スロメガ
| HSRオメガ保存領域1 | |
|---|---|
 HSR-オメガ1の保存された二次構造 | |
| 識別子 | |
| シンボル | HSRオメガ1 |
| Rfam | RF01885 |
| その他のデータ | |
| RNA型 | 遺伝子 |
| PDB構造 | PDBe |
ショウジョウバエにおいて、発達的に活性で熱ショック誘導性のhsromega遺伝子（hsrω遺伝子）は、複数の長鎖非コードRNA転写産物を生成します。この遺伝子はショウジョウバエのほぼ全ての細胞種において転写活性を示し、熱ショック後に最も活発に誘導されます。1970年に93Dパフの発見につながったhsromega遺伝子のユニークな特徴は、ベンズアミドをはじめとする様々なアミドによって特異的に誘導されることです。
この遺伝子の複数の転写産物には、10kbを超える核転写産物hsromega-nと、スプライシング後に1.2kbの細胞質転写産物が生成される1.9kbの核転写産物が含まれる。10kbを超える核転写産物hsromega-nは、核質オメガスペックルを形成し、異種の核RNA結合タンパク質（hnRNP）やその他の特定のタンパク質が共局在する。オメガスペックルは、特定の時点で活発に関与していないhnRNPなどの貯蔵部位として機能することが示唆されている。[ 1 ]
この遺伝子のゲノム構造と、その大きな核内転写産物のhnRNP結合特性は、一次塩基配列が急速に分岐しているにもかかわらず、異なる種間で保存されている。熱ショックによりオメガスペックルは消失し、すべてのオメガスペックル関連タンパク質とhsrω-n転写産物が93D遺伝子座に蓄積する。hsrω-n転写産物は、hnRNP、Sxl、Hsp83、cAMP応答配列結合タンパク質（CBP）、ショウジョウバエアポトーシス阻害タンパク質1（DIAP1）、JNKシグナル伝達因子、プロテアソーム構成タンパク質、ラミンC、ISWI、HP1、ポリ（ADP）リボースポリメラーゼなど、様々なタンパク質の局在、安定性、活性に直接的または間接的に影響を及ぼす。この大きな核内非コードRNAは、多様な調節タンパク質と相互作用することから、細胞内の複数の調節ネットワークを統合するハブとして機能していると考えられる。[ 2 ] [ 3 ] [ 4 ]
参考文献
- ^ Prasanth KV, Rajendra TK, Lal AK, Lakhotia SC (2000年10月). 「オメガスペックル —ショウジョウバエにおける非コードhsr-omega RNAに関連するhnRNPsを含む新たな核スペックルクラス」 . Journal of Cell Science . 113 (19): 3485– 3497. doi : 10.1242/jcs.113.19.3485 . PMID 10984439 .
- ^ Mallik M, Lakhotia SC (2009年11月). 「発達的に活性でストレス誘導性の非コード遺伝子hsrωはショウジョウバエにおけるアポトーシスの新規制御因子である」 . Genetics . 183 (3): 831– 852. doi : 10.1534/genetics.109.108571 . PMC 2778980. PMID 19737742 .
- ^ Mallik M, Lakhotia SC (2010年4月). 「非コードhsrω転写産物のダウンレギュレーションに伴うCREB結合タンパク質、異種核リボ核タンパク質、およびプロテアソームの活性向上は、ハエモデルにおけるポリ(Q)病態の抑制に役立つ」 . Genetics . 184 ( 4): 927– 945. doi : 10.1534/genetics.109.113696 . PMC 2865928. PMID 20065067 .
- ^ Lakhotia SC (2011). 「 Drosophila melanogasterの93Dパフの40年」(PDF) . Journal of Biosciences . 36 (3): 399– 423. doi : 10.1007/s12038-011-9078-1 . PMID 21799254. S2CID 25229105 .
さらに読む
- Mallik M, Lakhotia SC (2009). 「大型非コードhsrω転写産物に対するRNAiはショウジョウバエモデルにおけるポリグルタミン病原性を抑制する」(PDF) . RNA Biology . 6 (4): 464– 478. doi : 10.4161/rna.6.4.9268 . PMID 19667761 .
- Akanksha, Mallik M, Fatima R, Lakhotia SC (2008年4月). 「ショウジョウバエの非コードhsrω遺伝子のhsrω 05241 アレルは、これまでの報告とは異なり、雄性不妊の原因ではない」(PDF) . Journal of Genetics . 87 (1): 87– 90. doi : 10.1007/s12041-008-0012-8 . PMID 18560179. S2CID 29997235 .
- Sengupta S, Lakhotia SC (2006). 「非コードhsromega遺伝子の発現変化はショウジョウバエにおけるポリQ誘導性神経毒性を増強する」(PDF) . RNA Biology . 3 (1): 28– 35. doi : 10.4161/rna.3.1.2559 . PMID 17114940 .
- Chowdhuri DK, Nazir A, Saxena DK (2001). 「3種類の塩素系農薬によるトランスジェニックショウジョウバエ（Drosophila melanogaster）のhsrωストレス遺伝子への影響」. Journal of Biochemical and Molecular Toxicology . 15 (4): 173– 186. doi : 10.1002/jbt.15.abs . PMID 11673846 .
- Lakhotia SC, Tapadia MG (1998年5月). 「 Drosophila melanogasterのhsrオメガ遺伝子座におけるアミド応答配列の遺伝子マッピング」Chromosoma . 107 (2): 127– 135. doi : 10.1007/s004120050288 . PMID 9601981 . S2CID 12219146 .
- Drosopoulou E, Konstantopoulou I, Scouras ZG (1996). 「ショウジョウバエmontiumサブグループにおける熱ショック遺伝子：染色体局在と進化的意義」Chromosoma . 105 (2): 104– 110. doi : 10.1007/BF02509520 . PMID 8753700. S2CID 11834159 .
- Jolly C, Lakhotia SC (2006). 「ヒトsat IIIとショウジョウバエhsrω転写産物：ストレス細胞における核RNAプロセシング制御の共通パラダイム」 . Nucleic Acids Research . 34 (19): 5508– 5514. doi : 10.1093/nar/ gkl711 . PMC 1636489. PMID 17020918 .
- Onorati MC, Lazzaro S, Mallik M, Ingrassia AM, Carreca AP, Singh AK, Chaturvedi DP, Lakhotia SC, Corona DF (2011年5月). 「ISWIクロマチンリモデラーはhsrω ncRNA含有オメガスペックル核内コンパートメントを組織化する」 . PLOS Genetics . 7 (5) e1002096. doi : 10.1371/journal.pgen.1002096 . PMC 3102753. PMID 21637796 .
- Mallik M, Lakhotia SC (2011年6月). 「ショウジョウバエにおける発達活性およびストレス誘導性の非コード遺伝子hsrωの誤発現による多面的影響」(PDF) . Journal of Biosciences . 36 (2): 265– 280. doi : 10.1007 / s12038-011-9061-x . PMID 21654081. S2CID 15352589 .
外部リンク
