ヘリックス69

ヘリックス69は、リボソームの大サブユニットに含まれる19ヌクレオチドのヘアピンRNA構造です。^[¹^]リボソームは、サブユニット間ブリッジで結合した大サブユニットと小サブユニットで構成されています。ヘリックス69は小サブユニットのヘリックス44（h44）と相互作用し、リボソームで最も保存された領域の1つであるサブユニット間ブリッジB2aと呼ばれる2つのサブユニットの最大の界面を形成します。^[²^]ヘリックス69は、抗菌薬の優れた薬物標的であると提案されています。最近の多くの結晶構造は、このヘアピンがタンパク質翻訳プロセスのさまざまな段階に関与していることを示しています。細菌のヘリックス69を特異的に標的とすることで、細菌におけるタンパク質合成を停止させ、細菌を死滅させることができます。^[³^]

ヘリックス69は、系統発生を通して配列と二次構造の両方において高い保存性を示しています。H69のさらなる保存的特徴として、複数の擬似ウリジル化部位（大腸菌の番号では1911、1915、1917）の存在が挙げられます。これらの部位は大腸菌、ヒト、その他いくつかの生物にマッピングされています。^{[ 2 ]}

参考文献

^ Jiang J, Kharel DN, Chow CS (2015). 「シュードウリジン修飾によるヘリックス69変異体における構造変化の調節」 .生物物理化学. 200–201 : 48–55 . doi : 10.1016/j.bpc.2015.03.001 . PMC 4414897. PMID 25800680
^ ^a ^b Jiang J, Aduri R, Chow CS, SantaLucia J (2014年4月). 「大腸菌23SリボソームRNAのヘリックス69の擬似ウリジル化による構造調節」 . Nucleic Acids Research . 42 (6): 3971–81 . doi : 10.1093 / nar/gkt1329 . PMC 3973299. PMID 24371282 .
^ Bulkley D, Johnson F, Steitz TA (2012年3月). 「抗生物質テルモルビンはリボソームのサブユニット間橋B2aに結合してタンパク質合成を阻害する」 . Journal of Molecular Biology . 416 (4): 571–8 . doi : 10.1016/j.jmb.2011.12.055 . PMC 3336878. PMID 22240456 .

[pmid25800680-1] Jiang J, Kharel DN, Chow CS (2015). 「シュードウリジン修飾によるヘリックス69変異体における構造変化の調節」 .生物物理化学. 200–201 : 48–55 . doi : 10.1016/j.bpc.2015.03.001 . PMC 4414897. PMID 25800680

[:0-2] Jiang J, Aduri R, Chow CS, SantaLucia J (2014年4月). 「大腸菌23SリボソームRNAのヘリックス69の擬似ウリジル化による構造調節」 . Nucleic Acids Research . 42 (6): 3971–81 . doi : 10.1093 / nar/gkt1329 . PMC 3973299. PMID 24371282 .

[3] Bulkley D, Johnson F, Steitz TA (2012年3月). 「抗生物質テルモルビンはリボソームのサブユニット間橋B2aに結合してタンパク質合成を阻害する」 . Journal of Molecular Biology . 416 (4): 571–8 . doi : 10.1016/j.jmb.2011.12.055 . PMC 3336878. PMID 22240456 .

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