1952年、ハルトマンはフランクフルト大学物理化学研究所の所長に任命された。彼の研究は物理化学と理論化学のあらゆる分野に及んだ。分光学的研究では、X線、光学、赤外線、マイクロ波、NMRから質量分析まで、あらゆる利用可能な技術を駆使した。彼の研究対象には、ペプチドや有機ラジカルとの反応が含まれるほか、圧力と溶媒和の影響についても研究した。理論的研究において、ハルトマンは数値的第一原理計算よりも、厳密に解けるモデル(モデル量子化学)を重視した。彼の主著『化学結合の量子力学的理論』("Theorie der chemischen Bindung auf quantentheoretischer Grundlage")は1954年に出版された。彼は出版物や講演を通じて、ドイツにおける量子化学の発展に多大な影響を与えた。
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