、ハルヴァリアを支持する根拠は、低分類群のサンプリングと長い枝分かれの誘引によるものである可能性が示唆された。^[6]

しかし、2021年以降の分析では、ハルバリアが確固たる系統群であることが支持されている。^[7]

サー

リザリア

ハルヴァリア

	ストラメノパイル

	歯槽骨

参考文献

^ Cavalier-Smith, Thomas (2017). 「クロミスタ界とその8門：ペリプラスチドタンパク質の標的化、細胞骨格とペリプラスチドの進化、そして古代の分岐を強調した新たな統合」. Protoplasma . 255 (1): 297–35 7. doi : 10.1007/s00709-017-1147-3 . PMC 5756292. PMID 28875267 .
^ Cavalier-Smith, Thomas (2010年6月). 「原生動物界とクロミスタ界、そして真核生物樹のエオゾア根源」. Biology Letters . 6 (3): 342– 345. doi :10.1098/rsbl.2009.0948. PMC 2880060. PMID 20031978 .
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^ Burki, F.; Shalchian-Tabrizi; Pawlowski, J. (2008年8月). 「系統ゲノム解析により、光合成性真核生物のほとんどを含む新たな「メガグループ」が明らかに」. Biology Letters . 4 (4): 366– 369. doi :10.1098/rsbl.2008.0224. PMC 2610160. PMID 18522922 .
^ Kim, E.; Graham, LE (2008年7月). 「EEF2解析はアーキプラスチダとクロマルベオラータの単系統性に疑問を投げかける」. PLOS ONE . 3 (7) e2621. doi : 10.1371/journal.pone.0002621 . PMC 2440802. PMID 18612431 .
^ He, D.; Sierra, R.; Pawlowski, J.; Baldauf, SL (2016年8月). 「多タンパク質データにおける長枝効果の低減により、AlveolataとRhizariaの密接な関係が明らかになる」. Molecular Phylogenetics and Evolution . 101 : 1– 7. doi : 10.1016/j.ympev.2016.04.033 . PMID 27132173.
^ Strassert, JF; Irisarri, I.; Williams, TA; Burki, F. (2021年3月). 「真核生物進化の分子タイムスケールと紅藻由来プラスチドの起源への影響」Nature Communications . 12 (1): 1879. doi :10.1038/s41467-021-22044-z. PMC 7994803. PMID 33767194 .

[8phyla-1] Cavalier-Smith, Thomas (2017). 「クロミスタ界とその8門：ペリプラスチドタンパク質の標的化、細胞骨格とペリプラスチドの進化、そして古代の分岐を強調した新たな統合」. Protoplasma . 255 (1): 297–35 7. doi : 10.1007/s00709-017-1147-3 . PMC 5756292. PMID 28875267 .

[pmid20031978-2] Cavalier-Smith, Thomas (2010年6月). 「原生動物界とクロミスタ界、そして真核生物樹のエオゾア根源」. Biology Letters . 6 (3): 342– 345. doi :10.1098/rsbl.2009.0948. PMC 2880060. PMID 20031978 .

[PhylogenomicsReshuffles-3] ビュルキ、F.シャルチアン・タブリジ; K.ミンゲ、M.他。 (2007 年 8 月)。「系統ゲノミクスは真核生物のスーパーグループを再編する」。プロスワン。2 (8) e790。土井：10.1371/journal.pone.0000790。PMC 1949142。PMID 17726520。

[Burki2008a-4] Burki, F.; Shalchian-Tabrizi; Pawlowski, J. (2008年8月). 「系統ゲノム解析により、光合成性真核生物のほとんどを含む新たな「メガグループ」が明らかに」. Biology Letters . 4 (4): 366– 369. doi :10.1098/rsbl.2008.0224. PMC 2610160. PMID 18522922 .

[KimGraham2008-5] Kim, E.; Graham, LE (2008年7月). 「EEF2解析はアーキプラスチダとクロマルベオラータの単系統性に疑問を投げかける」. PLOS ONE . 3 (7) e2621. doi : 10.1371/journal.pone.0002621 . PMC 2440802. PMID 18612431 .

[ReducingLongBranchAlveolataRhizaria-6] He, D.; Sierra, R.; Pawlowski, J.; Baldauf, SL (2016年8月). 「多タンパク質データにおける長枝効果の低減により、AlveolataとRhizariaの密接な関係が明らかになる」. Molecular Phylogenetics and Evolution . 101 : 1– 7. doi : 10.1016/j.ympev.2016.04.033 . PMID 27132173.

[AMolecularTimescale-7] Strassert, JF; Irisarri, I.; Williams, TA; Burki, F. (2021年3月). 「真核生物進化の分子タイムスケールと紅藻由来プラスチドの起源への影響」Nature Communications . 12 (1): 1879. doi :10.1038/s41467-021-22044-z. PMC 7994803. PMID 33767194 .