ホロ菌門
菌類と一部の原生生物を含むクレード

ホロ菌門
時間範囲：中期オルドビス紀～現在 460–0  Ma
核虫
科学的分類 この分類を編集する
ドメイン： 真核生物
クレード： アモルフェア
クレード： 有核動物
クレード： オピストコンタ
クレード： ホロ菌類
Liu et al., 2009
グループ[1]
シノニム
  • ヌクレトマイセアブラウンら 2009 [2]
  • 完生菌類
  • 菌類

完生菌門[3]または核菌門は、完生虫門の姉妹門として、基底的な後生菌綱に属します。これは、鰓歯類と菌類界から構成されます。単細胞の自由生活性貪食性アメーバである核菌門[4]が完生菌門の最も初期の系統であるという位置づけは、動物と菌類が共通の単細胞祖先から独立して複雑な多細胞性を獲得し、浸透圧栄養性の生活様式（菌類の特徴の1つ）はこの真核生物系統の分岐の後期に起源を持つことを示唆しています。後生菌門は最近提唱された分類群で、無フェリド[5]、微胞子虫門、および隠微菌門の3つの内部寄生虫群を含みます。[6]

Rozella ( Cryptomycota ) は、キチンがライフサイクルの少なくともいくつかの段階で観察されている最も古く分岐した菌類の属です[6]。ただし、キチン質細胞壁(別の菌類の特徴) と浸透圧栄養性は、 BlastocladiomycotaとChytridiomycotaの共通祖先に由​​来し、これらの菌類は、遊走子期の鞭毛などの祖先の特徴をまだいくつか持っています[7]。特徴的な菌糸成長をする菌類のグループ、 Zoopagomycota、 Mucoromycotina、 Dikarya は、約 7 億年前の共通祖先に由​​来しています[7] 。 Zoopagomycota は主に動物や他の菌類の病原体であり、 Mucoromycotina は寄生虫、腐生生物、外生菌根菌などを含むより多様なグループです。 [6]ディカリアは子嚢菌門と担子菌門を含むグループで、記載されている菌類の約98%を占めています。 [7]この豊かな多様性のため、ディカリアには、菌糸または単細胞酵母（モデル生物であるサッカロミセス・セレビシエなど）から、キノコとして一般的に知られている複雑な多細胞菌まで、形態的に非常に異なるグループが含まれています。 [7]複雑な多細胞性を持つ動物や陸上植物とは対照的に、推定される系統関係は、菌類が子嚢菌門と担子菌門の進化の過程で複数回多細胞性を獲得したり失ったりした。 [8]

系統発生

系統樹は、フィリップ・シラー[9]の研究と「菌類：基礎および応用研究のための実験系としての菌類に関する包括的な論文」 [10] [11]に基づいて、菌類と他の生物との密接な関係を示しています。全菌類の系統樹は、テダーソーら[12] [13] [14]に従っています

