ヘリオロドプシン

ロドプシンファミリー

ヘリオロドプシンは、2018年にアリナ・プシュカレフがオデッド・ベジャ教授の研究室で発見したロドプシンファミリーです。^[1]この新しいヘリオロドプシンファミリーは、既知のタイプ1（微生物）およびタイプ2（動物）ロドプシンとは異なるタンパク質配列を有しています。また、ヘリオロドプシンは膜内で他のロドプシンとは逆の配向を示し、N末端が細胞内側、C末端が細胞外側を向いています。^[1]

ヘリオロドプシンは、オールトランス レチナールを発色団として利用し、膜を介したイオンポンプ作用は有さない。ヘリオロドプシンは世界中に分布しており、真核生物、原核生物、さらには一部のウイルスにも存在する。^{[1]広く分布しているにもかかわらず、ヘリオロドプシンは真正}グラム陰性細菌には存在しない。グラム陰性細菌では、微生物の周囲に適切な二重膜が存在する。ヘリオロドプシンの機能には、環境との直接的な相互作用が必要であると示唆されている。^[2]

ヘリオロドプシンの結晶構造は、ホモ二量体を形成し、網膜分子に向かう窓を持ち、細胞の外側に面した大きな細胞外ループを持つことを示唆している。 ^[3]^[4]^[5]

参考文献

^ abc プシュカレフ、アリーナ;井上圭一；ラロム、シャーリー。フローレス・ウリベ、ホセ。シン、マニッシュ。今野正恵;富田佐穂子；伊藤翔太;中村涼子。角田聡 P.アロン、フィロソフ（2018年6月）。「機能的メタゲノミクスを使用して発見された微生物ロドプシンの明確に豊富なグループ」。自然。558 (7711): 595–599。土井:10.1038/s41586-018-0225-9。ISSN 0028-0836。PMC 11128463。PMID 29925949。S2CID 49330919 。
^ Flores‐Uribe, José; Hevroni, Gur; Ghai, Rohit; Pushkarev, Alina; Inoue, Keiichi; Kandori, Hideki; Béjà, Oded (2019年6月). 「ヘリオロドプシンは二皮質（グラム陰性）細菌には存在しない：考察と活性への影響」 . Environmental Microbiology Reports . 11 (3): 419– 424. doi :10.1111/1758-2229.12730. ISSN 1758-2229. PMID 30618066. S2CID 58666386.
^ 志保谷渉;井上圭一；シン、マニッシュ。今野正恵;細島祥子山下敬太郎；池田健人樋口昭光；いずめ、たまき；岡崎紗絵;橋本正則（2019年10月）「ヘリオロドプシンの結晶構造」。自然。574 (7776): 132–136 .土井:10.1038/s41586-019-1604-6。ISSN 0028-0836。PMID 31554965。S2CID 202760270 。
^ コバレフ、K.;ヴォルコフ、D.アスタシュキン、R.アレクセーエフ、A.グシチン、I。ハロモレノ、JM。ロガチョフ、A.バランディン、T.ボルシチェフスキー、V。ポポフ、A.ブーレンコフ、G. (2019-09-12)。「ヘリオロドプシンファミリーに対する高解像度の構造的洞察」。bioRxiv 767665.doi : 10.1101 / 767665。
^ ルー、ヤン;周、X. エドワード。ガオ、シャン。王、那。夏、瑞雪。徐振美。レン、ユウ。シー、ユイン。王、光復。メルチャー、カルステン。徐、H. エリック (2020 年 1 月)。「ヘリオロドプシン 48C12 の結晶構造」。細胞研究。30 (1): 88–90 .土井: 10.1038/s41422-019-0266-0。ISSN 1001-0602。PMC 6951262。PMID 31879417。

[:0-1] プシュカレフ、アリーナ;井上圭一；ラロム、シャーリー。フローレス・ウリベ、ホセ。シン、マニッシュ。今野正恵;富田佐穂子；伊藤翔太;中村涼子。角田聡 P.アロン、フィロソフ（2018年6月）。「機能的メタゲノミクスを使用して発見された微生物ロドプシンの明確に豊富なグループ」。自然。558 (7711): 595–599。土井:10.1038/s41586-018-0225-9。ISSN 0028-0836。PMC 11128463。PMID 29925949。S2CID 49330919 。

[2] Flores‐Uribe, José; Hevroni, Gur; Ghai, Rohit; Pushkarev, Alina; Inoue, Keiichi; Kandori, Hideki; Béjà, Oded (2019年6月). 「ヘリオロドプシンは二皮質（グラム陰性）細菌には存在しない：考察と活性への影響」 . Environmental Microbiology Reports . 11 (3): 419– 424. doi :10.1111/1758-2229.12730. ISSN 1758-2229. PMID 30618066. S2CID 58666386.

[3] 志保谷渉;井上圭一；シン、マニッシュ。今野正恵;細島祥子山下敬太郎；池田健人樋口昭光；いずめ、たまき；岡崎紗絵;橋本正則（2019年10月）「ヘリオロドプシンの結晶構造」。自然。574 (7776): 132–136 .土井:10.1038/s41586-019-1604-6。ISSN 0028-0836。PMID 31554965。S2CID 202760270 。

[4] コバレフ、K.;ヴォルコフ、D.アスタシュキン、R.アレクセーエフ、A.グシチン、I。ハロモレノ、JM。ロガチョフ、A.バランディン、T.ボルシチェフスキー、V。ポポフ、A.ブーレンコフ、G. (2019-09-12)。「ヘリオロドプシンファミリーに対する高解像度の構造的洞察」。bioRxiv 767665.doi : 10.1101 / 767665。

[5] ルー、ヤン;周、X. エドワード。ガオ、シャン。王、那。夏、瑞雪。徐振美。レン、ユウ。シー、ユイン。王、光復。メルチャー、カルステン。徐、H. エリック (2020 年 1 月)。「ヘリオロドプシン 48C12 の結晶構造」。細胞研究。30 (1): 88–90 .土井: 10.1038/s41422-019-0266-0。ISSN 1001-0602。PMC 6951262。PMID 31879417。