後生菌類

参考文献

  1. ^ Adl, Sina M.; Simpson, Alastair GB; Lane, Christopher E.; Lukeš, Julius; Bass, David; Bowser, Samuel S.; Brown, Matthew W.; Burki, Fabien; Dunthorn, Micah; Hampl, Vladimir; Heiss, Aaron; Hoppenrath, Mona; Lara, Enrique; Le Gall, Line; Lynn, Denis H.; McManus, Hilary; Mitchell, Edward AD; Mozley-Stanridge, Sharon E.; Parfrey, Laura W.; Pawlowski, Jan; Rueckert, Sonja; Shadwick, Laura; Schoch, Conrad L.; Smirnov, Alexey; Spiegel, Frederick W. (2012). 「真核生物の改訂分類」. Journal of Eukaryotic Microbiology . 59 (5): 429– 514. doi :10.1111/j.1550-7408.2012.00644.x. PMC  3483872. PMID  23020233 .
  2. ^ Brown MW, Spiegel FW, Silberman JD (2009年12月). 「忘れられた細胞性粘菌Fonticula albaの系統発生は、Opisthokontaにおける重要な進化的分岐を明らかにする」Mol. Biol. Evol . 26 (12): 2699– 709. doi : 10.1093/molbev/msp185 . PMID  19692665.
  3. ^ リンデグレン、ローウェル (2001). デ・ルカ [ディ・ルカ]、セヴェロ. オックスフォード音楽オンライン. オックスフォード大学出版局.
  4. ^ ロペス＝エスカルド、デイビッド;ロペス・ガルシア、ピュリフィカシオン。モレイラ、デイビッド。ルイス・トリロ、イニャキ。トルエラ、ギフレ (2017-08-12)。 「Parvularia atlantis gen. et sp. nov.、核科フィロース アメーバ (ホロミコタ属、オピストコンタ属)」。真核微生物学ジャーナル。65 (2): 170–179。土井:10.1111/jeu.12450。ISSN  1550-7408。PMC 5708529。PMID  28741861。 
  5. ^ Karpov, Sergey; Mamkaeva, Maria A.; Aleoshin, Vladimir; Nassonova, Elena; Lilje, Osu; Gleason, Frank H. (2014). 「アフェリッド類（アフェリ上科、オピストコンタ亜科）の形態、系統発生、生態、および新上門オピストスポリディアの提案」. Frontiers in Microbiology . 5 : 112. doi : 10.3389/fmicb.2014.00112 . PMC 3975115. PMID  24734027 . 
  6. ^ abc Berbee, Mary L.; James, Timothy Y.; Strullu-Derrien, Christine (2017-09-08). 「初期分岐菌類：陸生生命の夜明けにおける多様性と影響」Annual Review of Microbiology . 71 (1): 41– 60. doi :10.1146/annurev-micro-030117-020324. PMID  28525299.
  7. ^ abcd Stajich, Jason E.; Berbee, Mary L.; Blackwell, Meredith; Hibbett, David S.; James, Timothy Y.; Spatafora, Joseph W.; Taylor, John W. (2009-09-29). 「菌類」. Current Biology . 19 (18): R840 – R845 . Bibcode :2009CBio...19.R840S. doi :10.1016/j.cub.2009.07.004. PMC 2913116 . PMID  19788875.  
  8. ^ Nguyen, Tu Anh; Cissé, Ousmane H.; Wong, Jie Yun; Zheng, Peng; Hewitt, David; Nowrousian, Minou; Stajich, Jason E.; Jedd, Gregory (2017-02-08). 「子嚢菌類における複雑な多細胞性をもたらすイノベーションと制約」Nature Communications . 8 14444. Bibcode :2017NatCo...814444N. doi :10.1038/ncomms14444. PMC 5309816. PMID  28176784 . 
  9. ^ サイラーP (2016).原生生物真核生物: 真核生物の起源、進化および微生物の生物学。ハル。 p. 462.ISBN​ 978-2-9555841-0-1。
  10. ^ Esser K (2014). The Mycota VII A: Systematics and Evolution (第2版). Springer. p. 461. ISBN 978-3-642-55317-2。
  11. ^ バス、デイビッド；チェコ、ルーカス；ウィリアムズ、ブライオニー AP；バーニー、セドリック；ダンソーン、ミカ；マヘ、フレデリック；トルエラ、ギフレ；ステンティフォード、グラント D.；ウィリアムズ、トム A. (2018-04-28). 「微胞子虫とクリプトマイコタの関係性の解明」Journal of Eukaryotic Microbiology . 65 (6): 773– 782. doi :10.1111/jeu.12519. ISSN  1066-5234 . PMC 6282948. PMID  29603494 
  12. ^ Tedersoo, Leho; Sánchez-Ramírez, Santiago; Kõljalg, Urmas; Bahram, Mohammad; Döring, Markus; Schigel, Dmitry; May, Tom; Ryberg, Martin; Abarenkov, Kessy (2018). 「菌類の高レベル分類と進化生態学的解析のためのツール」.菌類多様性. 90 (1): 135– 159. doi : 10.1007/s13225-018-0401-0 . hdl : 10138/238983 . ISSN  1560-2745.
  13. ^ ロペス・ガルシア、ピュリフィカシオン;ボルカー、エックハルト。セベ・ペドロス、アルナウ。バーンズ、ジョン。カルポフ、セルゲイA.モレイラ、デイビッド。グラウ＝ボヴェ、ザビエル。トルエラ、ギフレ (2018-08-17)。 「アフェリッドのような菌類の貪食性の起源」。bioRxiv 233882.doi : 10.1101 / 233882。
  14. ^ ガリンド、ルイス・ハビエル;トルエラ、ギフレ;ロペス・ガルシア、ピュリフィカシオン。チョバヌ、マリア。アナ・グティエレス・プレシアド。カルポフ、セルゲイA;デビッド・モレイラ (2023)。 「系統ゲノミクスはアブラムシと真菌の単系統性を裏付け、新しい分子のシナポモルフィィーを同定する」系統生物学。72 (3): 505–515。土井:10.1093/sysbio/syac054。PMID  35900180。
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